摘要：为揭示黄牡丹花色形成过程中类黄酮生物合成相关基因的表达情况,本研究以云南野生黄牡丹为材料,采用Solexa测序技术对不同开放阶段的花瓣总RNA等量混合的样品进行转录组测序,经组装共得到88 330个Unigene,平均长度为603 bp。在此基础上,对“硬蕾期”、“初开期”和“盛开期”的花瓣建立差异表达谱,共获得7 790个表达差异基因。挑选GO功能显著性富集和Pathway显著性富集分析中富集在类黄酮生物合成代谢通路的差异基因Pl-CHS1、Pl-CHI1、Pl-THC2’GT和Pl-5GT1进行qRT-PCR表达模式验证。结果表明,随着花朵的开放和着色,Pl-CHS1的表达量逐渐上升;而Pl-CHI1和Pl-5GT1的表达量迅速降低;与“硬蕾期”相比,Pl-THC2’GT的表达量在“初开期”迅速上升,并且其高水平表达持续保持到花朵盛开。该结果与表达谱分析结果相一致。本研究为深入开展黄牡丹花色形成相关基因的克隆和功能验证提供了丰富的信息,并为揭示牡丹黄色花形成分子机制提供了帮助。