摘要：目的:评估QM/MM方法和Surflex-Dock分子对接程序对DNA-配体复合物模拟的准确性。方法:从蛋白质数据库(Protein Data Bank)下载DNA-配体复合物的三维结构,利用计算机辅助药物设计的分子对接程序Surflex-Dock模拟出147个诱饵化合物(decoys)并计算其结合分数(binding score)。然后将得出的分数与从QM/MM计算的结合能力以Z-score和辨别力(DP)作比较。从而评估Surflex-Dock和QM/MM的准确性。结果:Surflex-Dock的DPi值比QM/MM高,显示Surflex-Dock的辨别力较低。结论:因QM/MM计算速度慢,本研究认为Surflex-Dock可用作快速虚拟筛选,而较准确的QM/MM则适合用于对拥有较高结合分数的化合物进行再评分(rescoring)。

摘要：针对眼底图像,设计了一个糖尿病视网膜病变(Diabeticretinopathy,DR)分类系统,通过对视网膜血管图像进行定量分析来实现对DR病程的分类。采用Messidor数据集的眼底照片图像,这个数据集共包含100个研究项目,其中32张未患DR的眼底照片,24张患NPDR。根据数据集中DR患者和非DR人群的眼底图像以及眼科专家的分类结果,利用数字图像处理技术分析特征值的统计意义,判断该图像所反映的DR病程。预处理为提取特征值前的图像增强、主像素成分分析、匹配滤波以及Gabor滤波,对预处理后的图像进行直径、角度和分形维数等特征值提取。最终结果展示了直径、角度和分形维数的准确率达到了93%、96%、81.8%,提供有效的辅助诊断手段。糖尿病视网膜病变的特征值分析包括直径、角度和分形维数准确率较高。对于缺乏医疗条件的地区很有价值。