摘要：以浐河西安段为研究区域,基于野外调查及三维荧光技术进行光谱分析,探究了城市河岸带土壤溶解性有机质结构特征及其来源。结果表明:综合荧光指数(FI)、生物源指数(BIX)均显示西安浐河土壤DOM具有较强的生物来源属性;经光谱分析,土壤DOM三维荧光光谱中出现了A、C和D等荧光峰,分别代表类富里酸、类腐殖酸和可溶性微生物代谢产物,且以腐殖质类物质为主(占55. 8-66. 7%),且荧光强度随土层深度增加呈下降趋势。相关分析表明,土壤SOC、p H、AP、NO-3-N等性质影响其DOM荧光特性;FI和BIX可综合表征DOM来源与结构组成。由因子特征分类分析表明,外源有机物的输入对表层20cm土壤DOM来源及其性质有主要影响,植被类型及根系作用对其亦有一定影响。

摘要：为了全面了解独特、珍稀植物黑果枸杞果实中简单重复序列的分布特征及分布规律,为西北特有的珍稀种质资源的保存及合理的开发和利用提供遗传学和分子生物学理论依据,本研究利用Illumina Hi Seq TM4000高通量测序平台对黑果枸杞进行RNA-seq测序,再通过专业数据分析MISA对测序所获得的Unigene进行SSR深入挖掘和特征分析。结果显示,黑果枸杞转录组测序共获得101 466条Unigenes,筛选搜索到含SSR位点的序列15 494条,共得到20 269个SSR,发生频率为19.98%。平均约每4 kb出现1个SSR位点。黑果枸杞SSR中主要重复单元类型为单碱基和二碱基重复,分别占SSR总数的74.83%和12.68%,在统计的46种重复类型中(C/G)n所占比例最高(14 652, 72.15%),其次是(AG/CT)n(1 195, 5.90%)、(AT/AT)n(3.72%)和(AC/GT)n(3.04%)。在SSR序列长度方面,长度变化范围最大的为三碱基重复(15~39 bp),其次是单碱基重复(10~32 bp),SSR位点的频率与分布长度呈负相关。黑果枸杞转录组中SSR位点分布频率较高,重复单元类型丰富,分布密度大,具有较高的特异性和多态性,为研究黑果枸杞的遗传多样性及分子标记辅助育种等方面提供可靠的理论依据。

摘要：利用454高通量测序技术对枣基因组进行部分测序。经序列拼接,共获得总长约为8.4 Mb的基因组序列,从中找到15 036个微卫星重复序列。其中六碱基重复类型的重复数目最丰富,共6 033个,占重复序列总数的40.1%;其次是复合型碱基2 707个和单碱基2 575个,分别占重复序列总数的18.0%和17.1%。另外,二碱基重复1 118个,三碱基1 050个,四碱基1 218个,五碱基335个,分别占重复序列总数的7.5%,7.0%,8.1%,2.2%。通过分析发现六碱基重复类型所占比例最多,但微卫星重复单元的重复次数变化却是二碱基微卫星显著高于其他各重复类型。在单碱基重复和二碱基重复这2种类型中,A/T以及AT/TA为最主要的重复单元;(AAN)n,(AAAN)n,(AAAAN)n和(AAAAAN)n为三碱基、四碱基、五碱基、六碱基重复类型中对应的优势重复单元,这些优势重复单元中富含A和T碱基。分析还发现,枣基因组微卫星长度变化的多样性与重复单元长度呈负相关(二碱基重复类型除外),这意味着枣基因组中重复单元较短的微卫星变异速率较快,而重复单元较长的微卫星变异速率较慢。对枣基因组微卫星侧翼序列分析发现,左侧序列与右侧序列GC含量相差不大;设计的引物序列中,有86%的引物可以特异扩增出含有SSR序列的位点。研究结果为枣的遗传研究提供丰富的序列信息和标记资源。