摘要：【目的】高地芽孢杆菌(Bacillus altitudinis)6ww6是一株根际耐盐促生菌,可以作为微生物肥料的优选菌种。为了加强菌种知识产权保护,建立菌株快速检测方法。【方法】本研究通过基因组比对分析、TBLASTn检索、NR库检索验证并剔除有其他同源的结果序列,最终得到菌株6ww6的孤儿基因,设计引物进行PCR鉴定。【结果】筛选出5个特异性基因J939_13195、J9319_05960、J9319_13355、J9319_05965和J9319_13350。引物5960F和5960R可以单一性扩增出菌株6ww6的目的基因J9319_05960,确定其为菌株6ww6的特异性分子标识。【结论】本研究确定了菌株6ww6的唯一性身份编码,建立了以比较基因组学和孤儿基因为基础的菌株水平上的鉴定方法。该方法具有快速、精确、能鉴定到菌株水平的优点,对于有价值微生物的知识产权保护提供了有力的抓手。

摘要：近年来,基于高通量测序技术对植物根际土壤微生物菌群结构的测定结果表明,土壤中绝大多数微生物难以通过传统的富营养培养基实现培养和分离。为进一步探索分离土壤中寡营养微生物的方法,结合多种培养因素,以土壤浸出液为基础培养基设计寡营养培养基分离土壤细菌菌株。并通过菌株的细胞形态、生理生化特征、16S rRNA和gyrB基因序列等对其中一株菌进行鉴定,同时对其蛋白酶与铁载体的产生能力进行检测以评价其在植物根际促生方面的应用潜力。利用土壤浸出液做培养基是有效分离土壤寡营养细菌的方法 ;编号为S35的菌株鉴定为嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia),具有蛋白酶和铁载体产生能力。采用的寡营养培养基可以分离获得在富营养培养基上不易分离的细菌,得到S. maltophilia S35菌株在植物促生方面具有一定的应用潜力。

摘要：本试验在温室盆栽条件下研究阴沟肠杆菌JP6菌株对烟株生长及植烟土壤养分、酶活和细菌群落多样性的影响。试验设计两个处理:对照组每株施用5 mL培养基,处理组每株施用5 mL JP6液体菌剂。研究结果显示:与对照相比,施用JP6菌株30 d的烟株株高极显著增加23.89%,最大叶表面积显著增加13.63%;施用JP6菌株60 d的烟株株高显著增加8.55%;采收后,JP6处理的茎和叶全氮、全磷含量显著增加;与对照相比,JP6处理的土壤中全氮、速效钾减少7.69%和12.77%;有效磷和有机质含量分别提高3.45%、11.95%;土壤过氧化氢酶、蔗糖酶、中性磷酸酶、酸性磷酸酶活性分别增加21.15%、39.25%、23.9%、15.2%。Illumina MiSeq高通量测序分析发现,施用JP6菌株影响了土壤细菌群落多样性,施用JP6和对照的烟株根际土壤中细菌种类分别为4297±92和4420±179个OTUs;施用JP6的烟株根际土壤中可比对出的特有细菌有17种,CK特有的细菌有5种;与对照相比,JP6的根际土壤中有11个与解磷相关的菌属相对丰度高于CK,其中固氮菌属(Azotobacter)、微小杆菌属(Exiguobacterium)为JP6组特有。研究表明,阴沟肠杆菌JP6菌株对烟株的生长具有促进作用,同时也能够改变土壤酶活性,引起根际土壤细菌菌群结构的变化,提高解磷/溶磷菌属的相对丰度。对JP6菌株在农业上的实际应用具有指导意义。