摘要：2009年4月以来,甲型H1N1流感席卷全球,给人类造成极大灾难。流感病毒基因组包含8个节段,节段间的重配导致其极强的变异能力。分析各节段来源对于新型流感的预防和治疗至关重要。基于基因组序列的统计特征,在VC++编程环境下设计程序,用邻近核苷酸单词频率(NWF)作为序列特征,对2009年的流感病毒基因组各节段起源进行分析。结果证实该法具有良好的性能;并分析得出2009年暴发的甲型H1N1流感病毒PB2和PA来源于北美禽流感,PB1来源于人的季节性流感病毒H3N2,HA、NP、NS来源于古典北美系猪流感病毒,而NA和M则与欧洲系的猪流感病毒相似。

摘要：选用了甲型流感病毒 10个毒株 (全序列 )和一个 2 0 0 4年越南毒株 (部分序列 ) ,采用自己编写的计算机程序sRNAFinder,对每个毒株的 6个RNA片段的 6个编码序列进行了siRNA设计 .结合系统发育重建方法 ,利用sRNAFind er的共有序列分析功能 ,对得到的 6 10 1个siRNA分子进行了计算机筛选 .结果表明 ,设计的siRNA的分子 ,针对np和pb1应该是最有效的 ,而针对ha和na的siRNA分子设计 ,需要疾病流行期毒株的最新测序数据 ;从ns1的数据不能获得很保守的、可作为预防或治疗药物的siRNA分子 .图 1表 4参

摘要：用自己编写的siRNA查找设计的程序sRNAFinder,对来自GenBank的 7个冠状病毒全基因组序列进行了siRNA的查找 ,并分析了各自的分布情况 .结果表明 ,ORF1ab、S、E、M和N这 5个主要基因中 ,候选siRNA占全基因组中所有候选siRNA的比例达到 90 %以上 .根据基因组结构特征 ,对SARS -CoV进行的siRNA分布分析表明 ,在全部 4 4 9个候选siRNA中 ,有 4 4 3个分布于orf1ab中 ,与基于RNAi原理的抗病毒药物设计思想相吻合 .表 8参

摘要：以高粱细胞质雄性不育系和保持系 A1Tx6 2 3 A/B,A2 V4 A/B为材料 ,考察了 Mg2 + ,Taq酶 ,d NTP,引物 ,模板等的用量、循环参数及不同的 PCR仪对随机扩增多态性 DNA(RAPD)反应的影响。结果发现 :在 2 5 μL体系中 ,Mg Cl2 2 .0 mmol/L,Taq酶 0 .75 U(1 U=1 μmol/min) ,d NTP0 .1 5mmol/L,引物 1 6 .5 ng,模板 3 0 ng,明胶 0 .0 0 1 % ,KCl5 0 mmol/L,Tris1 0 mmol/L(p H8.3 )为最佳反应混合物组合。对 Peltier Thermal Cycler 2 0 0而言 ,94℃预变性 5 min,94℃变性 1 min,3 5℃退火 1 min,72℃延伸 2 min,最后 72℃保温 5 min,共计 40个循环为最佳扩增条件 ;对 Perkin ElmerCetus DNA Thermal Cycler- 480而言 ,采用 94℃预变性 3 min后 ,前 3个循环 ,94℃变性 1 min,3 5℃退火 1 min,72℃延伸 2 min,后 3 7个循环 ,94℃变性 3 0 s,3 6℃退火 45 s,72℃延伸 1 min,最后72℃保温 5 min的循环程序可获得理想扩增。并阐述了优化 RAPD实验体系的设计原则。