摘要：底栖动物是淡水生态系统中物种多样性最高的类群,也是应用最广泛的水质监测指示生物之一。传统的底栖动物监测以形态学为基础,耗时费力,无法满足流域尺度大规模监测的需求。环境DNA-宏条形码技术是一种新兴的生物监测方法,其与传统方法相比优势在于采样方法简单、低成本、高灵敏度,不受生物样本和环境状况的影响,不依赖分类专家和鉴定资料,能够快速准确地对多个类群进行大规模、高通量的物种鉴定。然而,在实际应用中该方法的效果受诸多因素的影响,不同的方法、流程往往会产生差异较大的结果。鉴于此,着重分析总结了应用环境DNA-宏条形码技术监测底栖动物的关键影响因素,包括样品采集与处理流程、分子标记选择、引物设计、PCR偏好性、参考数据库的完整性及相应的优化。并基于此探讨了提高环境DNA宏条形码技术在底栖动物监测效率和准确率的途径,以期为底栖动物环境DNA-宏条形码监测方案的制定提供可靠的参考。最后对该技术在底栖动物监测和水质评价中的最新发展方向进行了展望。

摘要：茵陈来源于菊科植物滨蒿Artemisia scoparia或茵陈蒿***。为了科学准确地鉴定批量茵陈样品的基原及混伪情况,该研究采用了一种基于多种分子标记联合应用的综合方法。研究基于GenBank上茵陈蒿、滨蒿及其他常见蒿属植物的ITS2序列,使用MEGA软件构建系统发育树,评估ITS2序列鉴定效果,并通过组装茵陈蒿的叶绿体基因组,与已发表的茵陈蒿和滨蒿的叶绿体基因组进行比对,开发DNA微条形码(mini-barcode)。将ITS2序列与所得mini-barcode联用进行Sanger测序鉴定单株茵陈样品,结合DNA宏条形码技术鉴定批量茵陈样品。研究结果表明,ITS2序列能够区分中药茵陈与其他易混伪的同属物种,但无法区分茵陈蒿与滨蒿。基于叶绿体基因组的比对结果,选择rpoA—rps11区域作为mini-barcode的开发区域,并设计了能够准确区分茵陈蒿与滨蒿的特异性引物。最终,不同产地的单株代表性茵陈样品及批量茵陈样品的鉴定结果均为茵陈蒿。通过该研究所建立的ITS2与mini-barcode联合鉴定方法,为不同产地批量茵陈的准确鉴定提供了科学依据,为稳定的药材供应提供了支持。