摘要：针对菜豆凝集素二聚体复合物的结构特征,利用计算机辅助药物设计的方法设计抑制剂以破坏复合物结构;进一步采用标准的Fomc保护氨基酸NT氨基的固相法合成纯化了小肽抑制剂.体外兔血红细胞凝集实验结果表明,该小肽对菜豆凝集素的凝血能力有一定的抑制效果.该方法为植物凝集素凝血研究及菜豆相关的食品安全问题提供了一个新思路.

摘要：蛋白质-RNA之间的相互作用是蛋白质在细胞里面行使功能的重要方式之一.结构生物学家利用实验手段可以得到蛋白质-RNA复合物的三维结构,通过原子水平的晶体结构来解释蛋白质与RNA的识别过程.但实验取得蛋白质-RNA的复合物结构非常困难,耗钱、耗时,同时受限于其相互作用强度.因而利用理论的方法对蛋白质-RNA相互作用界面进行预测与设计在生物医学研究中十分重要.本文主要综述了近期蛋白质-RNA相互作用界面预测与设计方面的进展,包括以下几个方面:(1)蛋白质-RNA分子对接算法以及对接前后存在的构象变化的处理;(2)蛋白质-RNA识别机制的研究;(3)基于蛋白质-RNA相互作用界面的分子设计.蛋白质-RNA分子对接算法逐步完善将有助于我们对大量未知功能的蛋白质与RNA进行功能注释,而基于生物大分子相互作用界面的分子设计将在药物设计领域中有广阔的应用前景.

摘要：蛋白质残基相互作用网络对理解蛋白质的结构特征,生物学功能和结合位点预测等研究有重要的作用.然而,现有的蛋白质残基相互作用分析方法易用性较差,需要下载和安装程序,较少提供友好易用的网络可视化功能,极大限制了蛋白质结构、功能和药物设计的相关研究.建立了蛋白质残基相互作用网络在线服务及可视化计算平台(http://***),用户不需要下载和编写程序,仅需上传蛋白质结构数据和口袋相关信息即可搭建蛋白质残基相互作用网络,并实现度中心度(degree centrality),接近中心度(closeness centrality)和中介中心度(betweenness centrality)等网络特征的计算.该计算平台可进一步实现蛋白质残基相互作用网络的可视化,分析蛋白质表面结合口袋的网络特性,对理解蛋白质结构和药物设计的相关应用研究有较大的帮助.

摘要：植物凝集素蛋白最早发现于19世纪,可特异性结合碳水化合物与糖分子。植物凝集素蛋白结合碳水化合物的高度特异性使我们可以将其作为生物工具应用到不同领域。例如,植物凝集素的重要特征之一就是可以特异性结合昆虫消化道表面的糖分子,从而起到抗虫的作用。植物凝集素也可以特异性结合癌细胞膜表面的糖分子,从而导致细胞凋亡或抑制肿瘤的生长。研究表明,仅豆科植物的凝集素分子表面就有大约40万个潜在的结合位点可以特异性结合不同的糖分子。因此,研究植物凝集素的结构特征信息对更好地理解植物凝集素的结构功能关系与应用有重要的意义。近年来,计算生物学的飞速发展使我们可以在分子层次上研究植物凝集素。本文主要从计算生物学角度综述植物凝集素的结构,序列保守性与动力学等研究现状,并以菜豆凝集素为例讨论植物凝集素的药物设计和医学应用。

摘要：导弹仿真研究是设计和改进导弹性能的一种重要手段。鉴于目前大多数文献都只给出了目标在二维平面内作平直飞行的理想追击情况,缺乏实用性,采用比例导引法,把三维追击轨道分解到两个二维平面上分别导引,并充分考虑到目标的机动性对弹道的影响,用MATLAB软件编写程序模拟出导弹实际追击的三维变轨弹道,绘制出分运动和合运动中各参数的变化曲线。最后比较了不同的追击速度和不同的导引系数k对弹道特性的影响,考虑到导弹实际飞行时受需用法向过载的制约,导出了导引系数k应满足的普遍公式,提出了对实战具有一定参考价值的建议。