摘要：根据已发表的乙型脑炎病毒核苷酸序列，设计合成了１９寡核苷酸，作为检测该病毒的基因探针。以大肠杆菌ＤＮＡ聚合酶ＩＫｌｅｎｏｗ片段标记合成的寡核苷酸后，经过分子杂交证明该探针能检测出１ｐｇ靶ＤＮＡ或ＪＥＶ感染Ｃ６／３６细胞６小时后的病毒。

摘要：目的:探讨寡核苷酸微阵列制备中适合使用的探针浓度、探针缓冲液pH值、离子强度、优化杂交条件。方法:选取人白细胞抗原DQA1位点,针对多态性集中的外显子2设计一对保守引物及16条特异性分型探针;分别用ddH2O和0.1、0.2mol/L碳酸盐缓冲液(pH=7)稀释探针至100μmol/L;选取合适的缓冲液浓度后,调碳酸盐缓冲液为5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0等6种pH值,选取最优pH值及离子强度,分别溶解探针至20、50、100、200μmol/L,比较上述不同条件的杂交结果。结果:用0.1mol/L、pH9的碳酸盐缓冲液溶解探针杂交效果最佳;探针浓度为20μmol/L时信号弱,其他浓度下无显著差别。结论:通过探针制备的优化可以提高杂交效率,探针浓度与杂交信号强度无明显正相关。

摘要：目的设计肠道病毒71型(EV71)诊断芯片的寡核苷酸探针。方法使用NCBI获取全基因组序列,利用BLAST系统对基因序列进行比对,获取特异性序列;利用Array designer4.2对其进行寡核苷酸探针设计。结果设计出12条60mer寡核苷酸探针,为芯片的制备做准备。结论将BLAST系统和Array designer4.2软件相结合,能快速有效地设计出诊断芯片的探针。

摘要：【目的】设计梅毒螺旋体寡核苷酸探针,筛选出适合芯片检测的高敏感性和特异性寡核苷酸探针。【方法】根据梅毒螺旋体特异基因设计寡核苷酸探针,人工合成探针后制备寡核苷酸芯片。提取梅毒螺旋体的DNA,采用通用引物联合标记法进行标记,标记样品与芯片杂交,用芯片扫描仪检测杂交结果。【结果】设计出23条50 mer梅毒螺旋体寡核苷酸探针。标记样品与芯片杂交部分探针有较强的杂交信号,并筛选出符合要求的9条梅毒螺旋体寡核苷酸探针。【结论】以上方法能设计和筛选出敏感性和特异性较高的梅毒螺旋体寡核苷酸探针,可用于制备梅毒螺旋体寡核苷酸芯片。

摘要：核酸二级数据库是生物信息学研究的重要领域 ,对生命科学的研究和发展起重要作用 .目前 ,国际核酸序列公共数据库中存在大量的细菌 16SrDNA序列 ,本文利用这些已知细菌的 16SrDNA序列 ,设计了细菌种特异性的寡核苷酸探针 ,将其结果存入二级数据库 ,以计算机网络为载体 ,开发了界面友好的通过WWW浏览器实现对数据库查询的系统 ,其查询结果形象直观 ,为设计细菌的种特异性寡核苷酸探针提供了参考和帮助 ,从而可加速对细菌分类及鉴定的进程 .

摘要：目的　设计B19微小病毒诊断基因芯片的寡核苷酸探针。方法　以微小病毒B19为例 ,利用BLAST软件对其序列进行比对并获得特异序列 ;利用软件Oligo 6设计特异性高、Tm值接近、长度均一的寡核苷酸探针。 结果　获得 12条 70 mer寡核苷酸探针 ,用于芯片打印及病毒检测。结论　利用BLAST系统和生物学软件Oligo

摘要：为了对 5种常见于保健食品的双歧杆菌 (长双歧杆菌、短双歧杆菌、青春双歧杆菌、婴儿双歧杆菌和两歧双歧杆菌 )进行快速鉴定 ,在 16srRNA基因同源性分析的基础上 ,设计了 5个种特异性寡核苷酸序列 ,对其 3’ 末端用地高辛标记后 ,作为探针与不同种的双歧杆菌DNA进行膜杂交。实验结果显示 ,这 5个寡核苷酸探针除婴儿双歧杆菌种特异的探针PIN DIG与短双歧杆菌有较弱的交叉反应外 ,其余均表现出较好特异性。说明这些

摘要：目的 :该研究旨在采用分子生物学技术 ,从基因水平上对深圳市某医院及河北辛集地区发生术后及注射后龟分枝杆菌暴发感染的临床分离株进行鉴定 ,并建立一套快速的的鉴定龟分枝杆菌脓肿亚种的探针杂交方法。方法 :根据龟分枝杆菌脓肿亚种标准株 16S - 2 3SrDNA间隔区序列测序结果 ,设计一对寡核苷酸探针 ,对其敏感性、特异性及其对临床标本和临床分离株的检测进行了研究。结果 :探针检测PCR扩增产物敏感性为 1ng ,只与龟分枝杆菌脓肿亚种杂交 ,与 5 6株龟分枝杆菌脓肿亚种临床分离株全部杂交 ;检测 5 7株临床标本阳性率为 6 6 .6 %。结论 :探针检测从基因水平上再次确认引起这两次暴发感染的致病菌为龟分枝杆菌脓肿亚种 ,结果快速可靠。

摘要：以含编码NBS及LRR结构域序列的PCR扩增产物作标准对照,根据P-LOOP模体及LRR结构域氨基酸序列设计寡核苷酸探针,应用Southern杂交定量检测甘薯基因组中NBS与LRR序列的拷贝数目。结果表明,甘薯基因组中存在多个拷贝的NBS与LRR编码序列,经计算初步获得了其在基因组中的拷贝数目,为揭示甘薯抗病分子机制及植物抗病分子育种打下基础。

摘要：用三苯甲基巯基乙醇与氯化甲氧基吗啡啉亚磷酰胺连接得到一种亚磷酰胺试剂 ( III)。用该试剂通过固相合成仪合成了 5′末端巯烷基修饰的寡核苷酸 ,用 Ag+ 脱去巯基的三苯甲基保护后与 ω-碘己基修饰的荧光基团反应 ,得到相应的荧光标记寡核苷酸探针。设计的 lmb H筛选探针与质粒 DNA进行杂交 ,杂交结果验证了这种标记的实用性 ,灵敏度可达 1