摘要：泛素化修饰是真核生物中一种重要的蛋白质翻译后修饰,几乎参与调控细胞内所有重要的生命活动过程。近年来,随着泛素化蛋白质富集技术和质谱技术的不断发展,泛素化蛋白质组学研究取得了重大进展。目前泛素化蛋白质组学研究多集中在动物和酵母中,而在植物中开展的相对较少。为了总结植物中泛素化蛋白质组学的最新研究成果,本文对泛素化修饰、质谱法鉴定泛素化位点、泛素化蛋白的富集方法及泛素化蛋白质组学在植物光调节、激素处理和逆境胁迫条件下的应用研究进行综述,为泛素化修饰在植物领域的最新研究提供理论基础。

摘要：细胞内存在多种E3酶对核小体上不同赖氨酸位点进行选择性的泛素化,继而招募下游效应蛋白参与调控不同的细胞进程,如转录激活、基因沉默、DNA损伤修复等.近年来,复杂翻译后修饰蛋白质与其复合体化学合成技术的发展,及冷冻电子显微镜、核磁共振、交联质谱等生物物理技术的进步,促进了E3对核小体进行泛素化反应的化学机制的解析.本文综述了四种E3酶(PRC1、BRCA1/BARD1、RNF168和Bre1)对核小体底物进行特异性泛素化修饰的相关化学生物学、生物化学和结构生物学机制研究进展.这些E3酶均通过经典的“精氨酸锚”结合核小体酸性口袋进行定位,再借助E3酶与其他核心组蛋白以及E2酶与DNA等多价互作方式,控制E2酶的活性半胱氨酸朝向底物的特定泛素化位点,诱导泛素从E2酶向底物的位点特异性转移.这些研究揭示了E3酶选择性泛素化核小体的化学原理,阐明了核小体上位点特异性泛素化的生成机制,为设计药物小分子干预细胞内核小体泛素化水平及治疗相关疾病提供了结构基础.

摘要：目的 构建过氧化物酶体增殖物激活受体γ亚型1(peroxisome proliferator-activated receptor gamma isoform 1,PPAR γ1)、泛素连接酶肌肉环指状蛋白2(ubiquitin ligase muscle ring finger protein 2,MuRF2)和泛素(ubiquitin,Ub)的重组质粒并进行鉴定。方法 根据MuRF2、PPAR γ1和Ub的cDNA序列及GV146和GV417载体质粒上的多克隆位点设计目的基因克隆引物。XhoI/EcoRI内切酶分别双酶切PPAR γ1目的DNA与GV146载体;NheI/BamHI内切酶分别双酶切MuRF2和Ub目的 DNA与GV417载体。用连接酶连接双酶切后的目的 DNA和载体,导入大肠杆菌经筛选获得重组质粒。PCR鉴定重组克隆后进行DNA测序。转染HEK 293T细胞后,于荧光显微镜下观察转染效率;免疫共沉淀实验后用Western blot检测蛋白的表达及蛋白质相互作用。结果 以合成的PPAR γ1、Ub、MuRF2的引物分别对PPAR γ1、Ub和MuRF2的菌落进行PCR扩增,产物大小分别为943、451和1 154 bp,与预期结果一致。测序结果与目的基因序列进行比对分析,证实成功构建出PPAR γ1、Ub和MuRF2的重组质粒。在HEK 293T细胞中共转染His-MuRF2、HA-Ub、PPAR γ1重组质粒,荧光显微镜观察结果提示重组质粒成功转染。免疫共沉淀试验后用Western blot检测可见PPAR γ1、MuRF2和Ub蛋白的有效表达,且验证了MuRF2介导PPAR γ1发生泛素化修饰反应。结论成功构建PPAR γ1、MuRF2和Ub的重组质粒,且三种质粒在HEK 293T细胞中有效表达,验证了MuRF2介导PPAR γ1发生泛素化修饰反应。