摘要：目的:基于三代PacBio测序技术,建立中药灵芝和食用菌rRNA 18S-ITS-28S全长序列文库,从分子水平快速、准确鉴定和研究品种。方法:对收集到的8种食用菌和1种中药材真菌灵芝抽提基因组DNA,设计引物扩增18S-ITS-28S全长序列,18S-ITS-28S全长序列包括连续且完整的18S rRNA-ITS1-5.8S rRNA-ITS2和28S rRNA部分序列,其总长度>3.3 kb。将18S-ITS-28S全长序列进行建库和三代PacBio测序。结果:食用菌和药用灵芝的18S rRNA、5.8S rRNA及部分28S rRNA基因序列相似度高且序列保守,而rRNA基因间(ITS1和ITS2)的序列差异性大。结论:本研究的结果提示,分析rRNA基因间(ITSs)区域,而不是仅仅分析rRNA基因,有助于真菌类中药材的鉴定和研究。