摘要：当前已开发的石斛（Dendrobium）SSR标记仅100余对，难以满足研究的需要。为开发更多石斛分子标记，本研究通过生物信息学方法从公共核酸数据库搜索石斛SSR。结果表明，GenBank收录的3599条石斛DNA序列经拼接获得1343条Uni—DNA序列。经搜索，共检测出283个SSR，分布于205条Uni—DNA序列，平均每2815bp含一个SSR。通过序列比对，剔除86条已开发引物的SSR—DNA序列，从剩余的119条序列设计76对引物，并在石斛属32个种间进行可转移性分析，结果显示47对引物得到有效扩增，种间可转移率为51．1％N95．7％，平均为75．9％。有效扩增引物中有46对在石斛种间具多态性，检测出等位基因数2～8个，平均4．0个。选取10对多态性引物扩增60份铁皮石斛资源，每对引物检测出等位基因数2～5个，平均3．4个。根据SSR扩增带型将60份铁皮石斛资源聚为5大类，同一类型内的表型较类群间接近。对DMl21扩增产物测序表明铁皮石斛种内的SSR等位变异由SSR重复次数差异造成，而石斛种间的SSR等位变异还包含SSR位点侧翼序列的插入缺失以及替换。

摘要：根据口蹄疫病毒VP1基因的序列 ,设计了 1对引物 ,建立了检测口蹄疫病毒的RT -PCR方法。对FMDV各毒株检测 ,结果均为阳性 ,而对猪病毒性疾病相关病毒进行检测 ,结果均为阴性 ;检测 19份已知阳性样品 ,检出率 10 0 % ;与动物接种试验比较 ,符合率 10 0 % ,证明该方法特异。与经典方法动物接种试验比较 ,其灵敏度提高10 0倍左右 ;对O3I3株的细胞毒进行检测 ,其敏感度达 10个TCID50 。初步结果表明所建立的RT

摘要：本研究根据口蹄疫病毒 (FMDV)VP1基因的序列 ,设计并合成了 1对用于扩增整个VP1基因的引物 (5P、P6 )。从细胞培养液或组织中提取总RNA ,通过PT_PCR扩增 ,从F2 9株、O3I3株和T5 0 9株中均获得了 1条约 740bp的DNA电泳带。将PCR产物双酶切后电泳回收 ,插入到相应双酶切的pUC18质粒中 ,获得了重组质粒。通过PCR鉴定 ,证明重组质粒pUCVP1/F2 9、pUCVP1/O313、pUCVP1/T5 0 9均插入了VP1基因。对上述 3个重组质粒进行测序后分析 ,F2 9强毒株与O3I3、T5 0 9弱毒株相比 ,其核苷酸序列同源性分别为 98.75 %和 99.0 6 % ;因F2 9株核苷酸发生 3个碱基缺失与 1个碱基替换 ,故推导的氨基酸序列同源性分别仅为 44 .13%和 41.32 % ;而T5 0 9株与O3I3株相比 ,其核苷酸、氨基酸序列同源性分别为 99.37%和 95 .31%。通过序列分析发现 ,本研究的 3个毒株与国内大多数毒株 (包括 1997年台湾暴发FMDV所分离的毒株 ,除O/A/ 5 8株外 )均属于同一基因型 ,核苷酸序列同源性为 85 %～ 94% ;而与国外毒株相比 ,属不同的基因型 ,核苷酸序列同源性仅为 81%～ 82 %。其推导的氨基酸序列 ,除F2 9株与O/HK/ 93株及 1997年台湾暴发FMDV分离的少数毒株的氨基酸序列同源性仅为 45 %～ 6 3%外 ,本研究的

摘要：为评价国外引进辣椒材料的遗传多样性现状,利用ISSR标记对30份国外引进的辣椒种质资源进行遗传多样性研究。从96条ISSR引物中筛选出8条多态性引物对30份辣椒材料进行ISSR-PCR的扩增,共扩增1781条带,多态性条带数为1389条,多态性比率为77.99%。用NTSYS-pc2.10统计软件的UPGMA法对30份国外引进的辣椒种质材料的ISSR扩增结果进行聚类,在遗传相似系数GS=0.724(L1)处,可以将30份辣椒种质材料分为3类。第1类共19份辣椒材料,第2类共10份辣椒种质资源,第3类只有编号为167的1份辣椒资源。主坐标分析与聚类分析结果大体一致,交叉分类结果更为直观。