摘要：采用SSPHunter软件在泥蚶(Tegillarca granosa)磁珠富集文库和454转录组文库中搜索核心序列长度12bp以上的2—6核苷酸重复序列,根据富集文库所得基因组SSR侧翼序列设计47对引物,可成功扩增17对且均为多态性引物,多态率100%,平均等位基因数(Na)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态性信息含量(PIC)分别为6.8、0.468、0.785、0.733。11344条EST序列中得到1683个SSR位点,检出率14.83%,平均每3.85kb出现1个位点。根据部分EST序列设计120对引物,62对可扩增出目的片段,其中29个位点具有多态性,多态率为46.77%,平均Na、Ho、He、PIC分别为4.2、0.372、0.554、0.500,均低于基因组SSR。双变量相关性分析的结果表明,46个多态性SSR位点的核心序列长度与其Na、Ho、He、PIC极显著正相关,Spearman相关系数分别为0.632、0.387、0.657、0.

摘要：摘要：利用3000条泥蚶（Tegillarca granosa）单拷贝序列，筛选到132条含有SSR候选位点序列，成功设计引物50条。群体多态性检测结果显示，24个SSR位点为多态性，各位点的等位基因介于2-5个，平均等位基因数3．5个；观测杂合度舶、期望杂合度He、多态信息含量Ⅳc范围分别为0．000-0．591、0．045～0．727、0．043～0．696；多态位点中有11个高度多态、4个中度多态、9个低度多态；进行哈迪一温伯格平衡检测后，用Bonferronicorrection法进行校正，结果有17个位点显著偏离平衡。