摘要：随着研究的深入,从最初认为单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是导致遗传和表型多样性的主要原因,逐渐意识到插入/缺失(insertion/deletion,Indel)的普遍存在,并且与山羊生产繁殖性状密切相关。随着山羊参考基因组序列的公布及测序成本的降低,为大规模开发山羊Indels标记提供了可能。本研究就12个山羊个体(大足黑山羊,DBG,n=6;内蒙古绒山羊,IMCG,n=6)全基因组重测序结果,利用Samtools筛选群体间的差异In-dels。结果表明,12个山羊个体获得192.747GB基因组数据,平均每个个体检测到高质量的Indels位点为334 151个;比较基因组获得2个群体特有的Indels分别为110和100个,注释基因38和30个。其中大足黑山群体特有su-fu、sycp2位点和内蒙古绒山羊群体特有kdm4c位点可能是山羊生长繁殖相关候选Indel标记,为进一步精细解析山羊生产繁殖性状遗传机理奠定基础。

摘要：收集79窝(单羔,n=21,G1;双羔,n=47,G2;三羔,n=11,G3)大足黑山羊正常分娩后胎盘及繁殖性能数据,比较不同产羔类型胎盘子叶承载效率(窝初生重与子叶总面积之比)、子叶密度(子叶个数与胎盘质量之比)、子叶面积和子叶组织学结构、绒毛超显微结构,并且分析子叶性状和结构及其与繁殖性能的相关性。结果表明,大足黑山羊随产羔数增加,胎盘子叶承载效率和子叶总面积极显著增加(P0.05);由组织学结构观察发现,随着产羔数增加,胎盘子叶内血管数量增多,密度增大,绒毛形状变宽变大,密集程度增加,表面褶皱更丰富。相关性分析表明,产羔数和窝初生重与胎盘质量、子叶总面积、子叶承载效率呈极显著正相关(P<0.01)。研究发现山羊胎盘子叶面积与子叶承载效率相互联系;胎盘子叶组织结构及绒毛结构与山羊产羔数有显著性相关。