摘要：目的·建立急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)基因融合与突变知识库,以辅助临床基因检测。方法·通过对文献进行文本挖掘,收集ALL相关的基因融合与突变注释信息。基于NodeJS平台的Express框架和MySQL数据库系统的服务端开发环境,构建知识库服务网站。结果·通过对文献进行文本挖掘和人工手动矫正,共收集了246条ALL相关融合和突变基因词条,每项词条包含生物学性状、临床相关性解释、临床指导意见、靶向药物和化疗药物等多个生物学和临床相关条目,建立起一个便于管理的ALL相关知识库。结论·该知识库除了包含ALL相关或潜在相关癌症基因基本信息外,还着重整理了临床相关的注释信息,为ALL的临床基因检测及后续的精准医疗提供参考。

摘要：本研究探讨应用多重逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)筛查少见/难以识别的染色体易位患者的临床应用可行性。建立了3组多重RT-PCR以检测常规核型分析检出率较低的6种mll相关基因重排(mll/af10、mll/af17、mll/ell、mll/af9、mll/af6和mll/enl)和4种少见融合基因(dek/can、tls/erg、aml1/mds(evi1)和npm/mlf1)。结果表明:126例标本中共检测出11例阳性标本,涉及5种分子异常,其中10例为M5亚型(16.67%),1例为M4亚型(1.51%)。在这11例阳性标本中,2例患者核型分析见到标志染色体,1例患者仅有1个分裂相以致无法分析核型,其余8例用R-显带核型分析均未发现异常。结论:本研究设计的多重RT-PCR可便捷地、有效和准确地识别多种少见/难以发现的染色体易位。