摘要：目的分析微卫星5联简单重复序列在分枝杆菌基因组中的分布情况，并评价其简单序列重复区间（ISSR）分型能力，为分枝杆菌的基因分型及流行病学研究提供新的研究工具。方法实验菌株为17株分枝杆菌菌株和41株MTB临床分离株，17株分枝杆菌菌株包括分枝杆菌标准株15株、MTB临床菌株1株和MTB无毒株（H37Ra）1株。利用MICdb2．0软件分析微卫星数据库收录的分枝杆菌基因组中5联简单重复序列（CAGCG）n的分布特征，并以该序列为基础设计ISSR引物（5’-CAGCGCAGCGCAGCG-3’），用于分枝杆菌种间和种内菌株的基因分型分析。结果生物信息学分析显示（CAGCG）n在数据库收录的大部分分枝杆菌基因组中均有较高含量，其中在H37Rv、CDCl551、牛分枝杆菌和鸟分枝杆菌基因组中出现的次数分别为40、39、39和33次，且主要分布在编码序列区（分别为39、36、38和30次）。ISSR引物对分枝杆菌菌种的基因分型分析显示，15种常见菌种聚为2大簇，第1簇含有2个亚型，第2簇含有4个亚型，种间表现出高度的遗传多样性；ISSR引物对MTB临床菌株的分析结果显示，41株菌株聚为2簇，各簇分别有2个亚型，提示该引物对种内菌株也表现出良好的分辨力。结论以（CAGCG）n建立的ISSR分型体系，可用于分枝杆菌种间和种内菌株的遗传多样性分析。

摘要：目的寻找新的鉴别诊断MTB复合群（MTC）高特异度和敏感的核酸靶标。方法利用简单序列重复区间（ISSR）分型技术平台筛选MTC的特征片段，克隆测序获得特征序列并进行序列同源性分析，以该序列为基础设计MTC特征引物，并对211株分枝杆菌菌株（其中MTC107株、非结核分枝杆菌104株）进行鉴别检测。利用分枝杆菌属特征序列16s rRNA和MTC特征序列IS6110的鉴别结果，对MTC特征引物检测结果进行评估。结果通过ISSR分型获得588bp的MTC特征片段，该序列为MTC菌株的特征序列，位于MTB标准株H37Rv基因组的315947-316534位，以该序列为基础设计MTC鉴别引物MTCF／R，16srRNA基因在211株分枝杆菌菌株中的扩增结果均为阳性，IS6110序列在107株MTC菌株中扩增阳性率为99％（106／107），在104株NTM菌株中阴性检出率为100％（104／104），MTCF／R引物在MTC菌株中的扩增阳性率为100％（107／107），在非结核分枝杆菌菌株中的阴性检出率为100％（104／104）。结论通过ISSR分型技术筛选出的MTC特征序列可作为新的核酸扩增靶标用于MTC和非结核分枝杆菌的鉴别诊断。