摘要：目的:建立特异、敏感、快速检测西尼罗河病毒(WNV)的SYBR Green实时荧光定量PCR方法。方法:针对西尼罗河病毒囊膜蛋白(E)的保守序列设计引物,建立WNV的实时荧光定量检测方法,并验证该方法的特异性、敏感性以及稳定性。对保存的54例WNV感染者的血清样本进行检测,分析其检测的准确性。结果:建立的SYBR Green实时荧光定量PCR方法对WNV的检测具有高度的特异性,而对日本脑炎病毒(JEV)、圣路易斯脑炎病毒(SLEV)等均无交叉反应,检测的灵敏度可达到100pg。标准曲线具有较好的线性关系,相关系数为0.995,实时荧光定量PCR效率为100%。对54例WNV感染样本进行检测,准确率高达98.15%。结论:实时荧光定量PCR技术检测WNV具有较高的特异性、敏感性和稳定性,可作为临床诊断WNV的手段。

摘要：目的拟靶向细胞内一群重要的信号转导因子—激酶,利用CRISPR/Cas9技术构建真核细胞敲除文库质粒,并探讨其构建方案。方法拟靶向编码人源激酶蛋白的507个基因开放阅读框,针对每个基因片段设计10个作用靶点,通过芯片法合成引物库(oligo pools)后,将引物从芯片上洗脱下来;合成的引物模板序列经PCR扩增、割胶回收后,与Cas9慢病毒载体连接,电转化至感受态细胞并提取质粒;质粒转化至Stbl3感受态细胞后,随机挑取单克隆进行摇菌,并送测序。结果 (1)对选取的507个激酶基因进行GO分析,发现细胞激酶广泛参与各种重要的细胞信号通路;(2)以oligo pool为模板,利用合成的通用引物进行PCR扩增,得到大小约为140 bp的条带,符合预期;(3)在鉴定的40个文库质粒克隆中,共有34个克隆样品测序成功,其中25个样品与设计的目标序列完全一致,9个样品存在一定引物合成突变。部分克隆存在摇菌失败、测序无信号或双峰等因素。结论构建好的CRISPR/Cas9激酶敲除文库可广泛用于筛选介导细胞增殖、转移、耐药、自噬等表型的重要激酶,为阐明激酶在疾病发生发展中的作用奠定基础。

摘要：目的:探讨实时定量PCR检测肺炎衣原体(chlamydia pneumonia,Cpn)的方法。方法:根据GenBank提供的肺炎衣原体基因序列,选取高特异性和保守型的区域进行引物设计,并建立实时定量PCR(real-timePCR,RT-PCR)的检测方法。同时用肺炎支原体、肺炎双球菌、流感病毒、副流感病毒以及腺病毒对Cpn引物的特异性进行分析。对呼吸道感染患者200个咽拭子样本和68个肺泡冲洗液样本进行检测,以荧光抗体检测法作对照,评价实时定量PCR检测Cpn的准确性。结果:Cpn PCR引物对肺炎支原体、肺炎双球菌、流感病毒、副流感病毒以及腺病毒均显示阴性,对Cpn显示为阳性,特异性良好;荧光实时定量PCR技术检测的准确性优于荧光抗体检测法。结论:荧光实时定量PCR技术检测Cpn体灵敏度高、周期短,可作为临床诊断Cpn的手段。

摘要：目的建立检测创伤伤口分泌物中产气荚膜梭菌的实时荧光定量PCR方法,为气性坏疽的早期快速诊断提供新手段。方法以产气荚膜梭菌16SrDNA基因序列为模板,在其保守区域设计特异性引物及探针,以PCR扩增产物重组质粒作为定量检测的标准品,绘制标准曲线。对荧光定量PCR体系和反应条件进行优化,并验证方法的特异性、敏感性、重复性及临床应用的可行性。结果所建立方法检测产气荚膜梭菌具有高度特异性,与创伤弧菌等23种相关细菌均无交叉反应。检测灵敏度以纯菌计达9×102cfu/ml,相当于9cfu/反应。反应体系具有很高的稳定性。整个操作过程仅需3h。5例创伤可疑分泌物样本的荧光定量PCR检测结果与细菌培养完全一致。结论本研究建立的实时荧光定量PCR方法特异、灵敏、快速,可用于创伤伤口分泌物中产气荚膜梭菌的日常检测以及战时和突发事件时的批量应急诊断。

摘要：目的:运用实时荧光定量PCR法检测产气荚膜梭菌,为早期快速诊断气性坏疽提供新方法。方法:以产气荚膜梭菌16s rDNA基因序列为模板,在其保守区域设计特异性引物与探针,将PCR扩增所得产物片段克隆,作为定量检测的标准品,绘制标准曲线。并对荧光定量PCR体系与反应条件进行优化,验证方法的特异性、敏感性、重复性及可行性。结果:实时荧光定量PCR法对产气荚膜梭菌的检测具有高度特异性,与创伤弧菌等24种相关细菌等均无交叉反应;检测灵敏度以纯菌计数达9×102cfu/mL,相当于9 cfu/反应;反应体系有较高稳定性;整个操作过程仅需3 h;300例创伤可疑分泌物样本的荧光定量PCR检测结果与细菌培养结果一致。结论:实时荧光定量PCR法特异、灵敏、快速,适用于产气荚膜梭菌的临床检测及突发事件的批量检测。