摘要：本试验的目的是采用高通量测序技术,研究北京动物园3只亚成体大熊猫肠道细菌的多样性,比较分析在其刚从成都回北京动物园饲养(14月龄)和饲养2个月后(16月龄)的粪便菌群差异,以及3只个体之间的差异。共采集新鲜粪便样品19份,提取DNA,然后用Illumina MiS eq平台测序分析。结果表明:3只亚成体大熊猫粪便细菌,在门水平上主要是变形菌门(Proteobacteria),平均占55.5%,厚壁菌门(Firmicutes)平均占42.5%;在属水平上,大肠志贺氏杆菌属(Escherichia shigella)平均占50.1%,狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)平均占13.8%,链球菌属(Streptococcus)平均占11.7%。在门到属的各级分类水平上,14月龄和16月龄的粪便菌群除了乳球菌属(Lactococcus)外,差异不显著(P>0.05);3只个体之间菌群差异不显著(P>0.05)。

摘要：对神农架保护区大龙潭保护站1只半野生病死川金丝猴的不同部位的肠道内容物进行了微生物多样性研究。在无菌条件下取十二指肠段、小肠段、盲肠段及大肠段4个部位的肠内容物,提取微生物基因组DNA,应用高通量测序技术,对细菌和真菌多样性进行了详细的分析,比较了不同部位肠道的细菌和真菌的丰度、分布、多样性及变化趋势等。发现该川金丝猴肠道细菌主要分属于厚壁菌门(Firmicutes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、变形菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和Synergistetes 7个门,真菌主要分属于子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、接合菌门(Zygomycota)以及未分类真菌(Fungi_unclassified)。细菌丰度最高的是盲肠段,细菌多样性最高的是大肠段,真菌丰度最高的是小肠段,真菌多样性最高的是大肠段。

摘要：探讨了鹿科6属动物主要组织相容性复合体dra(mhc-dra)第二外显子的变异特点,揭示其分子水平上的进化选择模式,并与cyt b进行了比较。采用测序法,获得鹿科6属动物dra第二外显子246 bp的序列。研究结果表明,多态性位点数18个,独立变异位点13个。mhc-dra第二外显子显示出较低的核苷酸变异,且6属有各自独特的变异位点。氨基酸序列中抗原结合位点共计20个。其中,鹿科6属动物的氨基酸位点63,驼鹿属氨基酸位点18,是不同于马属和人属的抗原结合位点,推测鹿科动物可能有着不同的抗原结合模式。根据非同义替代率(Ka)和同义替代率(Ks)比值的计算结果,表明鹿属mhc-dra第二外显子为正向选择,其余5属均为纯化选择。对mhcdra第二外显子及cyt b分别运用邻接法(NJ),最大似然法(ML)和贝叶斯推论(BI)进行系统发育重建得到相似结果,形成了旧世界鹿类与新世界鹿类的姐妹类群。麂亚科cyt b和mhc-dra第二外显子的基因型可能是鹿亚科与其它亚科之间的过渡型,而气候变化和环境变迁可能是推动mhc-dra第二外显子分化的潜在原因。