摘要：目的:通过网络药理学和免疫浸润探讨中药荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的作用机制。方法:通过TCMSP、TCMIP数据库查找荜茇主要化学成分及其作用靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD数据库收集血吸虫病及肝细胞癌相关靶点,构建“药物-成分-靶点”和“成分-靶点-通路”网络图,对药物和疾病的交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析;通过R语言对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过GEPIA和UALCAN数据库对潜在靶点进行表达差异及生存预后分析;通过TIMER数据库对核心靶点进行免疫浸润分析。结果:获得荜茇抗血吸虫病及肝细胞癌潜在靶点11个,其中肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10(IL-10)、环加氧酶2(PTGS2)等可能是荜茇发挥作用的潜在靶点;KEGG通路富集主要涉及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、C型凝集素受体信号通路等,生物信息学结果表明葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)可能在荜茇治疗血吸虫病相关肝细胞癌过程中发挥重要作用。结论:本研究初步预测了荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的分子机制,为进一步深入研究及临床应用提供了理论依据。

摘要：目的通过生物信息学方法探讨肾透明细胞癌(cc RCC)中脂肪酸合酶(FASN)基因和蛋白的表达水平及其与肿瘤免疫细胞浸润的相关性。方法从癌症基因组图谱数据库检索FASN与cc RCC相关的表达谱数据,通过UALCAN数据库分析cc RCC中FASN基因表达水平及其与cc RCC患者临床病理分期、分级的相关性,使用基因表达谱动态分析网站分析FASN基因与cc RCC患者预后的相关性,使用人蛋白图谱数据库分析人组织中FASN蛋白表达水平,使用肿瘤免疫评估数据库和肿瘤微环境数据库分析FASN与肿瘤免疫的相关性,使用基因注释和分析数据库对FASN及相关基因进行功能富集分析。结果在不同病理分期、分级cc RCC中FASN基因表达水平均显著高于正常组织,FASN基因高表达的患者预后较差。FASN蛋白S207和S2198位点磷酸化水平在cc RCC中显著降低。FASN表达与cc RCC中CD8^(+)T免疫细胞浸润水平呈负相关,与调节性T细胞浸润水平呈正相关,免疫治疗会影响FASN与免疫细胞在cc RCC中共定位。FASN主要参与细胞脂质代谢、甾醇调节元件结合转录因子1激活基因表达、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、脂肪酸生物合成等生物功能。结论FASN在cc RCC中高表达,且与cc RCC患者临床预后、肿瘤免疫细胞浸润相关。

摘要：研究旨在揭示免疫相关基因在冠状动脉粥样硬化行心脏病中的作用。方法从GEO数据库中检索GSE12288和GSE66360数据集的基因表达谱。利用两种种机器学习算法,最小绝对收缩和选择算子(LASSO)和随机森林,在动脉粥样硬化型心脏病免疫相关基因中筛选特征基因。绘制ROC曲线评估诊断效果。通过ssGSEA评估免疫细胞浸润情况。使用共识聚类方法对动脉粥样硬化型心脏病标本进行分类。患者可以从基于特征基因的诺模图中获得临床益处。结果 鉴定出5个特征基因(SEMA3C,IL4R,SEMA3A,HSPA4,OSMR),能够预测动脉粥样硬化型心脏病。得到两种免疫亚型C1和C2。结论 研究得到了五个特征基因和两种免疫亚型,这可能有助于设计更精确的心血管免疫疗法。