摘要：目的 了解大肠埃希菌和弗格森埃希菌dndC基因的携带情况,以及该基因与脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因组降解表型之间的关系,探讨PFGE中菌株基因组降解的原因及处理方法。方法 使用PFGE对450株大肠埃希菌和弗格森埃希菌进行分析,设计引物检测dndC基因的携带情况并进行序列测定。通过dndC基因序列比对和进化树的构建,获得dndC基因型别以及其在不同型别大肠埃希菌中的分布。通过添加硫脲和消毒电泳仪研究基因组降解的处理方法。结果 450株大肠埃希菌和弗格森埃希菌中,降解的菌株为40株(8.89%)。dndC基因阳性菌株33株(7.33%),均出现了降解。大肠埃希菌携带的dndC基因可分为8个群。不同型别大肠埃希菌中均存在dndC基因阳性菌株,且阳性率存在差异。添加硫脲可以有效缓解PFGE分析中dndC基因导致的降解,电泳仪消毒可以缓解全胶降解的情况。结论 dndC基因会导致大肠埃希菌和弗格森埃希菌PFGE分析中基因组降解,添加硫脲可以缓解此降解。

摘要：目的：比较多位点串联重复序列分析（ MLVA）和脉冲场凝胶电泳（ PFGE）对伤寒沙门菌基因分型的能力，构建适合伤寒沙门菌的MLVA分型方法。方法根据国外文献报道选出5个多变的伤寒沙门菌串联重复序列（ VNTR）位点（ SAL02、SAL11、SAL16、SAL20、TR4699）设计MLVA分型方案，运用MLVA分型方案和国际PulseNet公布的沙门菌PFGE分型方案对2002至2007年21株流行病学不相关的深圳社区感染伤寒沙门菌基因分型，比较这两种分型方法对伤寒沙门菌基因分型的能力。结果5个单一VNTR位点对深圳地区伤寒沙门菌的分型能力（ D值）为0.838～0.943；使用MLVA分型方法，获得19种MLVA型别；使用PFGE分型方法，获得19种PFGE型别；两种分型方法的D值均为0.99，且结果完全一致。结论5个VNTR位点的MLVA分型方法可作为一种简单快速准确的基因分型方法用于伤寒沙门菌感染流行的分析。

摘要：[背景]全球军团菌病发病率升高,人工水环境成为其暴发常见来源之一,而分子分型技术有助于预防和控制军团菌。[目的]了解上海市医院人工水环境中嗜肺军团菌的分子流行病学特征,为军团菌病的防控提供科学依据。[方法]于2019—2020年每年5—10月采集上海市14家医院人工水环境中水样,包括8家三甲医院,6家非三甲医院。共采集水样984份,包括312份冷却水、72份冷冻水和600份自来水。对水样进行嗜肺军团菌的分离培养和血清型鉴定并保藏,以嗜肺军团菌检出率作为污染状况指标。对保藏菌株进行复苏,得到81株存活菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型分析。[结果]共检出嗜肺军团菌水样124份,样本检出率12.60%,其中三甲医院检出率(16.54%,87/526)高于非三甲医院(8.08%,37/458)(χ^(2)=15.91,P <0.001)。不同类型水样之间冷却水的检出率(23.40%)最高,检出率的差异具有统计学意义(χ^(2)=61.19,P <0.001)。医院不同场所自来水检出率差异具有统计学意义(χ^(2)=11.37,P <0.05)。2019年的检出率(15.06%,75/498)高于2020年(9.84%,49/498)(χ^(2)=6.23,P <0.05)。5—10月中,8月的年平均检出率(16.46%)最高,10月的年平均检出率(8.54%)最低,不同月份之间检出率的差异无统计学意义(χ^(2)=5.39,P=0.37)。不同区之间的检出率差异具有统计学意义(χ^(2)=24.88,P <0.001)。共分离得到131株嗜肺军团菌,以血清型1型(80.15%,105/131)为主。对复苏存活的81株嗜肺军团菌进行PFGE分型,菌株条带相似性系数为41.30%~100%,分为29种PFGE带型(S1~S29),每种带型包括1~10株菌,S28为优势带型。聚类得到4个聚类簇(Ⅰ~Ⅳ),占所有菌株的66.67%(54/81),包含13个带型。[结论]上海市2019—2020年医院人工水环境中存在嗜肺军团菌持续污染,自来水中污染值得引起重视。检出嗜肺军团菌血清型以1型为主,PFGE分型揭示其存在基因多态性。因此,需加强医院人工水环境中嗜肺军团菌的监测及控制。

摘要：目的研究中国脑膜炎奈瑟菌（Nm）中插入序列IS1301的分布与分子流行病学特征。方法设计IS1301引物，应用PCR方法检测2007年1月至2008年10月收集全国16个省、市、自治区219株Nm菌株的IS1301，对IS1301扩增产物进行DNA测序和序列比对，PCR扩增IS1301阳性菌株进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析及核酸印迹杂交，研究不同Nm菌株中IS1301的分布特征。结果219株Nm菌株中，34株携带IS1301（15．53％），A、B、C群和不可分群的Nm菌株IS1301阳性率分别为11．11％、20．75％、6．17％和28．57％；IS1301扩增产物测序结果与GenBank登记编号Z49092．1的Nm菌株序列相似度为94％～100％，进化树分析可分为两簇；C群Nm菌株与其他血清群菌株IS1301序列存在较大差别；研究的Nm菌株基因组中至少存在6～17个IS1301拷贝，相同PFGE带型Nm菌株所携带的IS1301拷贝数具有多态性特征。结论IS1301在中国Nm菌株中的分布具有遗传多态性。

摘要：目的对2018年北京市西城区不同来源的肠炎沙门菌进行耐药性和同源性分析,为沙门菌感染疾病的鉴定溯源及防控预警提供数据参考。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对19株肠炎沙门菌进行分子分型,并采用微量肉汤稀释法设计的革兰阴性需氧菌药敏检测板进行28种抗菌药物的药敏试验。结果药敏结果显示,19株肠炎沙门菌都对至少1种抗菌药物,对萘啶酸100%耐药,有10株多重耐药菌株。PFGE显示,19株肠炎沙门菌共得到6种PFGE带型,聚类分析可分为3个群,带型相似度60.22%~100%。从一起食物中毒事件患者粪便以及可疑食物中分离的7株菌条带相似性100%。结论肠炎沙门菌多重耐药现象应引起重视,需加强对多重耐药株的监控及抗菌药物使用的监管。不同来源的肠炎沙门菌同源性存在一定的差异,但在同一起食物中毒事件中PFGE分子分型结果一致,为食物中毒流行病学调查和溯源提供了可靠的依据。