摘要：为了利用生物信息学探索网上克隆基因与预测基因功能的新方法,首先用一段1.8kbDNA片段在人类EST数据库中进行电子杂交并对相互重叠的EST片段组装,通过引物设计进行cDNA末端快速扩增。以高通量基因组序列(HTGS)数据库及SAGE文库为基础,进行染色体定位及组织表达分析。通过DAS及RPS-BLAST程序预测其蛋白质结构及功能。结果显示,LRP15cDNA全长1718bp,含一个780bp的开放读码框架,编码259个氨基酸。该基因定位于染色体3p24,在多种组织中表达。其编码蛋白含有N端富含亮氨酸重复序列及潜在的穿膜序列。研究表明,生物信息学是克隆与预测基因功能的有效方法;LRP15基因可能是一个参与细胞发育调控的新基因。

摘要：为了克隆与白血病复发相关的新基因 (LRP15 )的全长cDNA序列 ,应用分子生物学及生物信息学技术对一段已知仅在白血病复发标本中被甲基化的 1.8kb长的DNA片段进行研究分析 ,通过美国生物信息中心 (NCBI)提供的hEST数据库进行电子杂交 ,并对获得的相互重叠的EST片段进行组装 ,设计引物进行cDNA末端快速扩增(RACE)。以高通量基因组序列 (HTGS)数据库及SAGE文库为基础 ,将获得的cDNA片段进行染色体定位及组织表达分析。结果表明 ,LRP15基因的cDNA序列全长 1718bp ,含 1个 780bp的开放读码框架 ,编码 2 5 9个氨基酸。该基因定位于染色体 3p2 4 ,在多种组织中表达。结论 :RACE技术是克隆新基因的有效方法 。