摘要：为克隆兰州鲇(Silurus lanzhouensis)线粒体Cytb基因全序列,根据欧洲鲇(Silurus glanis)线粒体基因全序列设计特异引物进行兰州鲇线粒体Cytb基因的PCR扩增,得到1138 bp兰州鲇线粒体Cytb基因序列。对兰州鲇和其他13种鱼的线粒体Cytb基因核苷酸和氨基酸序列之间进行同源性比较,结果显示具有较高的同源性,核苷酸同源性介于61.38%—91.12%,氨基酸同源性介于76.62%—95.52%。对兰州鲇、欧洲鲇、大口鲇(Silurus meridionalis)、鲇(Silurus asotus)、越南鲇(Silurus cochinchinensis)的Cytb基因之间进行碱基替代分析,结果显示兰州鲇Cytb基因与鲇之间替换率最低,值为8.87%,转换/颠换值为3.21;与越南鲇之间替换率最高,值为14.41%,转换/颠换值为1.83。对本文克隆的兰州鲇Cytb基因与王庆容等测定的兰州鲇线粒体Cytb序列进行序列差异分析,结果显示两者之间替换率为11.16%,存在127个变异位点,转换/颠换比为4.08,遗传距离为0.1230。由NJ法基于兰州鲇和其他13种鱼的Cytb基因序列构建的系统进化树,结果显示与传统的分类地位基本吻合。

摘要：应用磁珠富集法构建兰州鲇（ Silurus lanzhouensis） CAG重复和GATA重复的微卫星文库，并分析其序列特征。兰州鲇基因组DNA经MseI酶切，选取200～800 bp的片段与生物素标记的探针（CAG）8和（GATA）6杂交，捕获到含有微卫星序列的目的DNA片段连接到pMD19-T载体，转化到大肠杆菌DH5α菌株中构建微卫星富集文库，经PCR检测筛选出阳性克隆进行测序。从126个阳性克隆中随机选取96个进行测序，获得59个微卫星序列（ GenBank登录号： KJ545973～KJ545998， KJ598088～KJ598120）。其中完美型31个（52.54％）、非完美型20个（33.9％）、混合型为8个（13.56％）。根据侧翼序列，成功设计48对引物，选取25对微卫星引物在10个个体进行扩增与多态性筛选，共获得10对多态性引物。结果表明，经优化的磁珠富集法能够高效地获得兰州鲇微卫星标记，这些标记将为兰州鲇种质资源保护、微卫星连锁图谱构建、经济性状的QTL定位及分子标记辅助选育奠定基础。

摘要：利用SSRHunter软件对现已公布的鲇形目（Siluriformes）中胡鲇科（Clariidae）和鲇科（Siluridea）共2002条EST（Expressed Sequence Tag）序列筛选兰州鲇（Silurus lanzhouensis）微卫星标记,并分析其序列丰度和分布特征。结果共发现209个微卫星序列,占整个ESTs数据库的10.44%;其中三碱基重复序列数量最多,占ESTs数据库中发现微卫星序列总数的35.62%;二、四、五、六碱基重复序列分别占微卫星序列总数的28.31%、25.57%、7.76%、2.74%。根据侧翼序列,设计125对引物,随机选取58对进行扩增鉴定及多态性筛选。结果显示29对引物能稳定扩增,16对引物具有多态性,每个位点等位基因数2-7个（平均3.75）,观测杂合度（Ho）0.133 2-0.732 2（平均0.405 1）,期望杂合度（He）0.198 2-0.848 3（平均0.560 2）,多态信息含量（PIC）0.124 1-0.794 5（平均0.506 5）。研究表明,借用已有鲇形目鱼类ESTs数据库筛选到的兰州鲇微卫星标记质量较好,可为兰州鲇种质资源保护、微卫星连锁图谱构建、经济性状的QTL定位及分子标记辅助育种奠定基础。