摘要：目的介绍测定药物小分子与脱氧核糖核酸相互作用方法的近年进展,为抗肿瘤药物的体外筛选以及新药设计提供参考。方法对9种分析技术在研究药物小分子与DNA相互作用机制的方面的基本原理、研究热点及其应用作了评述。结果小分子与DNA相互作用的模式较为复杂,归纳起来大致可分为非共价结合、共价结合和剪切作用3类。其中,非共价作用有3种方式:静电作用、嵌入作用和沟槽作用结论对于DNA靶向分子/DNA复杂体系的研究,必须综合运用各种方法和手段进行全方位的研究才能得到比较可靠的结论。

摘要：脱氧核糖核酸(DNA)系由脱氧核糖与磷酸及胸腺嘧啶、胞嘧啶(嘧啶类)或腺嘌呤、鸟嘌呤(嘌呤类)4个碱中一个组成核苷酸为结构单位聚合而成高分子。 所有生物细胞内均含有DNA,其司职系作为生命基本设计图的遗传信息,通过蛋白合成指令,与生长和组织分化等相关。核酸现已被誉为继蛋白质、脂质、糖质、矿物质、微生素、食物纤维之后第七营养素。摄入DNA。

摘要：脱氧核糖核酸(DNA)的分子识别特性与功能使其在生物传感与成像领域得到了广泛应用.另一方面,得益于自身独特的光学性质,镧系元素掺杂的上转换纳米颗粒在生物医学应用中备受关注.特别地,二者的有机结合可产生新的性质与功能,在生物传感与成像领域展现出优势,推动了该领域的发展.本文综合评述了基于DNA与上转换纳米颗粒相结合的生物传感与成像技术的研究进展,重点聚焦于相关方法的分类与设计原理,简要概述了相关的应用研究,并对该领域目前存在的挑战与未来的发展前景进行了讨论.

摘要：G-四链体是核酸的一种非经典二级结构,主要出现于富含鸟嘌呤(G)碱基的DNA或RNA序列。生物体内的G-四链体主要形成于端粒区域和某些原癌基因的启动子区域,是生物医学研究的重要对象。以G-四链体作为靶点的抗癌策略虽被多次提出,但目前还未有成功进入临床试验的案例。因此,有关原癌基因启动子区域的G-四链体与配体结合的研究,可以对靶向抗癌药物的设计提供指导性建议。使用分子动力学模拟的方法,研究了不同的异喹啉类生物碱与G-四链体的结合机理。通过考察四种异喹啉配体与G-四链体结合的过程,得到了异喹啉配体与G-四链体稳定结合的构象以及结合的主导因素。此工作从原子分子层面深化了对异喹啉类生物碱和G-四链体结合机理的微观认识,对抗癌药物设计具有指导意义。

摘要：线性时序逻辑模型检测被广泛应用于处理器设计与验证、网络协议验证、安全协议验证等领域.然而到目前为止,该技术只能在电子计算的平台上实现.为了以脱氧核糖核酸(Deoxyribo Nucleic Acid,DNA)为载体对线性时序逻辑(Linear Temporal Logic,LTL)实施模型检测,给出了使用粘贴自动机实现Until算子模型检测的方法.首先,使用粘贴自动机对Until公式的有穷状态自动机(Finite State Automata,FSA)模型进行编码;然后,将系统模型转换为粘贴自动机的输入字符串;最后,用粘贴自动机验证系统是否满足公式.仿真实验结果证实,新方法可实现对LTL逻辑时序算子的检测.

摘要：采用DAEDALUS软件,以***-12MG1655的琥珀酸脱氢酶复合体C亚基编码酶基因sdhC的双链DNA为脚手架链,进行一个边长为17.68nm的正四面锥设计,并最终通过核酸自组装反应获得了sdhC基因的纳米锥聚合体。利用琼脂糖凝胶电泳、扫描电子显微镜和透射电子显微镜对多组样品进行化学组分和形貌分析,同时利用原子力显微镜液下成像法测定了核酸聚合体的三维尺度。结果表明:DAEDALUS软件设计出的16条订书钉链,确实将624bp的sdhC双链DNA中的一条链折叠成了平均边长为19.05nm的正四面锥,与预设模型仅相差1.37nm,证明普通基因的双链DNA可以替代M13mp18单链核酸作为DNA折纸的核酸材料,为构建核酸纳米材料提供了一种新方法。

摘要：针对经典计算的有向图k边导出子图生成算法时间复杂度较高问题,提出了一种在脱氧核糖核酸粘贴机上运行的子图生成算法.首先,以粘贴系统提供的标准生化元操作为算法使用的基本元算子,并使用元操作所产生的生化结果的图论解释作为元算子的最小语义单元;其次,使用包括顺序、循环等在内的程序控制结构,设计一定的逻辑方式把元算子组织起来,以计算有向图导出子图.复杂度分析表明,新算法可在线性时间生成所有子图.仿真实验结果表明,与经典算法相比,新算法在理想条件下大幅降低了子图生成时间.

摘要：目的建立鸭乙型肝炎病毒(DHBV)cccDNA TaqMan荧光定量PCR方法。方法用pUCm-T载体和PCR纯化产物连接,转染TOP10菌,筛选阳性菌落,提取质粒,制作外标准品;在DHBV基因组负链两侧设计一对引物,并在引物间设计和荧光标记一段TaqMan探针,严格优化反应物的组成和扩增条件,建立了DHBV cccDNA TaqMan荧光定量PCR方法。结果最低可检出10~4拷贝/ml;批内误差为0.2%～3.14%,批间误差为2.22%～4.43%;在10~5～10^(12)拷贝/ml之间与C_t值具有很好的线性[Ct=-2.8361 ln(x)+41.45,r=-0.9985]。结论该法是一种灵敏度高、特异性强、较为简便的DHBV cccDNA定量检测技术。

摘要：目的·探讨连接胆固醇的脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)对活细胞膜的修饰作用。方法·以悬浮细胞L1210和贴壁细胞PC-12为研究对象,将每种细胞分为实验组(胆固醇-DNA孵育)和对照组(磷酸盐缓冲液处理)。通过共聚焦显微镜获得2组细胞的荧光强度,并对实验组细胞进行三维重构。采用扫描电子显微镜观察实验组细胞的形态。采用荧光漂白恢复实验检测胆固醇-DNA修饰对细胞膜流动性的影响。结果·悬浮细胞和贴壁细胞获得了一致的结果。与对照组相比,实验组细胞表面的荧光强度有所加强(均P=0.000)。共聚焦显微镜的三维重构显示,实验组细胞的荧光分布在整个细胞表面。扫描电子显微镜结果显示,实验组细胞的形态经胆固醇-DNA修饰后并未改变。经荧光漂白处理后,实验组L1210细胞的相对荧光强度下降至0.090,且在110s内恢复至0.860。结论·胆固醇-DNA能够对整个活细胞膜进行修饰,且修饰后的细胞膜仍具有流动性。该方法不仅能够用于悬浮细胞,还可应用于贴壁细胞。

摘要：由于线粒体DNA(mtDNA)具有进化速度快,群体内变异大,分子结构简单而易于分析等特点,近年来已广泛用于群体遗传学的研究。目前,对人mtDNA的提取都采用新鲜组织。在方法学上国外一般采用氯化铯超速离心法,国内则采用柱层析法、透析法。用上述方法抽提mtDNA的得率本身就较低,加之冰冻组织的线粒体由于冻融损伤。得率更是微乎甚微。本文参考有关文献,设计一种更简易方便的方法,提取mtDNA的得率及纯度都较高,经处理能满足限制酶分析的要求,可用于冰冻组织线粒体DNA的抽提。