摘要：为深入研究鸡G蛋白α亚基(G-protein alpha subunit,GNAS)基因的转录剪接情况,采用5’和3’cDNA末端快速扩增(rapid-amplification cDNA ends,RACE)技术,对鸡GNAS基因进行克隆测序;并采用定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,检测鸡皮肤、胸肌、心、脑、肝、肺和腹脂等7种组织中GNAS基因剪接体的表达量。结果表明:鸡GNAS基因存在1554和1796 bp 2种转录剪接体,均含12个外显子,二者仅第1外显子的长度和位置不同,其余第2-12外显子相同。克隆子1(1554 bp)编码417个氨基酸,克隆子2(1796 bp)编码379个氨基酸。在NCBI数据库中进行蛋白比对发现,克隆子2的氨基酸序列与已知的人和小鼠的GNAS基因Gαs亚基同源相似度达93%,而克隆子1的氨基酸序列与XLαs亚基的同源性较高(相似度87%)。表达量检测表明,2种转录剪接体在7种组织中均有不同程度的表达,其中:在脑组织中的表达量最高,与其他组织间差异极显著(P<0.01),在皮肤组织中的表达量(P<0.01或P<0.05)次之;而在肺、胸肌、肝、心、腹脂等组织中的表达量较低。

摘要：早幼粒细胞白血病(Promyelocytic Leukemia,PML)基因位于15号染色体,含有9个外显子,通过对内含子不同的剪接方式产生7大类20余种不同的PML剪接体.为对PML不同剪接体进行分型,针对PML各剪接体C末端设计5对型特异性引物,通过PCR扩增产物的有无及大小来判断PML分子的型别.利用设计的引物,通过对已知类型的PML质粒进行分型,确定了分型引物的可行性.对一株肝癌细胞系QGY7701中表达的PML分子进行分型,发现其为PML剪接体IV型与II型的混合型.研究表明,利用所设计5对引物的扩增,可以判断出某种组织或细胞中表达的PML分子剪接体型别.

摘要：旨在克隆猪ADAM10基因及其剪接体的编码区(Coding sequence,CDS),利用生物信息学方法分析其序列结构和生物学功能,并揭示ADAM10基因及其剪接体mRNA在猪组织中的表达特征。根据GenBank中公布的猪ADAM10基因的序列信息,设计特异性引物,运用反转录PCR(Reverse transcription-PCR,RT-PCR)方法结合T/A克隆技术进行ADAM10基因及其剪接体编码区的克隆,利用生物信息学方法分析ADAM10及其剪接体蛋白的结构,同时用半定量PCR(Semi-quantitative PCR)分析猪ADAM10基因完整型及其剪接体mRNA在猪不同组织中的表达谱。结果显示,克隆和测序获得两种ADAM10CDS序列,其中完整型CDS长2 247bp,编码748个氨基酸;剪接型CDS缺失外显子2~7和部分外显子8,其长度为1 344bp,编码447个氨基酸。和完整型蛋白相比,猪ADAM10剪接体编码的蛋白不存在前引导序列,但存在完整的信号肽序列和跨膜结构域,并含有金属蛋白酶域和解聚素结构域,其三级结构也和完整型一致。序列比对和进化树分析表明,猪ADAM10完整型蛋白在物种间具有较高的保守性。半定量PCR分析表明,ADAM10基因完整型mRNA在脾中表达量较高,在肾、乳腺、腿肌、输卵管、卵巢、子宫、小肠等组织中低水平表达;ADAM10基因剪接体mRNA在肺中表达量较高,在脾和胃中也有低水平表达。本研究为进一步探究猪ADAM10基因的结构和生物学功能提供了基础资料。

摘要：目的探讨建立的RhD mRNA剪接体多态性检测技术的有效性与实用性。方法采用设计的两对引物扩增全长RhD mRNA外显子,完全避开RHCE基因的干扰,特异性扩增并分析了随机选取的非血缘关系50例标本的RhDmRNA剪接情况。结果两对引物能扩增RhD mRNA剪接体的全长外显子基因并分析出RHD基因剪接体的多态性,扩增出4种剪接体的特异性:exon-1-3扩增产物:415 bp;exon-3-10扩增产物均由3种不同组合构成:产物一:约880 bp,产物二:约750 bp;产物三:约550 bp。50例标本:exon-1-3扩增产物:全部无缺失;exon-3-10扩增产物:带1无缺失,带2缺exon-7的占总标本27例、缺exon-7,8的占总标本6例、缺exon-8,9的占总标本12例、缺exon-7,9的占总标本5例,带3全部缺exon-7,8,9。结论建立的RhD mRNA剪接体多态性检测技术可以准确扩增RhD mRNA全长基因,并有效分析该基因剪接体的多态性。

摘要：目的构建蛋白质精氨酸甲基转移酶2(PRMT2)及其差异剪接体与绿色荧光蛋白(GFP)的真核表达载体,转染后观察其融合蛋白在乳腺癌MCF-7细胞中的表达及亚细胞定位,为进一步研究PRMT2基因及其新的差异剪接体在乳腺癌中的作用奠定基础。方法以p GEM-T-PRMT2/α/β/γ载体为模板,设计引物,PCR扩增目的基因,并将PCR产物克隆至pc DNA3.1/NT-GFP-topo载体,转化后将阳性克隆扩增,对PCR产物进行跑胶鉴定和测序。提取pc DNA3.1/NT-GFP-PRMT2/α/β/γ及空载体pc DNA3.1/NT-GFP质粒,用脂质体介导转染MCF-7细胞,在激光共聚焦显微镜下,观察外源性PRMT2/α/β/γ融合蛋白在MCF-7细胞中的亚细胞定位。采用Western blot法检测各重组融合蛋白在MCF-7细胞中的表达。结果各GFP在细胞中均有表达,但其在细胞中的分布位置不一致。PRMT2α与PRMT2γ的融合蛋白同PRMT2的分布一致,均聚集于核仁外的核浆,胞质中有少许分布;而PRMT2β和空载体的荧光蛋白的分布一致,都均匀分布于细胞的胞质和胞核,包括核仁部分。Western blot法检测表明各重组融合蛋白在MCF-7细胞中均有表达。结论PRMT2及其各剪接体的亚细胞定位不同,可能提示其在功能方面存在差异。

摘要：目的建立RhD mRNA剪接体实时荧光定量技术,了解不同个体中RhD mRNA剪接体的含量与表达水平。方法制备本实验室SYBR Green荧光染料定量检测RhD mRNA剪接体的标准曲线,设计RhD mRNA剪接体的引物,提取随机选择的150例血液样品中的mRNA,反转录为c DNA,并以c DNA为模板进行PCR扩增,扩增时加入荧光基团,利用荧光信号实时监控整个PCR进程,最后通过标准曲线来计算RhD mRNA各剪接体的表达量。结果根据荧光定量的峰值读数,以2nd Derivative Max计算方法,计算出所测样本的理论值、实测值,两个重复孔的平均值作为所检测样本RhD mRNA剪接体的表达量。结论此方法可以准确定量不同个体RhD mRNA剪接体的拷贝数,为RHD血型基因的研究与抗原表达的研究提供依据。

摘要：目的:抑癌基因N-myc下游调节基因2(N-myc down stream regulated gene 2,NDRG 2)在抑制肿瘤的发生及进展过程中具有重要作用,本研究旨在区分并鉴定NDRG2基因mRNA的6种可变剪接体。方法:针对NDRG2基因mRNA6种剪接体外显子的差别设计6对特异性引物。分别从正常人脑组织和胶质瘤细胞U251中提取总RNA,反转录为cDNA,利用高保真酶扩增目的剪接体DNA,并根据PCR扩增产物电泳条带的有无和大小初步判断剪接体的型别,最后将PCR产物胶回收进行测序鉴定。结果:利用本实验中设计的引物可以将人脑组织和U251胶质瘤细胞中的NDRG 2基因mRNA剪接体经行分型鉴定,确定了分型引物的可行性。人脑组织和U251细胞中均含有A、B、D和E四种剪接体。结论:利用本研究设计的特异性引物进行PCR扩增,可以判断某种细胞或组织中表达的NDRG2mRNA分子剪接体的型别。有助于未来深入研究抑癌基因NDRG2在肿瘤发生发展中的抑制作用与不同剪接体的表达相关性。

摘要：目的建立RHCE mRNA剪接体PCR检测方法,并评价方法的可行性。方法以RHCE mRNA剪接位点设计引物,提取30例随机选择的非血缘关系血液样本中的mRNA,逆转录为c DNA,并以c DNA为模板进行PCR扩增,对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,最后通过基因测序技术对RHCE mRNA各剪接体进行序列分析。结果PCR扩增产物在2%琼脂糖凝胶中可显示出清晰的特异性条带,基因测序分析结果显示出不同剪接体的剪接位点。结论本研究建立的方法可对RHCE mRNA剪接体进行半定量检测,具有较强的可行性,为RHCE基因多态性和抗原表达的研究提供了依据。

摘要：目的研究B7.2基因在肿瘤免疫方面作用,从人外周血单核细胞中克隆人B7.2基因的全长基因,并构建含此基因的重组质粒。方法根据人B7.2基因序列设计特异引物,用RT-PCR、巢式PCR方法扩增B7.2基因的全长基因,并构建至PGEM-T载体中,测序鉴定后进行序列分析。结果成功构建B7.2/PGEM-T重组载体,并发现一种新的B7.2异常的剪接体,保留第1,2,3,5外显子,第四外显子全部缺失,共144 bp,其编码蛋白质由此缺少一段跨膜结构。结论新剪接体在灵长类动物中的存在可能是个普遍现象,其对细胞功能有待进一步的研究,为研究B7.2编码蛋白质的结构和生物学功能及其在肿瘤中的作用奠定基础。

摘要：目的通过对野生型RhD mRNA序列分析,研究其变异产生规律及其编码的氨基酸变化情况。方法采用两段拼接的方法设计RhD mRNA扩增引物以避免RhCE mRNA的干扰,通过PCR-SSP及基因测序检测了27份随机选取的无亲缘关系无偿献血者样本,分析其RhD mRNA基因突变频率及氨基酸表达变化情况。结果所有标本中均含有由RHD 10个外显子组成的RhD mRNA全长剪接体,且存在22种点突变,其中11处点突变可导致氨基酸序列发生改变,667T>G(2/27,7.41%)、697G>A(1/27,3.70%)两处点突变导致223F>V、233E>K氨基酸的改变发生在胞外区,其余氨基酸改变发生在胞膜或胞内区。结论野生型RhD mRNA全长剪接体序列及其编码的氨基酸具有多态性。