摘要：目的对湖南省既往人类免疫缺陷病毒-2(human immunodeficiency virus 2,HIV-2)抗体阳性者血清进行RNA核酸检测,以确定HIV-2感染。方法对2005—2019年湖南省HIV确证实验室保存的HIV-2抗体阳性血清样本进行核酸测序,采用自行设计的引物通过巢式PCR扩增HIV-2病毒核酸保守区gag基因片段(453 bp,HXB2620-1072),扩增产物测序并与HIV-2 gag基因参考序列比对判定。结果15份HIV-2抗体阳性血清样本中,13份(86.67%)HIV-2型核酸检测结果为阳性,2份未检出。13份HIV-2型核酸阳性样本中,gp36和gp105条带阳性率均为100.00%(13/13),gp41条带阳性率为92.30%(12/13),p51条带阳性率为69.23%(9/13),p31条带阳性率为84.62%(11/13)。结论通过核酸测序进一步验证湖南省已经存在HIV-2感染。

摘要：目的筛选合适的β-肌动蛋白(β-actin)引物以排除RNA样本中残存的DNA对人类基因表达分析的干扰。方法利用EMBL、PSEUDOGENE等生物信息数据库,寻找β-actin的假基因。同时自行设计和从国内外文献中筛选了众多β-actin引物。选用其中具有代表性的5对跨过内含子的引物,分别将基因组DNA、未经逆转录的RNA、cDNA作为模板,对这5对引物进行聚合酶链反应(PCR)扩增。结果生物信息学分析发现β-actin有37个假基因并且发现绝大多数的研究者所使用的引物都存在假基因干扰问题。当分别用DNA和cDNA作为模板时,5对引物中的1对跨过内含子的引物能扩增出大小不同的条带。结论使用该对引物能有效发现和排除RNA样本中所残存的DNA的干扰,令人类基因表达分析得出更准确的结果。