摘要：动物行为是动物福利的核心部分,是可持续的动物育种的基础。在驯化过程中,动物已在行为和一系列其它显著特性方面产生适应性。我们对原鸡和白莱亨蛋鸡(为产蛋而选,间接为产肉而选)的行为进行了比较。原鸡在群居、探索、抗捕食和进食试验方面表现出更积极的行为。对一只原鸡与白莱亨鸡杂交后代进行的定量特性位点(QTLs)基因组扫描显示,不同的特性具有一些明显的或启示性的QTLs。一些生产QTLs与行为QTLs相重合,表明生物多向性效应对育种显型的发展也许是重要的。我们定位了一种基因,它对成为啄毛行为受害者方面有强烈影响,而啄毛是一种有害的行为紊乱现象。现代基因学配以行为分析,也许有益于未来设计出更加可持续的育种方式,培育出耐力更强的动物。

摘要：Julia语言是高性能、动态编译的高级计算机语言,具有极强的灵活性,适合于解决数值和科学计算问题,拥有与传统的静态型语言相媲美的执行速度,Julia语言的开发目的是创建一个功能强大、易用性好和高效的单一语言环境。在动物育种中使用Julia语言可以编写语法简洁,且运行速度接近于Fortran或C++编写的程序。该文提供了7个动物育种中常用程序的Julia代码及示例,包括计算分子血缘相关矩阵(A)、分子血缘相关逆矩阵(A-)、近交系数、设计矩阵、分块矩阵,混合模型方程组(MME)和基因组关系矩阵(G)。这些代码可以为编写动物育种实用程序及相关教学活动奠定基础。

摘要：表观遗传是一类没有产生DNA碱基序列的改变但表型特征却发生变化的调控机制,同时这种变化是可以遗传给后代的。DNA甲基化是DNA分子上的胞嘧啶在DNA甲基转移酶的作用下与一个甲基基团共价结合,被修饰为5-甲基胞嘧啶,进而调控基因表达的一种表观遗传形式。多项研究表明,DNA甲基化对动物的抗病性能、生产性能、繁殖性能均有不同程度的影响,因此探明DNA甲基化的表观遗传机制,能够为分子育种提供理论依据,将有助于更好更快的选育新品种或品系,并充分发挥其遗传潜力。

摘要：利用遗传修饰技术可以使动物在遗传水平发生改变,实现在个体内表达外源基因或对其内源基因的功能造成影响。在动物育种中,可以利用遗传修饰技术在分子水平进行设计并实现品种的快速改良。从传统的遗传修饰技术、病毒载体、精子载体等介导的遗传修饰技术到新型人工核酸酶介导的基因编辑技术,尤其是CRISPR/Cas9为代表的人工核酸酶的运用使得基因编辑动物的制备变得更加高效快捷,并迅速在多个物种中得到应用。这些方法也已经拓展到了绵羊(Ovis aries)遗传育种领域。利用遗传修饰技术在绵羊中进行分子育种比传统的育种方式具有更大的优势,可以使用多种策略直接对性状进行快速改良,并且可以加快育种进程。本文详细介绍了遗传修饰技术在绵羊中的研究历程,探讨了通过遗传修饰技术进行绵羊分子设计育种的可能性,并提出以上技术和方法在绵羊育种中面临的问题和挑战。

摘要：为了对多仔动物所构成的"全同胞半同胞"混合家系,在不能获得详细系谱资料的情况下,快速、有效的计算抽样群体期望亲缘系数,使用递归和迭代设计特定算法,实现对后代随机抽样情况下样本个体在家系内各雌亲间分布情况的计算,并对各种符合参数要求的样本后代分布进行同胞对数和频数的统计,最终实现抽样群体期望亲缘系数的计算机自动求解和输出。对采用本算法和近似公式计算得到的亲缘系数进行对比分析,结果表明:当雌亲数d≥5时,2种方法计算的亲缘系数差值<0.01;当d≥50时,两者差值<0.001。本算法适用于多种参数组合混合家系期望亲缘系数的计算;依照本算法编制程序计算亲缘系数,计算结果精确,运行速度快。本算法可为动物遗传育种工作提供比较可靠的参数估计。

摘要：基因组测序技术的发展为我们提供了研究家畜重要经济性状遗传基础的契机。家畜和人类医学中的全基因组关联分析表明单个数量性状基因座(QTL)的效应是非常微小的。这一结论促使利用高密度单核苷酸多态性(SNP)信息进行基因组选择方法的研究。结合新的统计学方法,并检测基因组数据的特征无疑是进行基因组研究和实验设计的基础。准确的掌握基因组数据的特征可以为QTL检测和研究数量性状的遗传基础提供坚实的研究基础。但是,海量的基因组数据量加大了研究基因组数据特征的难度。本文中,我们讨论了研究基因组时代动物育种研究中基因组数据基本特征及其必要的统计学基础。此外,我们还提供了分析基因组特征的简单示例和Julia语言代码。在此基础上,我们讨论了在全基因组测序数据和系统分析等情况下,基因组数据基本特征分析所面临的挑战。

摘要：中国畜禽品种资源丰富,且有许多优良性状基因,但这些优良性状基因并没有被充分利用,因此,在基因水平上开展遗传资源的开发和利用是畜禽经济性状改良的重要方向。目前,虽然传统系谱选择方法在育种工作中发挥了重要作用,但存在准确率低、育种周期长等缺点。随着分子生物学技术的快速发展,近年来先进的基因组测序和基因分型技术大大促进了畜禽育种方法的革新。从低通量、耗时的限制性片段多态标记(RFLP)到如今高通量、高密度的单核苷酸多态性(SNP)标记,基因检测效率有了大幅度提高。基因芯片技术在分子标记辅助选择和全基因组选择育种研究中逐渐得到广泛应用,成为畜禽育种的新技术手段和新热点。主要介绍了高、低密度SNP芯片技术在畜禽育种中的研究及应用,并简述了其技术优势、存在问题及挑战、应用展望,旨在表明基因芯片技术必将会成为畜禽分子育种工作中一项重要的基础技术,在畜禽种业快速发展过程中起到重要的推动作用,以期为基因芯片技术在畜禽育种中得到进一步应用提供理论参考,推进中国畜禽育种遗传进展,提升中国畜禽种业的科技竞争力。