摘要：通过对白粉病菌诱导的小麦叶片cDNA文库的测序,获得1个与水稻Rab5B基因一致性达89%的序列。以该序列为信息探针,筛选小麦EST数据库并进行电子拼接。根据拼接结果设计引物,利用RT PCR方法获得了1个小麦中尚未鉴定的全长cDNA克隆Tarab5B。Tarab5B基因编码的蛋白具有结合gTP/gDP的4个保守结构域以及Rab家族成员所特有的结构域。同源分析表明,该基因属于Rab5B亚族。麦类Rab5B蛋白的gDSgVgKS、DTAgQE、NKAD、ETSA和MgC SSS5个结构域在进化上非常保守,而YYRgA结构域及其邻近的C端6个氨基酸残基在小麦材料间同源性很低。RT PCR检测显示,抗、感两个材料Tarab5B基因在接种后24h和未接种24h的表达水平基本相同;在接种后1h、4h、7h、12h,抗、感两个材料间Tarab5B基因的表达水平有一定差异。

摘要：[目的]利用比较基因组学方法,对药用模式真菌灵芝的基因组中的小g蛋白基因家族成员进行系统的预测分析和比较。[方法]利用真菌物种中已经报道的小g蛋白,对灵芝全基因组进行BLAST分析,筛选出所有灵芝的小g蛋白基因,并分析这些同源小g蛋白的基本特性。通过小g蛋白家族的进化树分析和功能域分析,解析灵芝小g蛋白家族成员的进化关系。设计每一个小g蛋白同源基因的特异性引物,通过实时荧光定量PCR检测小g蛋白同源基因的表达。[结果]在灵芝中发现了29个小g蛋白家族基因,其中Ras亚家族4个,Rho亚家族4个,Rab亚家族12个,Arf亚家族7个,Ran亚家族1个,还有1个线粒体小g蛋白。菌丝体中有28个小g蛋白基因表达。[结论]根据真菌中已知的小g蛋白系统性地分析了灵芝的小g蛋白家族成员,进行灵芝小g蛋白的特性分析和基因实时荧光定量PCR检测,为下一步研究灵芝小g蛋白家族成员的功能奠定基础。