摘要：目的掌握2018年江西省食源性疾病病例的非伤寒沙门菌分离株的耐药特征、耐药表型与耐药基因之间的对应关系,评价全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)技术在耐药监测的应用前景。方法本研究以2018年江西省食源性疾病病例分离的58株非伤寒沙门菌为研究对象,用微量肉汤稀释法检测菌株对14种抗菌药物的耐药性,对58株非伤寒沙门菌进行WGS,拼接后的序列经过与ResFinder数据库比对,注释耐药基因。结果58株非伤寒沙门菌对四环素耐药率最高(77.59%,45/58),其次是氨苄西林(72.41%,42/58),对亚胺培南全部敏感。耐3类及3类以上抗生素的多重耐药菌株占56.90%(33/58),最高为6重耐药菌株占3.45%(2/58)。58株非伤寒沙门菌共筛选出47种11类耐药基因,喹诺酮耐药决定区(quinolone resistance-determining region,QRDR)存在gyrA、gyrB和parC基因突变。菌株对氨基糖苷类耐药基因携带率最高为100.00%(58/58),其次是四环素类耐药基因携带率为72.41%(42/58),大环内酯类耐药基因携带率最低为3.45%(2/58)。携带3类及3类以上耐药基因的菌株占77.59%(45/58),1.72%(1/58)菌株最高携带9类耐药基因。58株非伤寒沙门菌的药敏试验结果与检测出的已知耐药基因总体符合率达93.43%(611/654)。除喹诺酮类外,其他类别的抗生素耐药表型与耐药基因符合率均高于91%,部分种类的抗生素耐药表型与基因符合率达100%。结论非伤寒沙门菌耐药现象较为严重,其耐药表型与耐药基因有很高的一致性,WGS可作为预测沙门菌耐药性的有效手段。

摘要：为了建立一种基于不同靶基因的快速灵敏检测食品中产与不产呕吐毒素蜡样芽孢杆菌的荧光定量PCR方法,本研究采用煮沸法提取基因组DNA,用普通PCR方法验证引物的特异性,通过在米饭中添加不同浓度的产呕吐毒素蜡样芽孢杆菌模拟受污染的食品,采用本研究构建的荧光定量PCR方法对米饭进行检测。结果表明基于不同靶基因设计的两对引物具有特异性强和扩增效率高等优点,荧光定量PCR方法能对污染米饭中蜡样芽孢杆菌准确定量,检测限能达到101CFU/g。建立的荧光定量PCR方法特异、灵敏和准确,适用于食品中蜡样芽孢杆菌的快速定量检测。