摘要：根据不同长度或不同碱基序列的DNA片段的熔解温度(Tm)不同的原理,将酶切扩增多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)与熔解曲线(melting curve,MC)技术相结合,建立了CAPS-MC技术,从而实现SNP分子标记基因分型。通过菜薹‘L58’和紫菜薹‘ZCT095’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘Chiifu-401-42’的基因组序列)的比对,预测了719个HindⅢ内切酶识别碱基序列的SNP位点,并将其设计成CAPS-MC分子标记,从中随机选择10对标记进行体系建立与优化,结果显示本体系有灵敏度强、精准性高、快速、高通量、经济实用等优势。

摘要：针对辣椒缺乏稳定且高多态性的SNP标记问题,根据辣椒高密度遗传图谱和物理图谱的对应关系,以20 cM间距设计KASP标记,共设计了234对KASP引物。利用F2分离群体筛选获得具有多态性的引物159对,标记设计成功率67.9%。利用来自14个引种地的207份材料构成的辣椒群体,对引物进行了高通量体系转化和标记的多态性、稳定性验证。通过高通量基因分型体系对挑选出的141个标记进行多态性检测,其中130个KASP标记成功分型,成功率为92%,且在辣椒材料中具有多态性的标记数量变化范围为24~129个,对应的多态性位点百分率范围为18.46%~99.23%。试验开发了一组包含130个辣椒KASP标记,均匀分布在辣椒的12条染色体上,通过对国内的14个引种来源地辣椒品种的分型,证明了这套标记多态性高、普适性强,适用于辣椒品种的高通量基因分型。