摘要：利用３Ｄ－ＱＳＡＲ中的比较分子力场分析法（ＣｏＭＦＡ）研究了标题化合物的定量构效关系。通过不同探针与空间网格点间隙的对比研究，发现以　、空间网格点间隙２０ｎｍ结果为最优。从　值来看，ＣｏＭＦＡ计算得到的模型有很高的预测性。依据ＣｏＭＦＡ系数图设计一些新化合物并预测了它们的活性，结果表明：对抑制革兰氏阳性菌有数种化合物的活性比迄今合成的化合物要高。

摘要：本实验采用“活性类似物法”搜寻到烯丙胺和苄胺类抗真菌化合物的药效构象。其与药物萘替芬、特比萘芬的晶体构象相同。以此构象构建各化合物，采用ｒｍｓｆｉｔ规则叠合各分子，进行ＣｏＭＦＡ研究，得到预测能力很强的抗６种常见致病真菌的３ＤＱＳＡＲ模型。并用８个本实验室设计合成的新化合物和５个文献报道的化合物对模型预测能力进行验证。最后结合２ＤＱＳＡＲ方程首次提出了烯丙胺、苄胺类抗真菌化合物与受体蛋白相互作用模式图。

摘要：运用比较分子力场(CoMFA)和比较相似性指数分析(CoMSIA)方法研究了50个HLA-A* 0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的关系,另外15个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力。结果表明,采用CoMSIA得到的构效关系模型(q2 =0.608,r2 =0.987,F=440.4,SD=0. 111)要明显优于采用CoMFA得到的构效关系模型。在CoMSIA计算中,当引入疏水场时,三维构效关系模型得到明显改善,通过该三维构效关系模型,可较精确地估算预测集中15个CTL表位肽与HLA-A* 0201间的亲和力(r2pred=0. 703,SD=0. 368)。通过分析分子场等势面图在空间的分布,可以观察到表位肽分子周围的立体及疏水特征对表位肽与HLA-A* 0201间结合亲和力的影响,从而为进一步对CTL表位肽进行结构改造并基于此进行治疗性疫苗分子设计提供理论基础。

摘要：建立三环系COX-1和COX-2抑制剂结构与活性的三维定量构效关系模型,为设计新型的具有选择性的COX-2抑制剂提供线索.通过与酶的对接并优化,确定化合物在受体结合腔中的构象,利用比较分子力场分析方法建立三维定量构效关系模型.模型1R_(cv)~2=0.685,最佳主成分数为6,传统相关系数为R^2=0.988,F=726.2,标准偏差S=0.080;模型2R_(cv)~2=0.573,最佳主成分数为6,传统相关系数为R^2=0.996,F=1147.6,标准偏差S=0.034.所得的模型不仅解释了化合物的构效关系,而且对预测集中的化合物有很好的预测能力;比较不同模型的系数相关图,分析了结构与活性、结构与选择性的关系,得到的结果可以指导新化合物的设计与合成.

摘要：二肽肽酶IV是一类用于治疗II型糖尿病具有潜在价值的关键酶, 很多此类酶的抑制剂用于处理此病具有相当好的有效性. 一系列N-取代的甘氨酰氰基吡咯烷衍生物对于二肽肽酶具有高的活性和选择性. 我们使用比较分子力场分析方法建立DPP-IV 抑制剂——N-取代的甘氨酰氰基吡咯衍生物的三维定量构效关系, 该模型为设计用于治疗II 型糖尿病的高效DPP-IV抑制剂提供结构信息. CoMFA模型的交叉验证相关系数q2=0.575, 非交叉验证相关系数r2=0.981,绝对误差S=0.184, F9.68=388.5. 使用七个预测集检验了模型的预测能力. 所得的模型解释了已有的构效关系, 并对同类化合物有较好的预测能力, 该模型可用于指导新型的DPP-IV 抑制剂的设计与优化.

摘要：经活性测试发现,N-硝基脲类化合物对反枝苋(***)和苏丹草(***)呈现除草活性.为进一步设计高活性的目标化合物,采用比较分子力场(CoMFA)对38个N-硝基脲类化合物进行三维定量构效关系(3D-QSAR)分析,建立了相关性显著、预测能力强的3D-QSAR模型(反枝苋:q2=0.674,r2=1.000,R2pred=0.9989;苏丹草:q2=0.635,r2=1.000,R2pred=0.9958).根据CoMFA模型的立体场和静电场三维等势线图可知,在N'-苯环的2和5位引入大体积的正电荷取代基,3位引入负电荷基团,4和6位引入大体积的负电荷基团有利于提高目标化合物对双子叶杂草反枝苋的除草活性;而在2位引入大体积的负电荷基团,3位引入小体积的负电荷基团,4位引入大体积的正电荷基团,5位引入大体积的取代基均有利于提高目标化合物对单子叶杂草苏丹草的除草活性.

摘要：运用比较分子力场 (CoMFA)和比较分子相似性指数分析 (CoMSIA)方法研究了 5 0个HLA A 0 2 0 1限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的关系 ,另外 15个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力 .结果表明采用CoMSIA得到的构效关系模型 (q2 =0 .62 8,r2 =0 .997,F =840 .419)要明显优于采用CoMFA得到的构效关系模型 .在CoMSIA计算中 ,当引入疏水场时 ,三维构效关系模型得到明显改善 ,通过该三维构效关系模型 ,可较精确地估算预测集中 15个CTL表位肽与HLA A 0 2 0 1间的亲和力 (r2pred=0 .743 ) .通过分析分子场等值面图在空间的分布 ,可以观察到表位肽分子周围的立体及疏水特征对表位肽与HLA A 0 2 0 1间结合亲和力的影响 ,从而为进一步对CTL表位肽进行结构改造并基于此进行治疗性疫苗分子设计提供理论基础 .

摘要：组蛋白去乙酰化酶(HDAC)对染色质分布和基因调节起着重要的作用,也是治疗癌症和其它疾病的新靶点.羟肟酸类抑制剂是目前研究最多的组蛋白去乙酰化酶抑制剂.应用比较分子力场(CoMFA)法对一系列磺胺基羟肟酸类HDAC抑制剂进行了结构活性关系研究,得到的模型具有较高的交叉验证系数(q2=0.704).并在此基础上,建立了非交叉验证的偏最小二乘分析(PLS)模型.用该模型对随机选择的6个化合物组成的测试集进行了预测,得到了令人满意的结果,所建模型具有良好的预测能力.本研究对于设计高活性的HDAC抑制剂及抗癌药物都有指导意义.

摘要：目的　建立两环系环氧合酶 2抑制剂的三维定量构效关系 ,设计新型环氧合酶 2抑制剂。方法和结果通过与选定的模板 (III 1)进行叠合 ,利用比较分子力场分析方法建立 2 0个选择性环氧合酶 2抑制剂的三维定量构效关系。该模型的交叉验证系数RCV2 =0 718;传统相关系数R2 =0 992 ,F =2 6 0 6 2 4,标准偏差S =0 0 72。结论所得的模型解释了已有的构效关系 ,并对同类化合物的预测能力较好 。

摘要：目的：建立药物透过血脑屏障的三维构效模型，为药物分子设计提供理论依据。方法与结果：利用比较分子力场分析方法建立了阿片类药物透过血脑屏障的三维定量构效模型，该模型有较高的预测能力，交叉验证系数ｒ２ｃｖ＝０７１８，相关系数ｒ２＝０９７８，Ｆ３，７＝６７９０２，标准偏差ＳＥ＝０２０９。结论：根据ＣｏＭＦＡ模型系数等势图，解释了该类药物透过血脑屏障的构效关系。