摘要：目的:检测未成熟冬虫夏草子座中同时存在的多种突变基因型冬虫夏草菌。方法:采用MassARRAY单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)质谱基因分型法,根据冬虫夏草菌基因内转录间隔区(ITS)序列的大量散在点突变,设计8个SNP延伸引物,利用质谱测定各个SNP位点的单核苷酸延伸反应,检测未成熟冬虫夏草子座中与GC偏倚基因型(gb#AB067721)冬虫夏草菌相关的突变基因型。结果:GC偏倚基因型和两个AT偏倚基因型同时存在于未成熟天然冬虫夏草子座中。SNP基因分型法还检测到另外至少两个未知序列的突变基因型。结论:已知的3个冬虫夏草菌基因型的共存提示在冬虫夏草的子座萌发阶段和成熟过程中可能存在DNA转换点突变;另外两个未知序列的基因型的存在提示冬虫夏草中可能存在DNA颠换点突变。

摘要：目的:检测冬虫夏草成熟过程中冬虫夏草菌转换突变和颠换突变基因型在子座中表达的动态变化。方法:采用MassARRAY单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)质谱基因分型法,根据冬虫夏草菌基因内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列中大量散在的点突变,设计了8个SNP延伸引物,其中5个位于rDNA ITS1和ITS2段:067721-211,067721-240,067721-477,067721-531和067721-581,用于检验GC和AT偏倚基因型,但不区分两个AT偏倚基因型;另外3个延伸引物位于rDNA 5.8S段:067740-324,067740-328和067740-360,用于区分两个AT偏倚基因型。应用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱法(matrix-assisted laser desorption/ioniza-tion-time of flight,MALDI-TOF)测定各个SNP位点的单核苷酸延伸反应,观察未成熟和成熟冬虫夏草子座中转换突变和颠换突变基因型表达的动态变化。结果:冬虫夏草子座rDNA的8个SNP位点的质谱图显示复杂的动态变化。067721-211位点的AT偏倚型等位基因的分子浓度明显高于GC偏倚型,但随着冬虫夏草的成熟,这个位点的AT型等位基因消失。多个SNP位点的质谱图中不仅显示转换突变的等位基因,颠换突变等位基因也有很高的检出率,有些甚至超过GC和AT偏倚基因型等位基因的峰高;而随着冬虫夏草的成熟,颠换突变等位基因的检出率和峰高趋于下降。在区分两个AT偏倚基因型的研究中,AB067744和AB067740两个基因型的等位基因同时存在于未成熟冬虫夏草子座中。随着冬虫夏草的成熟,AB067744基因型等位基因的峰高大幅度降低,而AB067740基因型等位基因的峰高大幅度升高。结论:在冬虫夏草子座中共存的至少5个冬虫夏草菌突变基因型的表达随着冬虫夏草的成熟呈现动态变化,这些突变基因型菌的存在和它们的动态变化对于冬虫夏草子座的萌发和成熟具有重要意义。

摘要：本研究检测了在冬虫夏草成熟过程中突变基因型冬虫夏草菌在子座中表达的动态变化。根据冬虫夏草菌基因内转录间隔区(ITS)序列中大量散在的点突变,设计了8个单核苷酸多态性(SNP)延伸引物,采用SNP质谱基因分型法测定各个SNP位点的单核苷酸延伸反应,观察冬虫夏草子座中转换突变和颠换突变基因型菌在冬虫夏草成熟过程中表达的动态变化。其中5个SNP延伸引物(067721-211,067721-240,067721-477,067721-531和067721-581)位于rDNA ITS1和ITS2段,用于区分GC和AT偏倚基因型,但不区分2个AT偏倚基因型。另外3个延伸引物(067740-324,067740-328和067740-360)位于rDNA 5.8S段,用于区分2个AT基因型。采用PCR+EcoRⅠ限制性酶切法检验2个GC偏倚基因型冬虫夏草菌在冬虫夏草成熟过程中表达的动态变化。结果表明:冬虫夏草子座rDNA ITS1-5.8S-ITS2片段的8个SNP位点的质谱图谱显示冬虫夏草子座中存在至少5个冬虫夏草菌转换突变和颠换突变等位基因。它们的表达在冬虫夏草成熟过程中呈现动态变化。067721-211和067721-477位点的AT偏倚型等位基因的峰高明显高于GC偏倚型;随着冬虫夏草的成熟,这2个位点的AT型等位基因峰高大幅度下降。SNP质谱图不仅显示转换突变的等位基因,颠换突变等位基因也有很高的检出率,它们的峰高在一些位点甚至超过GC和AT基因型等位基因;随着冬虫夏草的成熟,颠换突变等位基因的检出率和峰高趋于下降。在区分2个AT偏倚基因型的研究中,AB067744和AB067740 2个基因型的等位基因同时存在于未成熟冬虫夏草子座中。随着冬虫夏草的成熟,AB067744基因型等位基因的峰高明显降低,而AB067740基因型等位基因的峰高明显升高。PCR产物EcoRⅠ酶切试验发现子座中存在2组GC偏倚型菌,具有完全不同的成熟模式。综上,冬虫夏草子座中存在至少6个突变基因型冬虫夏草菌,其表达随着冬虫夏草的成熟呈现动态变化。这些突变基因型菌表达的动态变化对于冬虫夏草子座的萌发和成熟具有重要菌物学意义。