摘要：传统基因测序数据生成方法对聚类的起始和终止判断不准确,导致测序数据生成速度慢,且无法对基因特征实现精准表达。为强化描述测序数据与基因之间的关联程度,优化基因测序数据生成效率,提出云计算下的基因测序数据并行化生成方法。利用主成分分析法,建立初始数据特征子集,获取综合数据指标,构建描述特征集合的系数矩阵,计算特征值与特征向量,保留方差贡献值较高的数据,完成降维处理。设计具有应用层、服务层与资源层的云架构体系,确定云平台组件。结合基因数据发展特征,验证基因中是否存在污染物,控制测序数据质量;根据聚类算法的反单调特性,将最小矩阵作为起点,通过阈值判断能否生成聚类。当聚类结束时,得到生成的并行化测序数据。实验表明,上述方法效率高,且生成的数据能够准确表达出基因特性。

摘要：1.底层逻辑指从事物产生的根本原因出发,在事物的本质层面去认识、分析、解决问题的思路方法和思维方式。2.艺术、艺术价值与其相关的认识较多,在本文有两层含义,一是奇石蕴含的人工艺术之美及相应美学价值,二是奇石的主题、文化内涵和人文价值。3.自然美本文没有用“自然美”的概念,而是根据赏石活动的特点,提出“天然奇趣”一词。二者多近似处,但后者应更便于被理解。

摘要：基因是遗传的基本单元,是DNA或RNA分子上具有遗传信息的特定核苷酸序列,它不仅与生物体的生、老、病、死等一切生命现象直接相关,也是决定生命健康的内在因素,下一代基因测序仪的研制目标是希望能够将基因测序的成本大幅度降低,测序速度快速提高,推进基因组技术的个性化医学走向现实,基于固体纳米孔的基因测序是最有可能实现高通量的物理测序技术,但目前面临生物分子电信号的信噪比低、生物分子过孔速度太快以及生物分子在纳米孔内的输运规律缺失等挑战,设计多模式纳米孔传感器,通过多模式信号交叉对比,同时降低纳米孔长度等方法,是提高检测灵敏度的有效方法,借鉴生物纳米孔对DNA过孔速度的控制,利用磁场、声叉等外力场可以为单碱基的辨识奠定基础,当纳米通道的几何尺寸小于双电层厚度时,基于连续理论的泊松-玻尔兹曼方程和纳维-斯托克斯方程将面临挑战,建立纳通道内生物分子输运规律将丰富流体力学的研究内容。

摘要：[背景]高速公路收费站空气污染严重,收费人员存在较高的职业暴露风险,亟须研发适用于高速公路收费岗亭气载颗粒物和微生物病原体的净化方法。[目的]验证低温等离子体空气净化器对高速公路收费岗亭室内气载颗粒物和微生物的净化效果。基于对照干预实验设计,选取某高速公路收费站三个收费岗亭作为测点,开展6 d的现场对照干预实验(无干预期:前3 d未开启低温等离子体净化器;干预期:后3 d每天9:00-17:00开启净化器)。实验期间持续监测室内外等效直径小于2.5μm(PM_(2.5))和小于10μm(PM_(10))的可吸入颗粒物浓度;每天上午(9:00)、中午(12:00)和下午(17:00),使用浮游微生物采样器采集收费岗亭室内外空气样品,分析气载细菌总数;每天9:00-17:00采用智能中流量颗粒物采样器持续采集最外侧出站口室内的气载颗粒样品,使用基因测序分析样品内含细菌和真菌种属明细及其相对丰度。采用独立样本t检验比较干预期和无干预期室内气载PM_(2.5)、PM_(10)和细菌总数的浓度差异;采用α多样性分析、β多样性分析和t检验(两组比较),比较干预期3 d和无干预期3 d气载颗粒样品内含细菌和真菌具体种属及样品内含典型致病细菌和真菌病原体种属的物种多样性和相对丰度差异,以反映低温等离子体空气净化器对气载PM_(2.5)、PM_(10)和微生物的净化效果。[结果]干预期室内PM_(2.5)和PM_(10)浓度及细菌总数的均值均低于无干预期室内均值(P<0.01或P<0.001);干预期PM_(2.5)和PM_(10)的室内浓度/室外浓度值(I/O)均低于无干预期(P<0.001);但干预期细菌总数的I/O值与无干预期比较,差异无统计学意义。以上午9:00收费岗亭室内PM_(2.5)的平均浓度为基准,中午12:00和下午17:00的室内PM_(2.5)平均净化率分别为49.0%和46.1%,PM_(10)为49.7%和45.4%,细菌总数为50.8%和49.9%。β多样性分析显示干预期和无干预期细菌种水平,真菌属水平和种水平上的物种组成成分均存在差异。与无干预期相比,干预期颗粒样品内含乳杆菌属等10种细菌和圆酵母菌属等7种真菌的相对丰度更低,但干预期枝孢霉科未分类属、多臂菌属和尾孢菌属真菌的丰度更高(均P<0.05)。对于典型致病菌,干预期乳杆菌属细菌和狭窄梭菌属细菌的相对丰度分别降低了73.5%和86.9%,干预期篮状菌属真菌降低了53.5%,差异均有统计学意义(P<0.05)。[结论]低温等离子体空气净化器对高速公路收费岗亭室内气载PM_(2.5)、PM_(10)和浮游细菌具有较好的净化效果,但对室内气载颗粒内含部分真菌的净化作用可能有限。

摘要：新引的路易斯安那鸢尾在陆地栽培条件下易发生叶部病害,严重影响了其景观价值。为对陆生路易斯安那鸢尾叶部病害的精准防控提供科学依据,开展了陆生路易斯安那鸢尾叶部病害病原分离与鉴定研究。以陆地栽培的路易斯安那鸢尾病叶为试材,采用组织分离法、柯赫氏法则对病原进行分离和致病性检验,以及采用对致病病原菌的形态学观察分析和分子生物学鉴定等方法,研究鉴定了陆生路易斯安那鸢尾叶部病害的病原种类。结果表明,从病组织中分离出了6种真菌YW1~YW6,鉴定出5种为致病真菌(YW1,YW2, YW4, YW5, YW6);其中YW1为镰刀菌属藤仓镰刀菌(Fusarium fujikuroi);YW2、YW6分别为枝孢属枝状枝孢菌(Cladosporium cladosporioides)、甘薯内寄生菌(Cladosporium anthropophilum);YW4、YW5分别为青霉属扩展青霉(Penicillium expansum)、皮落青霉菌(Penicillium crustosum)。本研究结果丰富了路易斯安那鸢尾叶部病害的病原,为陆生路易斯安那鸢尾叶部病害的综合防控提供了科学依据。

摘要：纳米孔测序作为最新一代的基因测序技术,在生物医学和临床应用中起着至关重要的作用。测序系统中的MEMS结构通常采用传统光刻工艺来实现,本文首次运用紫外纳米压印光刻(UV-NIL)工艺来验证实现纳米孔测序系统中的MEMS芯片的可能性。采用传统光刻工艺,制造了3种用于纳米孔测序的MEMS双层结构的硅晶圆。这些硅晶圆被用作母板,将其MEMS结构图案精准复制到聚二甲基硅氧烷(PDMS)上,形成压印软模,再用UV-NIL工艺在硅基底上压印出所需的MEMS结构。最后,通过光学和电学两种测试表征手段,成功证实UV-NIL工艺在制造MEMS芯片方面的有效性和可行性。相较于传统光刻,UV-NIL的成功运用将极大提高工艺稳定性并大幅缩减成本。

摘要：目的　构建恶性疟原虫CTP基因的测序重组质粒和真核表达重组质粒 ,以便进一步研究CTP基因的结构与功能。方法　根据已发表恶性疟原虫CTP基因的序列〔1〕,设计并合成一对引物。将扩增的CTP基因的PCR产物连接于测序载体pUC19上 ,经测序反应确定无误。用HindⅢ和BamHⅠ双酶切将CTP基因从测序载体中切下 ,构建于真核表达载体pcDNA3上。 结果　构建了恶性疟原虫CTP基因的测序重组质粒 ,并对其进行了测序。并将恶性疟原虫的CTP基因从测序重组质粒中切下 ,克隆进真核表达重组质粒 pcDNA3。 结论　成功地构建了恶性疟原虫CTP基因的测序重组质粒和真核表达重组质粒 。

摘要：目的建立适合检测中国汉族人群MN血型GYPA基因的测序技术,用于中国汉族人群MN血型基因的分子遗传背景及遗传多态性的研究。方法根据GenBank的NG-007470基因参照序列,自行设计GYPA基因第1—7外显子共7对引物,以随机选取的55份中国汉族人群标本的DNA为检材,探索最佳反应体系与PCR扩增条件,同时扩增GYPA的第1—7外显子,含括了GYPA基因的全长外显子序列。使用PrismTM ABI3730XL DNA测序仪进行碱基序列分析,以Oligo分析软件分析碱基序列。检测结果的可靠性通过血型血清学、PCR-SSP基因分型方法进行验证。结果应用该方法可以在同一扩增条件下同时扩增GYPA基因的全部外显子,同步检测到GYPA基因共7个外显子的碱基序列,55份标本的基因测序结果与血清学、PCR-SSP基因分型结果完全一致。结论本研究的GYPA基因测序方法准确、可靠,适用于中国汉族人群的GYPA基因测序。

摘要：对国内A型肉毒杆菌毒素基因测序,分析了解毒素基因结构并推测其氨基酸序列。提取肉毒杆菌总DNA,利用自行设计的引物对目的基因进行PCR扩增,把目的基因导入***109,筛选含目的基因的阳性克隆菌进行测序和分析,从而了解毒素基因结构并推测其氨基酸序列。对A型肉毒杆菌毒素基因的核苷酸序列成功测序并与GenBank中的相应序列比较,其序列同源性为96%。推测其氨基酸序列同源性为100%。成功地对A型肉毒杆菌毒素的基因进行了测序,这为肉毒杆菌毒素中毒的快速诊断,以及进一步探求以基因工程方法生产此毒素奠定基础。

摘要：目的：应用基因测序仪对肿瘤及相关疾病进行临床病理基因直接测序，以指导医疗保健、疾病预防、基因治疗。方法：石蜡组织、血液标本提取DNA，经凝胶成像及核酸定量仪定量、定性，设计相应的引物及购买测序试剂盒，经PCR扩增后进行基因测序，通过Seq—Scap软件诊断分析测序结果，并对阳性结果做反向测序证实。结果：石蜡组织标本DNA提取成功率80％，总提取成功率90％以上，在此基础上的PCR扩增、纯化及测序成功率达99％。测序基线平整，平均信号强度在200—1000之间，噪音〈5，Raw基线接近0。预报分子靶向药物治疗有效率及无效率均达100％。结论：临床病理基因测序是癌症基因组计划的核心内容，基因测序技术可以快速准确地完成肿瘤基因序列分析，该技术重复率高、结果可靠、科学性强，是分子病理学发展的一个重要新领域。