摘要：【目的】抗菌肽是生命体的自身免疫系统的重要组成部分。其中两性的α-螺旋抗菌肽在抗菌肽家族中又占有重要的地位,发挥着重要的作用。为了得到具有更高抗菌活性同时具有很低细胞毒性的抗菌肽,根据α-螺旋二级结构衍生出来的螺旋轮模型,设计了一条在疏水一侧含有8个缬氨酸和亲水一侧含有5个精氨酸的新型16残基抗菌肽。【方法】测定了设计得到的新型抗菌肽的最小抑菌浓度、对于红细胞和哺乳动物肾细胞的细胞毒性以及杀菌动力学。【结果】抗菌活性检测表明,新型抗菌肽VGR16显示了强并快速的杀菌作用,其最小抑菌浓度在16-64μg/mL范围。溶血试验发现抗菌肽VGR16在检测的最大浓度256μg/mL处也未见溶血作用。细胞培养试验表明,抗菌肽VGR16对非洲猴肾细胞仅在很高浓度时具有很小的细胞毒性。【结论】综上可见,抗菌肽VGR16是具有很大抗菌潜力的抗生素替代物。

摘要：拓扑异构酶Ⅰ(TopoisomeraseⅠ,TopoⅠ)抑制剂已成为新型抗肿瘤药物研究的热点.识别靶酶上全新的药物结合位点对于设计、优化TopoⅠ抑制剂具有重要意义,据此设计的化合物不仅可以创新结构类型,克服现有的喜树碱类药物的毒性,而且有望很好地解决与现有的喜树碱类药物的交叉耐药性问题.通过对真核DNA拓扑异构酶Ⅰ蛋白超家族多元序列联配研究,构建了蛋白质系统进化树,并在此基础上采用进化踪迹分析识别得到了人拓扑异构酶Ⅰ上重要功能残基.研究发现,喜树碱分子7,9位周围存在亚家族特异性的疏水性残基Ala351,Met428,Pro431,表明在喜树碱分子对应区域引入疏水性基团取代,会提高抗肿瘤活性.尤其值得注意的是,超家族保守的蛋白残基Lys436,有望成为新型喜树碱类药物改造的重要靶点,据此设计的新型化合物将有望解决喜树碱类药物水溶性差的问题.此外,突变将导致喜树碱耐药性的蛋白残基Asn352,Arg364为真核TopoⅠ蛋白超家族保守残基,由于对接研究已表明它们均不与喜树碱直接相互作用,因此它们将是发现新型非喜树碱类TopoⅠ抑制剂的重要药物结合位点.

摘要：虚拟组合衍生程序能够快速地根据选定的取代基生成大量的虚拟分子,问题在于选择什么样的取代基,才更有目的地控制衍生分子,使它们与受体的结合有更大的成功保障。通过统计数据库中蛋白质残基及其对应的配体取代基,就可以根据目标受体的残基情况,选择那些统计频率较高的取代基,这样比随机地选择取代基会更有目的性,设计的配体更有可能与蛋白质残基有效地发生作用。因此,这是一种新型的、基于数据库信息的概率式取代基选择方法,简称SSDI。SSDI用统计概率的方式,回答了组合衍生所面临的选择什么样取代基的问题。

摘要：目的　通过生物信息学与合成多肽方法 ,寻找SARS CoVS蛋白的抗原表位 ,为抗SARS多肽疫苗的深入研究提供试验依据。方法　利用网络共享软件对与S蛋白抗原性相关的参数进行预测分析 ,从而设计S蛋白的抗原表位多肽 ;将合成的抗原表位多肽免疫家兔 ,用ELISA法检测产生的抗体。结果　ELISA法检测发现 ,设计合成的 2个抗原表位多肽片段 (残基 348 380 ,4 34 4 70 )在家兔体内均能诱导抗体产生。结论　设计合成的 2个抗原表位多肽片段中包含SARS CoVS蛋白的抗原表位 ,免疫家兔后能产生特异性抗体。