摘要：统计与试验设计是生命科学研究的基础,对试验数据的整理、分析和判断以及试验设计的合理性、有效性均具有重要的作用。《畜牧生物统计附试验设计》是数理统计原理和方法在生命科学研究中的应用,为动物科学专业的学科基础必修课。本文以甘肃农业大学动物科学专业《畜牧生物统计附试验设计》的本科教学为例,从教材的选择、课程基本情况、教学内容、教学方法和教学效果评价及考核方式5个方面进行实践与探讨,旨在为动物科学专业《畜牧生物统计附试验设计》的本科教学提供参考。

摘要：克隆合作猪干扰素β(Interferon-beta,IFN-β)基因的编码区序列(Coding region sequence,CDS),预测分析其结构与功能。以NCBI/GenBank中猪IFN-β(登录号:NM_001003923.1)的序列设计特异性引物,通过TA克隆技术得到合作猪IFN-β基因完整CDS区,用生物信息学方法对其进行分析。结果表明,合作猪IFN-β基因CDS区全长561 bp,编码186个氨基酸,与参考序列相比,其编码区的第177位点处的C突变为T,为同义突变。分子质量约为21.95 ku,理论等电点(PI)为4.93,不稳定系数为62.91,平均疏水性为-0.172;二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,三级结构与二级结构预测基本一致。合作猪与巴马猪、梅山猪和疣猪IFN-β核酸序列的相似性为99.47%、99.82%和98.75%。进化树结果表明,合作猪与梅山猪亲缘关系最近。合作猪IFN-β属于干扰素ab超家族,是不稳定的酸性亲水性蛋白,含有信号肽和跨膜区。

摘要：旨在克隆合作猪干扰素ε(Interferon epsilon,IFN-ε)基因,并对其结构和编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步研究合作猪IFN-ε生物学功能提供参考。根据GenBank上公布的猪IFN-ε基因序列(登录号:NM_001105310.1)设计引物,PCR扩增及测序获得合作猪IFN-ε基因完整编码区序列(Coding sequence,CDS),并对其进行生物信息学分析。结果显示,合作猪IFN-ε基因编码区长582 bp,编码193个氨基酸。该基因编码区序列与杜洛克猪、人、小鼠、黑猩猩、狗、瘤牛、蒙古野马、山羊和绵羊的同源性分别为98.4%、77.7%、56.8%、78.2%、76.5%、87.0%、85.5%、85.0%和86.0%;系统进化树结果表明,合作猪与瘤牛、蒙古野马、绵羊、山羊亲缘关系较近。此外,在合作猪IFN-ε基因CDS上共发现3个碱基突变,均为错义突变。氨基酸序列分析表明,合作猪IFN-ε蛋白分子式为C 1027 H 1630 N 278 O 290 S 10,理论分子质量为22.83 ku,等电点(pI)为8.43,属于碱性蛋白;平均亲水系数为-0.240,属于亲水蛋白质;IFN-ε蛋白无跨膜结构,存在信号肽序列,属于分泌型蛋白;IFN-ε蛋白只包含1个超家族保守结构域,即IFab结构域。二级结构分析表明,该蛋白中α-螺旋、无规则卷曲、β-转角和延伸链所占比例分别为61.66%、30.05%、3.11%和5.18%。

摘要：本研究旨在对合作猪血红素加氧酶1(heme oxygenase 1,HMOX1)基因进行克隆及分析其相关生物信息学。本试验以NCBI数据库中已知的野猪HMOX1基因mRNA序列为模板设计特异性引物,应用RT-PCR技术扩增得到CDS区全长序列,采用生物信息学分析软件对合作猪HMOX1基因序列特征、同源性以及编码产物的理化性质、二级结构和三级结构、亚细胞定位、潜在信号肽剪切位点、跨膜结构域、亲疏水性、保守结构域、激酶磷酸化修饰位点等进行预测分析。结果表明,合作猪HMOX1基因CDS全长867 bp,编码288个氨基酸,与NCBI中公布的野猪(NM001004027.1)HMOX1基因核苷酸同源性为99%,氨基酸同源性为99.3%,并发现在第450 bp处T>C为同义突变;第706 bp处A>G和第802 bp处A>G为错义突变,导致第236位和第268位的异亮氨酸均突变为缬氨酸。合作猪与野猪、绵羊、牛、犬、兔、人、猫、马、小鼠、大鼠和鸡的氨基酸同源性分别为99.3%、86.5%、85.5%、84.7%、84.0%、82.6%、82.6%、81.4%、78.9%、77.2%和61.5%;系统进化树分析发现合作猪与野猪亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远。合作猪该基因编码产物具有亲水性和不稳定性,二级结构以α-螺旋为主,主要定位于分泌系统囊泡,不存在信号肽剪切位点,属非分泌蛋白;存在一段跨膜螺旋结构,含有一个Hemeoxygenase保守结构域,44个磷酸化修饰位点。本研究成功克隆出合作猪HMOX1基因CDS全长序列,可为今后HMOX1基因在合作猪高海拔低氧胁迫下的适应性分子机制研究提供科学理论依据。

摘要：【目的】研究不同粗蛋白质水平饲粮对高繁殖力猪新品系-HN生长性能的影响,并通过经济效益分析,确定HN品系生长所需适宜的粗蛋白质水平.【方法】试验采用单因素完全随机试验设计,选取体质量15kg左右的新品系猪30头(15阉15母),随机分成3组,每组10头.在体质量15~30kg(H:18.5%,M:18.0%,L:17.5%)、30~60kg(H:17.5%,M:17.0%,L:16.5%)和60~90kg(H:16.5%,M:16.0%,L:15.5%)阶段分别设计高、中、低3个粗蛋白水平饲粮,饲养至90kg结束后,统计各阶段平均日增质量、平均日采食量与料重比,分析饲粮粗蛋白质水平对其生长性能和经济效益的影响.【结果】随着各阶段日粮粗蛋白水平降低,试验猪平均日采食量逐渐增加.在15~30kg和30~60kg阶段,均以中粗蛋白质组猪的日增质量最高(390.63g/d和699.16g/d),料重比最低(2.43和2.81),育肥天数最少(41d和44d),但高、中、低三组猪平均日增质量差异不显著(P>0.05);在60~90kg阶段,中粗蛋白质组和低粗蛋白质组猪的日增质量未出现显著差异(P>0.05),但都极显著高于高粗蛋白质组(P<0.01).按甘肃省当前饲料和生猪价格(2016年11月),中粗蛋白质组猪育肥全期头均饲料成本为566.34元,分别比高粗蛋白质组和低粗蛋白质组低89.71元和37.22元;育肥猪头均盈利为363.66元,分别比高粗蛋白质组和低粗蛋白质组多104.71元和42.22元.【结论】对于体质量在15~30,30~60和60~90kg阶段的高繁殖力猪新品系-HN,理想的饲粮粗蛋白质水平是18.0%,17.0%和16.0%,在该蛋白水平下,育肥猪饲料成本低,头均利润高.