摘要：目的　检测不同基因型丙型肝炎病毒 (HCV)非结构 5a区 (NS5a)高免疫原区短链多肽的抗原性 ,确定该区的主要线性抗原表位并探讨基因异质性与免疫原性间的关系。方法　设计并合成特异性多肽 ;DNAStar软件对多肽氨基酸同源性进行比较 ;间接ELISA法检测多肽的抗原性。结果多肽氨基酸的同源性在不同区及不同基因型间变化较大。氨基酸残基 2 2 12～ 2 2 4 1、2 2 72～ 2 30 1和2 30 2～ 2 331的多肽抗原性最强。 18个来自保守区的多肽可以与不同基因型抗 HCV阳性血清起反应 (阳性率高达 96 % ) ;而来自不同基因型间氨基酸序列保守性较低区的多肽抗原性与同基因血清的反应性较高。结论　HCVNS5a高免疫原区主要的线性抗原位于氨基酸残基 2 2 12～ 2 2 4 1、2 2 72～2 30 1和 2 30 2～ 2 331的位置 ;人工合成的多肽可以有效地用于检测抗 HCV抗体 ;

摘要：根据GenBank中猪生殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲株(ATCC VR-2332)基因序列分别设计合成了针对PRRSV ORF3、ORF5和ORF6基因的引物,利用RT-PCR从广东省送检的5份病料中均分别扩增得到了大小约787、630和550 bp的片段,将扩增的cDNA片段克隆入pMD 18-T载体并测序.应用DNAStar软件分析,并与国内外已发表毒株和疫苗株(RespPRRS/Repro、RespPRRS MLV)、LV4.2.1株的序列进行比较.结果显示,这5个毒株与CH-1a、HB-1(sh)、BJ-4、ATCC VR-2332、疫苗株等毒株ORF3、ORF5、ORF6的核苷酸同源性分别为87.2%～98.7%、85.4%～96.8%、91.8%～98.9%,推导的氨基酸同源性分别为84.6%～97.6%、84.5%～95.5%、94.8%～98.9%;而与LV4.2.1株的核苷酸同源性分别为56.1%～58.3%、54.4%～57.0%、62.2%～64.4%,推导的氨基酸同源性分别为53.9%～56.7%、54.0%～57.0%、78.0%～80.3%.基因系统发育树表明,广东省流行的PRRSV与HB-1(sh)株的亲缘关系比较近.

摘要：将疫苗用猫细小病毒(FPV)株提取基因组DNA,针对NS特定片段设计引物,利用PCR扩增出了部分基因并将该基因克隆到pMD18＿TVector中测序。结果表明,该基因长613bp,编码204个氨基酸。分离株基因与犬的细小病毒(CPV)、貂的细小病毒(MEV)毒株核苷酸同源性均为99%。氨基酸同源性达到97%、98%以上,与犬、貂的肠炎病毒有密切的亲缘关系。

摘要：提取成熟香蕉果肉的RNA并分离mRNA,以mRNA反转录合成cDNA,以该cDNA为模板,设计expansin的简并引物,进行RT PCR(退火温度为50℃).得到的扩增产物纯化后与pGEM T Easy载体连接,转化大肠杆菌,任意挑选2个阳性克隆,进行序列分析,结果得到2个序列相同的expansin的cDNA基因片段,命名为MA Exp3(以示与已登录的香蕉MA Exp1和MA Exp2的区别).MA Exp3中存在expansin基因的保守区域,即8个半胱氨酸残基和3个色氨酸残基,它编码177个氨基酸,与MA Exp1的核苷酸同源性为74 2%,氨基酸同源性为86 4%.

摘要：参照GenBank中已发表的绵羊肺腺瘤病毒(JSRV)的全基因序列,设计合成3对引物,对JSRVNM株的gag基因分3段进行PCR扩增,经琼脂糖凝胶电泳分析,分别呈3条531、888和949bp的特异条带,将其分别克隆入pMD 18T载体中,进行序列测定并拼接序列,得到完整的gag基因序列。分析结果表明,与南非代表株(基因序列号NC 001494)的gag基因序列比较,核苷酸同源性为89 0%,推导出的氨基酸同源性为90%。与美国代表株(基因序列号AF105220)的gag基因序列比较,核苷酸同源性为86 3%,氨基酸同源性为87%。

摘要：根据GenBank发表的猪轮状病毒衣壳蛋白vp4基因、vp6基因和vp7基因保守序列,设计合成3对引物,分别扩增猪轮状病毒中国分离株JL94株的此3段基因并进行序列分析。结果表明,JL94株vp4基因与国外分离株CRW-8株、OSU株、Gottfried株、4F株和4S株的VP4氨基酸同源性分别为97.16％、95％、71.88％、73.45％和70.88％;JL94株vp6与CRW-8株、OSU株、Gottfried株、4F株和4S株的VP6氨基酸同源性分别为96.98％、97.48％、93.20％、97.48％和93％;JL94株vp7基因与CRW-8株、OSU株、Gottfried株、4F株和4S株的VP7氨基酸同源性分别为98％、99.90％、75.40％、84.66％和80％。可见JL94株同CRW-8株、OSU株同源性更高些;vp4和vp7基因在同型间高度保守而不同型间差距较大,vp6基因在同群和非同群间差别不是很明显。同时可以判定JL94属于A群Ⅰ亚群G5P7血清型PRV。研究猪轮状病毒中国分离株JL94株衣壳蛋白基因的特征,为研制高效抗病毒疫苗奠定基础。

摘要：根据GenBank上发表的牛种布鲁氏茵SP41基因序列，设计合成了一对特异性引物。从牛A19疫苗中提取全基因组DNA作为模板，PCR扩增出SP41基因，连入pEASY—T3载体，测序结果表明，扩增的片段含有1302个核苷酸，编码433个氨基酸的成熟蛋白，与已报道的布鲁氏菌2308、A-13334、S19、9-941序列的氨基酸同源性为100％；与布鲁氏菌ATCC、CCM4915、M28、M5—90、NI的氨基酸同源性为99．8％。布鲁氏菌SP41基因的克隆，