摘要：从多肽序列的一级结构出发,基于多肽序列中氨基酸侧链间距离和氨基酸侧链的电性特征,构建了多肽序列特征矢量,简称ζ矢量,选取文献中主要组织相容性复合物(MHC)中的14个A^d限制性和14个非A^d限制性多肽序列作为训练集建立辅助性T细胞(helper T lymphocytc,Th)表位预测的定量模型,为了检验该预报系统的精确性,进行了随机抽样检验和交互检验。结果表明,该预报系统具有稳定性好、预测能力强的特点,该方法可用于人的MHC Ⅰ和Ⅱ类表位的预测、蛋白质抗原免疫识别、亚单位疫苗分子设计及研制。

摘要：拟建立Th细胞表位预测的自动化、程序化方法。从多肽序列的一级结构出发,将各氨基酸侧链看成一个整体即拟原子,并基于多肽序列中氨基酸侧链间距离和氨基酸侧链的电性特征,构建了能描述多肽序列结构特征的序列特征矢量,简称ζ矢量。选取文献中MHC限制性为14个Ad限制性和14个非Ad限制性多肽序列,分别定义为活性和非活性肽,并以之作为训练集来建立Th细胞表位预测的定量模型。为检验该预报系统的精确性,进行了随机抽样检验和交互检验,结果表明,该预报系统具有稳定性好、预测能力强的特点,该方法还可推广用于人的MHCI、II类表位的预测研究,可望在蛋白质抗原免疫识别、亚单位疫苗分子设计及研制中发挥重要作用。