摘要：为了解伊犁马携带病毒的类型,本研究利用高通量测序技术检测伊犁昭苏县142份伊犁马马驹鼻拭子样品。病毒组学分析显示,伊犁马马驹鼻拭子样品携带人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV),根据注释到的HCMV UL126基因序列,设计特异性引物,对样品进行PCR检测。结果显示,伊犁马马驹鼻拭子样品HCMV阳性率为7%(10/142),进一步调查显示伊犁马流产胎儿肺组织样品中该病毒阳性率为57%(53/93),表明该病毒感染伊犁马。另外,研究表明马场工作人员HCMV阳性率为37.5%(15/40),且大部呈HCMV阳性马驹和流产的妊娠母马都和HCMV阳性工作人员有密切接触史,提示马源HCMV可能来源人。核苷酸同源性分析显示本研究鉴定的马源和人源HCMV UL126基因的核苷酸序列同源性为99.6%~99.8%,与国外人源HCMV UL126基因的核苷酸序列同源性为97.8%~100%。遗传进化树分析显示本研究鉴定的HCMV与美国人源HCMV亲缘关系较近。本研究首次鉴定马源HCMV,为其致伊犁马流产防控和动物源HCMV流行病学调查奠定基础。

摘要：为了解新疆北疆地区旅游骑乘马携带人乳头瘤病毒(HPV)的类型,本研究利用高通量测序技术检测北疆伊犁地区52匹纯血马、昌吉市100匹纯血马和乌鲁木齐市30匹汗血马鼻拭子样品携带HPV的类型。病毒组学分析显示,马鼻拭子携带HPV 23型(HPV-23)。根据注释到的人源HPV-23 E2基因序列,设计特异性引物,对样品进行PCR检测并测序后分析HPV E2基因的同源性及遗传进化关系。结果显示,乌鲁木齐市汗血马鼻拭子样品HPV-23阳性率为16.7%(5/30),伊犁地区和昌吉市纯血马鼻拭子样品HPV-23阳性率分别为2%(1/52)、1%(1/100),表明旅游景区骑乘纯血马和汗血马携带HPV-23,携带病毒阳性率与马匹品种有关。马源HPV-23 E2基因与国外人源HPV-23 E2基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为98.2%~99.4%、95.5%~99.1%,与马乳头瘤病毒(EcPV)E2基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为44.2%~55.1%、18.2%~29.4%。遗传进化分析显示马源HPV-23与国外人源HPV-23亲缘关系较近,而与EcPV处于不同分支,提示马源HPV-23可能来源于人。本研究首次检测到马源HPV-23,并对其E2基因进行遗传进化分析,为动物源HPV-23的流行病学研究提供了参考依据。

摘要：乳头瘤病毒(PV)是人类和动物的一种重要病原体,具有严格的宿主特异性。已报道14种PV可以感染马,其中在我国新疆地区发现马携带马乳头瘤病毒1型(EcPV-1)、人乳头瘤病毒18型(HPV-18)和HPV-23。为进一步调查新疆地区马匹携带PV的类型,本研究利用高通量测序和病毒宏基因组学技术检测伊犁、昌吉3个规模化马场和乌鲁木齐1个马术俱乐部395份样品(205份鼻拭子、140份粪便样品及50份马流产胎儿肺组织样品)携带PV的类型。病毒组学分析显示,马可能携带HPV-115。根据注释到的HPV-115 E6基因序列,设计特异性引物,对所有马及人鼻拭子样品进行E6基因的PCR检测,结果显示,伊犁地区B场马鼻拭子样品中的HPV-115阳性率为7.3%(6/82),其他马场及马术俱乐部的纯血马和汗血马均为阴性,表明HPV-115可以跨种感染马。另外该病毒在B场马流产胎儿肺组织样品中的阳性率为46%(23/50),表明马感染HPV-115可能导致流产。进一步调查显示,HPV-115在马场工人和有阳性马场接触史的人群鼻拭子样品中的阳性率为59.5%(25/42),而无马匹接触史人员鼻拭子样品则呈阴性(0/20),表明该马源HPV-115有经马感染人的风险。同源性分析结果显示本研究测序获得的11株HPV-115 E6基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为99.0%~100%、98.1%~100%;与人源HPV-115参考株GC02 E6基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.4%~99.0%、97.1%~99.0%;与EcPV E6基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为32.4%~43.8%、34.6%~45.4%。E6基因的遗传进化分析显示本研究鉴定的11株马源和人源HPV-115形成独立进化分支。本研究首次报道HPV-115可能导致马流产,且其具备经马感染人的风险,该结果为马源HPV感染的防制提供了参考依据。