摘要：AB SCIEX公司最新发布了全新的高分辨液相色谱质谱联用系统,TripleTOF 5600。这一新产品是在享有盛名的API5500三重四极杆系统和QSTAR Elite(QqTOF)系统这两个技术平台的基础上开发出来的。这一全新的TripleTOF 5600高分辨液相色谱质谱联用系统能够对复杂的蛋白质组学样品进行高通量分析,并能同时提供高质量的定性和定量结果。为了评估这款仪器的性能,我们设计了基于纳升液相色谱和TripleTOF 5600联用系统的一系列实验。首先,我们应用这一拥有高分辨率、高灵敏度和高质量准确度的系统对酵母细胞裂解物的胰酶消化产物进行了分析。实验中采用了每秒最多采集50幅串联质谱谱图的信息相关采集模式,单次lC-MS/MS实验就鉴定了10,179条独特肽段和1174种蛋白(at 1%global false discovery rate)。而实际达到了平均每秒34幅串联谱图的采集速度是在单次实验获得如此优异的鉴定结果的决定性因素。此外,我们也对一组含有五种已知蛋白以及部分重同位素标记肽段的样品进行了分析,以检验TripleTOF 5600的定量能力。实验中这五种蛋白质都获得了很高的序列覆盖率,其中进样量仅有100amol的Peroxiredoxin 1蛋白的序列覆盖率也高达53%。而测试中得到肽段的平均质量偏差仅为1.7 ppm,展示了TripleTOF 5600的高质量准确度和稳定性。我们还获得了高度准确的定量结果,充分证明了TripleTOF5600能够提供三重四极杆系统级别的定量结果。