摘要：主要运用常规和拉伸分子动力学模拟方法,研究β-淀粉样多肽的构象变化过程、乙酰胆碱酯酶和其抑制剂石杉碱甲的结合与解离过程,以及烟碱乙酰胆碱受体的离子门控构象变化过程,从而为老年痴呆症的病变机理,阐述和设计发现新的抗老年痴呆药物提供线索.

摘要：配体和受体之间的相互作用研究有助于阐明配体的作用机理,为合理药物设计提供线索.新发展的拉伸分子动力学模拟使原来在微秒至秒时间范围内发生的生物化学过程可以在纳秒尺度内进行模拟,从而动态再现目前实验所无法提供的配体与受体的结合或解离过程.文中通过详细介绍拉伸分子动力学方法对石杉碱甲与乙酰胆碱酯酶结合和解离过程以及HIV-1逆转录酶和其非核苷酸类似物抑制剂a-APA解离过程的成功模拟,综述拉伸分子动力学模拟在研究配体和受体相互作用中的应用.

摘要：基于片段的药物发现(fragment-based drug discovery,FBDD)是基于结构的药物研发方法的延伸,正日趋成熟,并在药物研发中发挥着重要的作用。该方法是通过SPR、MS、NMR、X-ray等生物物理方法快速筛选片段分子库,检测并发现分子量小、相对结合效率高的活性化合物,继之结合结构生物学研究进行分子优化设计,得到更为类药的先导和候选化合物,进行创新性药物开发。与传统高通量筛选等方法相比,FBDD具有十分显著的优点,发现的活性片段利于优化、获得的活性分子成药性高。本文结合实例综述了基于片段的药物发现方法的研究进展。