摘要：传统的技术手段已逐渐难以适应现代生物技术的发展,随着以16S rRNA为代表的第二代高通量测序技术飞速发展,微生物群落多样性研究已进入分子时代,但要分析庞大的测序数据并从中找寻存在的关联还是给生物学家带来诸多现实困难.为帮助研究者更快更好地掌握微生物群落多样性的信息,开发了AVMCD(analysis and visualization of microbial community datasets)生物信息平台,提供基于16S rRNA测序的专业在线分析及可视化服务.AVMCD坚持友好快捷的交互方式,注册用户只需上传待分析的数据,根据提示简单设置参数,即可由平台自动展开专业的序列分析,并将结果以丰富的可视化形式呈现给用户.

摘要：溴酸盐是一种致癌性物质,其是由含有溴离子的水体经过臭氧或加氯消毒后产生的消毒副产物。为了探索溴酸盐降解的有效方法,论文从溴酸盐的形成机制入手,设计了一种旋转电极生物膜反应器(RBER)系统,试图将溴酸盐还原为溴离子。结合实验过程来看,溴酸盐和硝酸盐对氢电子供体存在明显的竞争关系,且后者的竞争能力要稍强于前者。基于此,论文分别对不同阶段生物膜的微生物群落多样性进行了分析,确定了其中的优势菌群。

摘要：设置4个采样点分析长荡湖6个理化因子的分布特征并综合评价水质现状,同时基于16S rRNA高通量测序技术对微生物群落进行调查。结果表明:丰水期长荡湖南部片区污染最为严重,其中超标因子为TN、TP;但长荡湖总体水质达标。长荡湖共检测出微生物群落32门378科467属;不同片区优势菌门、科、属种类相似,但相对丰度却有所差异。Alpha多样性分析结果显示,长荡湖微生物群落多样性和丰富度呈现北部片区>东部片区>南部片区>中部片区的规律;且长荡湖微生物群落与空间位置、外源输入有关。这为长荡湖污染防治和生态修复提供了数据支撑。

摘要：为揭示土壤微生物群落对持续玉米秸秆还田的响应机制,采用单因素随机区组设计,以秸秆不还田(T0)为对照,设3000 kg/hm^(2)(T1)、6000 kg/hm^(2)(T2)、9000 kg/hm^(2)(T3)、12000 kg/hm^(2)(T4)4个秸秆还田量。采用磷脂脂肪酸(PLFAs)指纹图谱的方法,研究了连续6年玉米秸秆还田管理后土壤微生物群落组成的季节性变化特征,分析了土壤基本理化及生物学性状与土壤微生物群落组成、玉米产量间的关系。结果表明:持续秸秆还田后,土壤中全氮、总碳、碱解氮含量和土壤呼吸强度增加,土壤pH值降低。持续秸秆还田能增加土壤微生物群落的PLFAs含量;玉米大喇叭口期对应土壤细菌、革兰氏阳性菌(G+)、革兰氏阴性菌(G^(-))的PLFAs含量在T0与T1间有显著差异(P0.05);T3、T4处理在玉米成熟期对应土壤细菌、G^(+)、G^(-)、真菌、放线菌的PLFAs含量与T0间有显著差异(P0.05),但9000 kg/hm^(2)(T3)和12000 kg/hm^(2)(T4)的秸秆还田量显著提高了土壤真菌/细菌(F/B)的比值。Pearson相关分析表明,土壤全氮、总碳、碱解氮、速效钾、pH值及土壤呼吸强度是影响土壤微生物群落组成及玉米产量的主要因素。持续玉米秸秆还田后,以PLFAs表征的土壤微生物群落具有明显的季节性变化特征;土壤全氮、总碳是驱动土壤微生物群落生物量变化的主要因素,连续不同玉米秸秆量还田未对玉米产量产生影响。

摘要：选取4只1.5岁龄、体重约35kg安装了永久性瘤胃瘘管的小尾寒羊公羊,采用4×4拉丁方设计,在精粗比为1∶1的日粮条件下,研究口服"有利"剂量(1.0mL/kg日粮)和"不利"剂量(3.0和4.0mL/kg日粮)福尔马林时瘤胃微生物群落的变化。结果表明,绵羊分别口服福尔马林0,1.0,3.0,4.0mL/kg日粮,其瘤胃液细菌总数分别为(120.69×109±17.49×109),(191.11×109±20.27×109)(P<0.01),(94.56×109±13.01×109)(P<0.05),(79.60×109±12.89×109)(P<0.01)CFU/mL;原虫总数分别为(9.85×105±0.66×105),(5.02×105±0.56×105)(P<0.01),(1.70×105±0.36×105)(P<0.01),(1.13×105±0.36×105)(P<0.01)CFU/mL;瘤胃液平均氨态氮浓度分别为(25.84±6.65),(21.57±6.07)(P<0.01),(15.54±4.41)(P<0.01),(8.91±3.52)(P<0.01)mg/100mL,而日粮自由采食量分别为(2078.4±107.0),(2284.4±55.6)(P<0.01),(1965.8±53.4)(P<0.01),(1854.5±44.9)(P<0.01)g/d。本研究表明,口服福尔马林使绵羊瘤胃液原虫数量减少、氨态氮浓度降低,但在"有利"剂量时,瘤胃细菌总数和自由采食量增加,而在"不利"剂量时,瘤胃细菌总数和自由采食量则降低。瘤胃细菌数量的增减是口服福尔马林产生有利还是不利作用的决定因素。

摘要：以模拟城镇污水厂尾水作为试验用水,对比研究了采用自制的多孔轻质负荷陶粒滤料的生物滤池即新型轻质陶粒生物滤池与普通生物陶粒滤池在系统挂膜启动阶段的生物膜的形成情况及水处理效果,并通过高通量测序探究了该新型生物滤池挂膜启动阶段生物膜微生物群落结构的变化规律。试验结果表明:对比普通生物陶粒滤池(对照组),新型轻质陶粒生物滤池(试验组)能减轻约68.4%的滤层总重量;挂膜启动阶段两组COD_(Cr)和总氮的进水浓度均维持在75 mg/L和15～16 mg/L,试验组出水COD_(Cr)和总氮的平均去除率分别达76.5%和51%,均优于对照组5%左右,且试验组挂膜初期处理优势明显,挂膜启动第1 d时试验组尾水中COD_(Cr)、总氮的去除率分别为61.35%、35.1%,分别超出对照组22.96%、10.1%左右;试验组陶粒的附着生物量始终高于对照组陶粒约20%;微生物群落结构分析结果表明,多孔轻质负荷陶粒滤料生物膜群落结构以变形菌门和拟杆菌门为优势菌门,以黄杆菌纲、β-变形菌纲为优势菌群,挂膜约7 d后微生物群落组成开始趋于稳定,但仍存在缓慢变化,20～27 d生物种群相似度极高,以土壤杆菌属(Agrobacterium)、热单胞菌属(Thermomonas)、土地杆菌属(Pedobacter)、嗜氢菌属(Hydrogenophaga)等为主。文中结果可为城镇污水厂尾水处理出水水质的稳定达标及进一步的提标提供技术参考。

摘要：以中国广东省云浮市(GD)、安徽省合肥市(AH)和陕西省安康市(SX)3个硫铁矿矿渣为研究对象,系统研究了不同地区硫铁矿矿渣理化性质特征和微生物群落多样性、物种组成及其环境驱动因子。结果显示:不同地区硫铁矿矿渣pH、NAG-pH、重金属全量及有效态含量存在显著差异(P<0.05),GD硫铁矿矿渣微生物Shannon指数显著高于AH和SX(P<0.05),不同地区微生物群落组成差异显著(P<0.05);AH、GD和SX的优势门为变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinomycetota),优势属为罗尔斯通菌属(Ralstonia)、硫化芽孢杆菌属(Sulfobacillus)和钩端螺旋菌属(Leptospirillum),均具有耐酸、耐重金属和铁硫氧化等功能;影响矿渣微生物群落结构和组成的主要环境驱动因子包括年均气温、年均降水量、pH、γ、DTPA-Zn、DTPA-Cr和Cu等。研究结果可为硫铁矿矿渣治理和环境修复提供理论依据。

摘要：基于分别运行倒置/常规A2/O工艺的试验系统,研究不同碳源类型条件下两系统微生物群落代谢活性的差异。实验结果表明,不论在何种进水碳源类型条件下,倒置A2/O工艺系统微生物基于Biolog所计算的AWCD(平均色度)值均高于常规A2/O工艺,分别提高15.22%和9.16%,倒置A2/O工艺微生物对碳源的代谢能力以及其代谢活性均高于常规A2/O工艺;进水中挥发性脂肪酸所占比例对工艺微生物群落代谢活性有着显著影响,该比例从60%提高到100%时,倒置A2/O系统和常规A2/O系统AWCD平均值分别提高39%和32%,说明挥发性脂肪酸所占比例越高,对应的微生物群落代谢活性越强;不同工艺的微生物群落结构对进水条件变化的适应程度不同,倒置A2/O工艺系统和常规A2/O工艺系统中的显阳性碳源种类分别减少了2种和4种,说明倒置A2/O工艺系统微生物在进水条件变化时群落结构变化的程度小于常规A2/O工艺。

摘要：在我们每一个人的嘴里都存在一片由几百种细菌组成的“热带丛林”,其中有最简单的细菌、真菌、病毒等。牙膏、牙刷及其它口腔卫生用具生产者常把这片“热带丛林”中的居民形容成一群“歹徒”,而广告给人造成的印象是要避免龋齿或蛀牙 ,必须完全消除这片“热带丛林”。但是实际情况更为复杂。大多数微生物经常栖息在口腔中 ,对此没有什么可惊讶的。在它们栖息的环境中一年四季温暖— 37℃左右 ,经常保持湿润 ,不断有营养物质经过。除了食物以外 ,还常有外来物如手指、铅笔、钢笔等进入嘴里 ,每个外来物上都带有不少新的微生物。在每平方毫米腮组织上 ,在每一个牙龈褶皱里、在舌头的细沟中隐藏有大量的微生物 ,即使是刷干净的牙齿上仍挤满了数以亿计的细菌。大多数专家认为 ,长期生存在人口腔中的微生物种类数量大约有 2 0 0— 5 0 0种 ,其中已研究清楚和已命名的微生物只有 5 0种左右。这些微生物看上去非常不同 :球形、粒形、棒形、苞米棒形、瓶刷形、螺旋形、蛇形。它们聚集在某一个地方 ,或漂浮在唾液中 ,同时使纤毛象螺旋浆一样转动。尽管口腔中微生物种类如此繁多 ,研究人员仍将注意力集中到一种细菌身上——变化无常的链球菌。这是一种圆形细菌 ...

摘要：本研究是为了考察直接饲喂微生物 (DFM)能否用于降低高精料日粮条件下育肥肉牛的酸中毒可能性。 6头安装了瘤胃瘘管的成年阉牛 (预饲高精料日粮 ) ,采用 3× 3拉丁方设计 ,研究 DFM对采食量、瘤胃 p H、瘤胃和血液指标的影响。试验牛饲喂蒸汽压片大麦 ,青贮大麦 ,并分别按87%、9%和 4 %的量 (DM)补饲一种蛋白质盐 ,自由饮水。各处理组如下 :对照组、丙酸杆菌 P15组 (P15 )、丙酸杆菌 P15+屎肠球菌 EF2 12 (PE)。添加的微生物处理组 (细菌数 10 9个 / g) ,以乳清粉作载体 ,单独添加乳清粉作为对照组 ,每天饲喂 1次 ,饲喂量为每头牛每天 10 g。经过 2周的适应期后进行为期 1周的采样测试。瘤胃 p H用内置电极进行为期 6d的连续测定。各处理不影响 (P>0 .0 5 )干物质采食量和瘤胃 p H(p H的平均值 ,最小值 ,每小时时间点和变化范围均小于 5 .8或 5 .5 )。然而与对照组相比较 ,P15处理组的原虫数显著增加 (P <0 .0 5 )。同时瘤胃氨气浓度显著上升 (P <0 .0 1) ,淀粉分解菌显著减少 (P<0 .0 5 )。 PE处理组的牛链球菌数减少 (选择性培养基计数 )。尽管补饲 DFM不影响血液 p H和血糖浓度 ,但 PE处理组的血液 CO2 浓度低于对照组 (可以降低代谢酸中毒的机率 )。虽然研究表明补饲 DFM不能改变干物质进食量 (DMI)