摘要：为建立一种快速、敏感、特异的口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)分型鉴别诊断实时荧光RT-PCR(Fluorescence quantitative,FQ-PCR)检测方法,根据O、A、AsiaⅠ三种血清型FMDV保守基因序列,设计能够检测到FMDV的特异性通用检测引物和A型检测引物,以及不同荧光素标记的MGB探针。通过对PCR反应体系和反应条件的优化筛选,建立了FMDV通用型和A型二重实时荧光RT-PCR检测方法,并对该方法进行了特异性、敏感性、重复性试验;利用所建立的方法,对123份疑似FMDV感染的临床样品进行了检测。结果显示,建立的FMDV通用型、A型二重实时荧光RT-PCR检测方法在10~1～10~7拷贝/μL模板范围内有很好的线性关系;对pGEM-T/FMDV-T和pGEM-T/FMDV-A重组质粒出现阳性扩增信号,但对正常细胞培养物对照和其他7种病原对照未扩增出特异性曲线;自123份疑似FMDV感染样品中,检出10份FMDV-T阳性,6份FMDV-T/FMDV-A双阳性并且与基因测序结果一致。结果表明,本研究建立的FMDV通用型、A型二重实时荧光RT-PCR检测方法重复性好、敏感性高、特异性强,最低检测模板浓度为10拷贝/μL,可用于FMDV的快速分型检测,为FMDV的早期检测及临床诊断提供了新方法。

摘要：目的建立特异敏感的荧光定量PCR (FQ-PCR)方法,用于新型H7N9流感病毒的快速检测。方法针对GenBank中新型H7N9流感病毒(2016年以后)的血凝素基因和神经氨酸酶基因序列的保守区域分别设计两对特异性引物和两条探针,经优化反应条件,建立一种基于TaqMan MGB探针技术的FQ-PCR方法,验证方法的敏感性、特异性和稳定性,对2017年采集的临床疑似感染样品进行检测,并与普通PCR方法进行比较分析。结果本研究成功建立的新型H7N9FQ-PCR检测方法在101～106拷贝/μl模板范围内有很好的线性关系,所得相关系数为0.999;对人工合成的H7和N9基因出现阳性扩增信号,但对鸡传染性法氏囊病病毒、鸡传染性支气管炎病毒、H1N2、H3N2、H6N2、H9N2流感病毒等病原对照未出现扩增;批内、批间试验变异系数在0.02%～0.05%;对H7和N9的最低检测模板浓度均为10拷贝/μl,比普通PCR方法的灵敏度高100倍;自30份疑似样品中检出4份阳性样品,与国家禽流感参考实验室复核结果一致。结论本研究成功建立了H7N9流感病毒双重FQ-PCR检测方法,为禽相关临床样本的新型H7N9早期检测提供了特异、敏感、快速的方法。