摘要：目的:为解决准确预测新辅助化疗疗效的问题,设计采用中医辨证分型联合西医分子分型的方法进行前瞻性病例研究,探讨联合分型与乳腺癌新辅助化疗疗效的相关性。方法:纳入2012年7月—2013年6月间收治符合入组标准进行新辅助化疗的女性乳腺癌病例。化疗前行空芯针穿刺检查明确西医分子分型(4型:管腔A型、管腔B型、HER2过表达型和三阴性),同时由有丰富经验的资深中医师进行中医辨证分型(3型:肝郁痰凝型、冲任失调型和正虚毒炽型),每个病例同时具有一个西医分子分型和中医辨证分型(联合分型)。通过规范统一的4周期蒽环类联合紫衫类(ET)方案新辅助化疗得到化疗疗效的临床评价和病理评价。将联合分型与化疗疗效评价结果进行相关性分析。结果:共有128例女性乳腺癌符合入组要求纳入研究分析。管腔A型合并肝郁痰凝型占全体病例数比例最高(24.22%),管腔B型合并正虚毒炽型比例最低(0.78%)。管腔型(包括A和B)更倾向于中医辨证为肝郁痰凝和冲任失调型,三阴性更倾向于中医辨证为正虚毒炽型,而HER2过表达型则在三种中医辨证类型中分布较为均衡(χ~2=38.35,P=0.00)。通过联合分型与化疗疗效相关性分析比较发现,管腔A型中正虚毒炽分型较其他辨证分型有更高的完全缓解率(χ~2=16.54,P=0.002),而HER2过表达型中肝郁痰凝分型较其他辨证分型有更高的病理和完全缓解率(χ~2=10.25,P=0.036)。结论:西医分子分型联合中医辨证分型可能更加精确地预测治疗疗效,可为乳腺癌术前治疗提供更为准确的指导。

摘要：目的对简单序列重复区间聚合酶链反应(ISSR-PCR)进行改进和优化,以建立一种改进型霍乱弧菌分子分型和遗传溯源技术。方法通过设计、筛选优良扩增引物和优化反应体系对ISSR-PCR进行技术改进,并选择75株霍乱弧菌作为方法学的分型测试样品进行实验验证。结果经筛选以引物ISSR_GA5分型效果最佳。对ISSR-PCR实验条件进行优化,确定最佳反应体系:Mg2+浓度为2.0mmol/L,dNTPs浓度为0.3mmol/L、引物浓度为1.2μmol/L。采用改进型ISSR-PCR技术能正确区分霍乱弧菌菌株中的产毒株(流行株)和非产毒株(非流行株)、O1群/O139群和非O1/非O139群以及本地株和外地株。结论建立的改进型ISSR-PCR技术分型效率高,为我国卫生检疫和疾控部门开展霍乱等重要传染病的防控和疫情溯源提供了新的、简便实用的技术方法。

摘要：目的研究iNOS、NQO1在不同分子分型乳腺癌中的差异及临床参数间相关性,为乳腺癌临床治疗进行探讨。方法回顾性收集接受改良根治术的乳腺癌患者100例,免疫组织化学检测癌组织iNOS和NQO1表达情况。计数资料采用χ~2检验或Fisher确切概率法,Spearman相关分析分析临床分子病理特征之间的相关性。结果 NQO1表达与乳腺癌TNM分期和淋巴结转移具有相关性(χ~2=6.603、4.938,P<0.05),HER-2过表达型中NQO1表达率高于luminal A型(χ~2=8.341,P<0.008)。iNOS表达与Ki-67表达、TNM分期及淋巴结转移情况相关(χ~2=5.243、8.157、5.929,P<0.05),luminal A型中iNOS表达率显著低于luminal B型(χ~2=7.990,P<0.008)。结论 NQO1和iNOS表达可能与乳腺癌的氧化应激过程有关,对促进乳腺癌进展有重要作用;不同分子分型乳腺癌之间的氧化应激水平可能不同,其具体分子机制需进一步设计实验研究。

摘要：人腺病毒(HAdV)是一种重要的病原体,其分子分型对于了解HAdV的生物学、流行病学和种属结构均至关重要。目前传统的血清学方法已确定了1~51种血清型,但该方法存在一定局限性。新型的基因分型方法主要根据五邻体蛋白、六邻体蛋白和纤维蛋白的序列分析确定了52~113型,其他新型HAdV的确定也主要依据基因组序列分析。因此,未来全面了解HAdV的分子分型方法及作用机制,可以为相关疾病的治疗提供新思路。

摘要：目的:探讨乳腺癌空芯针活检(core needle biopsy,CNB)与手术切除标本Ki67表达量的改变及其与分子分型的关系。方法:回顾性分析在瑞金医院乳腺疾病诊治中心接受CNB与手术切除治疗乳腺癌病人Ki67的表达量与改变情况。Ki67改变值定义为手术切除标本Ki67表达减去CNB标本的Ki67表达量,并分析乳腺癌临床病理指标和分子分型与Ki67表达量改变之间的关系。结果:共有298例乳腺癌病人的CNB和手术切除配对标本行激素受体、Her-2以及Ki67免疫组织化学检查。手术切除标本Ki67的表达量显著高于CNB标本:29.3%比26.8%,P=0.046;Ki67改变值的中位数和平均数分别为0(四分位距,-5.0%,10.0%)和2.5%±14.0%。单因素(P=0.024)和多因素(P=0.048)方差分析均显示Ki67改变值与分子分型状态显著相关:82例luminal A型的Ki67改变值为5.4%,显著高于112例luminal B型的-0.7%;而在38例luminal B-HER2+型、39例三阴性型以及27例Her-2+型乳腺癌病人中Ki67改变值无统计学差异。结论:手术切除标本的Ki67表达量较CNB标本显著上升,Ki67表达升高主要见于luminal A型病人,研究结果有助于设计新型临床研究。

摘要：快速准确的分子诊断是控制传染病和疫情暴发的关键工具。随着新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染导致的肺炎患者数量迅速增加和疫情蔓延,已有SARS-CoV-2基因组序列、核酸检测的诊断试剂和方法相继报道,高深度全基因组测序和RT-PCR是目前检测SARS-CoV-2的重要方法。但是,核酸检测阴性而影像学诊断阳性的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)案例逐步增加,因此,提高核酸分子诊断的效能和灵敏度是亟待解决的问题。目前,SARS-CoV-2的起源、动物和人的传播途径、分子诊断及临床治疗、疫情暴发科学预警等已经成为研究热点。本文从遗传学、基因组学、病毒学和进化生物学的角度,对SARS-CoV-2基因组变异与分子诊断的近期研究进展进行分析。通过比较SARS-CoV-2与SARS-CoV(SARS冠状病毒)基因组以及感染患者基因组变异,以期为精准快速的分子诊断、抗病毒药物的靶点筛选提供依据,同时为SARS-CoV-2追踪溯源、精准快速核酸分子诊断方案设计、临床防治提供新思路。

摘要：目的测定大测肝菌O85的O-抗原基因簇的序列,对其基因进行功能和进化的分析,筛选并鉴定可用于快速分子分型的特异分子标识。方法利用鸟枪法对大肠杆菌O85的O-抗原基因簇进行测序,生物信息学方法进行序列拼接与分析,确定针对大肠杆菌O85的特异基因并设计引物,PCR方法进行模拟环境样品的检测。结果大肠杆菌O85的O-抗原基因簇序列全长为11 203 bp。发现8个开放阅读框架(orf)并确定功能,分别为:UDP-N-乙酰葡萄糖-2-异构酶基因(orf1),吡喃型UDP-半乳糖变位酶基因(glf),糖基转移酶基因(orf3、orf5、orf6和orf8),O-抗原转运酶基因(wzx)和O-抗原聚合酶基因(wzy)。鉴定出针对大肠杆菌O85的特异基因2个和引物4对。结论本文筛选的特异分子标识和PCR检测方法可用于对环境样品中的大肠杆菌O85进行快速、灵敏的检测。

摘要：【目的】考察炭疽芽胞杆菌中规律成簇的间隔短回文序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)位点多态性情况及基于CRISPR位点多态性的分子分型方法是否在炭疽芽胞杆菌分型中适用。【方法】下载NCBI数据库中6株炭疽芽胞杆菌基因组并截取其中CRISPR位点片段序列。根据炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点信息,设计相关引物,以193株炭疽芽胞杆菌基因组为模板PCR扩增CRISPR位点片段,测序。本地Blast比对截取序列及测序结果,查看CRISPR位点在炭疽芽胞杆菌中的多态性情况,并比较炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌内CRISPR位点情况。【结果】炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点不存在多态性。【结论】基于CRISPR位点多态性的分子分型方法不适用于炭疽芽胞杆菌分型,但可以用于区分炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌。

摘要：2012年6月新疆沙湾县某奶牛养殖场爆发疑似牛乳头状肿瘤病,为了确诊该病,本研究采取皮肤病变组织进行病理切片检查;设计牛乳头状瘤病毒简并引物BPV P1/BPV P2对皮肤肿瘤组织样品进行PCR扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体中进行测序、序列分析及遗传进化树构建。结果表明:遗传进化树分析显示新疆沙湾县爆发的牛乳头状肿瘤病是由2型牛乳头瘤病毒所引起,与BPV-1、BPV-13进化关系最近。本研究为新疆地区牛乳头状瘤的科学防控提供了理论依据。

摘要：根据肠道菌基因间重复一致序列,设计了一对特异性引物,采用ERIC-PCR和RAPD技术,研究了副猪嗜血杆菌6个分离菌株的指纹图谱和DNA多态性。结果表明,6个分离株的PCR指纹图谱与15个标准血清型指纹图谱相比较可分辨出4种血清型;6个分离株的RAPD研究结果均表现出多态性。有意义的是,6个菌株的多态性DNA片段也能明显将其分为4种类型的副猪嗜血杆菌,与特异性引物PCR结果相一致。该研究可作为流行病学调查和该菌的分子分型快速诊断方法的基础。