摘要：[背景]全球军团菌病发病率升高,人工水环境成为其暴发常见来源之一,而分子分型技术有助于预防和控制军团菌。[目的]了解上海市医院人工水环境中嗜肺军团菌的分子流行病学特征,为军团菌病的防控提供科学依据。[方法]于2019—2020年每年5—10月采集上海市14家医院人工水环境中水样,包括8家三甲医院,6家非三甲医院。共采集水样984份,包括312份冷却水、72份冷冻水和600份自来水。对水样进行嗜肺军团菌的分离培养和血清型鉴定并保藏,以嗜肺军团菌检出率作为污染状况指标。对保藏菌株进行复苏,得到81株存活菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型分析。[结果]共检出嗜肺军团菌水样124份,样本检出率12.60%,其中三甲医院检出率(16.54%,87/526)高于非三甲医院(8.08%,37/458)(χ^(2)=15.91,P <0.001)。不同类型水样之间冷却水的检出率(23.40%)最高,检出率的差异具有统计学意义(χ^(2)=61.19,P <0.001)。医院不同场所自来水检出率差异具有统计学意义(χ^(2)=11.37,P <0.05)。2019年的检出率(15.06%,75/498)高于2020年(9.84%,49/498)(χ^(2)=6.23,P <0.05)。5—10月中,8月的年平均检出率(16.46%)最高,10月的年平均检出率(8.54%)最低,不同月份之间检出率的差异无统计学意义(χ^(2)=5.39,P=0.37)。不同区之间的检出率差异具有统计学意义(χ^(2)=24.88,P <0.001)。共分离得到131株嗜肺军团菌,以血清型1型(80.15%,105/131)为主。对复苏存活的81株嗜肺军团菌进行PFGE分型,菌株条带相似性系数为41.30%~100%,分为29种PFGE带型(S1~S29),每种带型包括1~10株菌,S28为优势带型。聚类得到4个聚类簇(Ⅰ~Ⅳ),占所有菌株的66.67%(54/81),包含13个带型。[结论]上海市2019—2020年医院人工水环境中存在嗜肺军团菌持续污染,自来水中污染值得引起重视。检出嗜肺军团菌血清型以1型为主,PFGE分型揭示其存在基因多态性。因此,需加强医院人工水环境中嗜肺军团菌的监测及控制。

摘要：目的 基于监测网络对肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)成年人腹泻病例开展分子特征研究,探索流行病学对实验室技术和数据需求的实践模式.方法 以ETEC腹泻流行季节的成年人病例为对象进行流行病学设计和抽样,鉴定肠毒素型、血清群、耐药表型、定殖因子及分子型,通过多维度与多变量数据展示获得ETEC多个动态表型特征.结果 2016-2018年监测网络符合条件的ETEC病例84株.优势血清/毒素型依次为O:6(STh)、O:25(LT)、O:159(STh)、O:153 (STh),O:6(STh+CS21)取代O∶ 25和O∶ 159成为2018年的流行克隆,2017年的6例O:153(STh+CFA/I+CS8+PT34)为输入型暴发案例;成年人ETEC耐药率超过30%有磺胺异恶唑、萘啶酸、氨苄青霉素和阿奇霉素,多重耐药菌(MDR)达58.3%,血清/毒素型别提示弱毒株易形成MDR;分子分型证实O∶6血清群优势克隆(PT20~24)的遗传相似度超过O:25和O∶ 159,且与阿奇霉素最低抑菌浓度(MIC)和耐药基因mphA间存在高度相关性(87.5%,28/32),O∶6(STh+CS21 +mphA)耐药克隆始于2016年.结论 上海地区ETEC成年人腹泻病例新的流行克隆为O:6(STh+CS21+mphA),首次观察到阿奇霉素耐药基因mphA和ETEC某个血清群存在关联.基于流行病学构建的多维度和多变量分析技术,有助揭示ETEC潜在传播规律,达到精准监测和预警暴发目的.