摘要：文章旨在获得昆明犬PPARGC1A基因的编码区域cds序列,并对其进行生物信息学分析。根据Gen Bank中公布的序列设计一对特异性引物,采集昆明犬的肌肉组织提取总RNA,反转录成c DNA。以c DNA为模板进行RT-PCR扩增,并获得目的基因片段,将其插入载体,利用生物信息学软件对所获序列进行分析。试验成功克隆出昆明犬基因,cds长度为2 246 bp,共编码724个氨基酸序列。比对结果显示,昆明犬PPARGC1A基因与参考序列的同源性为100%。同源性比对结果昆明犬PPARGC1A基因的同源性与赤狐(登录号:XM025997319.1)、野牦牛(登录号:XM005897079.2)、牛(登录号:NM177945.3)、人(登录号:NM013261.5)、家鼠(登录号:NM008904.2)、卡氏小鼠(登录号:XM021162167.2)、欧亚野猪(登录号:NM213963.2)的同源性分别为99.6%、95%、95%、95.4%、91.7%、91.6%、95%。系统进化树分析发现,昆明犬与家犬的遗传距离最近,与小鼠遗传关系最远。PPARGC1A蛋白分子质量0971.82 ku,理论等电点p I为11.20。氨基酸组成亮氨酸Leu(L)占比最高,比例为11.3%。PPARGC1A蛋白不稳定性指数(Ⅱ)为59.16,这表明PPARGC1A基因编码蛋白质分类是不稳定的。脂肪指数为81.60,平均亲水系数(GRAVY)为-0.336,表明此蛋白亲水性差,脂溶性强。昆明犬PPARGC1A编码蛋白存在1个跨膜结构,二级结构预测昆明犬PPARGC1A蛋白中α螺旋、延伸链、β转角及无规则卷曲分别占28.04%、20.99%、6.77%、48.62%,三级结构与二级结构相一致。试验成功克隆出昆明犬PPARGC1A基因的编码区域cds序列,并对其进行生物信息学分析,为研究PPARGC1A基因对警犬的肌肉形成机理和产能等影响提供理论依据。

摘要：【目的】利用二代高通量测序技术获得金毛狗的转录组信息。【方法】金毛狗叶片总RNA经过提取、建库、测序和组装,获得单基因簇(Unigene)序列,再进行注释和分析,得到金毛狗转录组信息。【结果】共获得877918条金毛狗Unigene,平均长度为697.85 bp,N50为1262 bp。其中,33682条(38.37%)Unigene在数据库中获得功能注释,并与江南卷柏的序列相似度最高。分别有20379条和25246条Unigene在京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)数据库获得注释,包括代谢过程、刺激响应、生物调节、转运活性等。此外,4605条1000 bp以上Unigene经过卫星识别工具(MISA)进行简单重复序列(SSR)检测,共鉴定到6456个SSR位点,并使用Primer 3.0软件设计引物。【结论】金毛狗的转录组信息为其生物学过程、次生代谢通路和功能基因的挖掘提供了遗传资源信息,有利于其资源保护和开发利用。

摘要：目的:探究影响射波刀治疗脑动静脉畸形(arteriovenous malformation,AVM)的肿瘤靶区(gross tumor volume,GTV)和正常组织剂量分布的因素,分析不同直径的准直器对脑AVM剂量分布的影响,为脑AVM射波刀治疗计划的设计提供参考。方法:选取2015—2020年在某院经脑AVM栓塞术后接受射波刀治疗的12例脑AVM患者,根据GTV横断面长径的30%、40%、50%、30%+40%+50%选取不同尺寸的准直器,为每位患者制订4个不同的治疗计划,分别作为A组、B组、C组、D组。分析GTV形状和体积、准直器的大小对靶区剂量分布的影响,并对靶区外的剂量跌落情况进行分析。采用SPSS 20.0软件进行统计学分析。结果:GTV宽度、高度、体积和规则度对适形性指数、新适形性指数、几何适形性指数和治疗射野数的影响均有统计学意义(P<0.05)。C组与A组、B组和D组相比,GTV的最小剂量、中位吸收剂量、靶区覆盖率、靶区梯度指数和处方剂量线提高,GTV的适形性指数、新适形性指数、几何适形性指数及射波刀治疗计划的治疗机器跳数、治疗节点数和治疗射野数降低,且差异有统计学意义(P<0.05)。C组虽然靶区外20 mm以外正常组织的中位吸收剂量降低,但靶区外15 mm范围内正常组织的中位吸收剂量增大。结论:在射波刀治疗脑AVM时,根据GTV横断面长径的50%选取准直器可以实现更理想的剂量分布,同时提高射波刀治疗计划的执行效率。

摘要：上海世博会是第一次在发展中国家召开的以城市为主题,特别关注城市多种人文自然问题的综合性国际博览活动。作为以城市为研究、管理对象的城市规划学科,认真研究世博会规划运行各个阶段的经验、教训和启迪,对于大型展览、社会活动在城市中的健康运营有着重要意义。