摘要：通过对自建的未开发化合物三维结构库进行药效团检索,得到了4个对HIV-1蛋白酶有抑制活性的化合物,通过构象分析发现包含药效团的构象处于优势构象,而且4个结构都含有带两个邻位羟基的苯环和一个间位羰基的药效团以及公共子结构.通过计算发现它们的疏水参数都很小.在考虑满足包含药效团的结构特征和有适中的疏水参数两个因素的前提下,设计出了新的具有潜在抑制HIV-1蛋白酶活性的化合物.它们的结构都比检索得到的四个化合物更为简单。

摘要：利用Catalyst软件系统,选择具有较高体外抑制活性的苯并二氮类化合物作为训练集,经计算机建模,构象优化,由Catalyst系统构建出药效团模型.并结合γ-分泌酶的作用机制等因素,筛选出一个含有一个芳环中心,一个疏水中心和两个氢键受体的具有较好预测能力(RMS=0.366343,Correl=0.95535,Weight=1.17389,Config=18.8671)的药效团模型.该模型的建立有助于设计及合成新型结构的γ-分泌酶抑制剂.

摘要：趋化因子受体CCR2已被证实可作为许多重要疾病的药物设计靶标,如关节炎、多发性硬化症、动脉粥样硬化、糖尿病和肿瘤等.我们运用基于药效团模型的优势碎片重组策略,设计合成了11个新结构化合物.分子水平的CCR2受体拮抗活性测试显示,具有3-氨基环戊烷甲酰氨甲基酰胺骨架的化合物具有很好的抑制活性(1a,IC50=25 nmol/L).进一步的构效关系研究表明,左侧3-氨基上的取代基以脂肪环和小体积的芳香环为优选.发现了有进一步优化价值的CCR2抑制剂新骨架,初步构效关系研究也为进一步结构优化提供了有益的结构信息.

摘要：中药药效物质基础是中药质量控制和现代化研究的重点和难点,随着药效团虚拟筛选技术在计算机辅助药物设计方面应用的日趋成熟,该技术在中药现代化研究中的应用也成为可能。该文以药效团模型的系统构建方法为基础,对基于药效团技术的中药药效成分辨识方面的应用技术及策略进行系统总结和概述。

摘要：根据一系列表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂的三维定量构效关系研究 ,得到了该类抑制剂的药效团 ,研究结果与Novartis的药效团模型相当类似 .药效团包括一个氢键受体 ,一个氢键给体 ,一个疏水区和一个带有氯或溴原子的苯环 .该药效团对于研究表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂结构与活性的关系具有重要的意义 .

摘要：用表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂的药效团作为提问结构在三维数据库中进行了搜索.从得到的命中结构中挑选了12个化合物用柔性受体模型方法对其活性进行了预测,发现有2个化合物具有一定的预测活性.这2个化合物可能具有酪氨酸激酶抑制剂的活性,可能作为先导化合物进行结构优化.

摘要：丙酮酸激酶M2(PKM2)是肿瘤治疗中最具发展潜力的靶点之一.本文以一系列丙酮酸激酶M2-激动剂复合物的晶体结构为基础,采用基于多复合物的药效团(MCBP)方法产生了PKM2的药效团模型.并使用该药效团模型产生了62个芳基磺酰胺类PKM2激动剂的活性构象和分子叠合,通过三维定量构效关系(3D-QSAR)方法研究了该类PKM2激动剂与PKM2蛋白的相互作用,并建立了相关预测模型.比较分子场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)模型的交互验证相关系数q2分别为0.545和0.653,非交互验证相关系数r2分别为0.966和0.987.本研究为进一步结构优化、设计和合成新型的PKM2激动剂提供了理论依据.

摘要：G蛋白偶联受体(GPCR)是人体内一类重要的药物作用靶标。针对GPCR配体进行了较全面的药效团模拟研究,有效地整合针对GPCR进行药物发现研究的数据,并构建了相应的药效团数据库。收集并构建了GPCR的8个大类17个亚型的不同配体共110个药效团模型,作为GPCR配体药效团数据库的首批数据。通过统计分析发现:87%GPCR配体药效团中含有疏水性基团(Hydrophobic,HY)、66%包含芳香性基团(Ring aromatic,RA)、45%含有正离子基团(Positiveions,PI)。GPCR药效团数据库的建立极大地方便了开发设计新的具有选择性的GPCR配体。

摘要：为构建可靠的整合素αvβ3受体选择性拮抗剂的药效团模型并根据模型设计小分子活性化合物,选择对αvβ3受体具有较高抑制活性(IC50<110nmol·L-1)的4个类型(分别以酰胺、哌嗪、哌啶、γ-戊内酰胺为中间连接基)的30个化合物为训练集,利用Catalyst软件构建整合素αvβ3受体选择性拮抗剂药效团模型,并在数据库中寻找具有活性的母体结构,对母体结构进行修饰和改造及类药性分析得到先导化合物。得到的药效团模型相关系数好、预测能力高,可较准确的预测相关化合物的活性。优化模型含1个芳环中心(RA)、1个可阴离子化部位(NI)和2个疏水作用基(HP),其相关系数与权重值分别为:RMS=0.73,Correl=0.90,Weight=1.17,Config=14.00。所设计的目标化合物预测活性强且结构简单,易于合成,噻唑类为未见报道的一类母体结构化合物。

摘要：中药药效物质基础及作用机制研究一直是中药研究的重点和难点,随着药效团虚拟筛选技术在先导化合物的发现、优化与药物分子设计等方面应用的成熟,该技术在现代中药研究中的应用也逐渐受到关注。本文对药效团技术的研究进展及其在中药有效成分辨识、靶标搜寻、中药对代谢酶作用及中药药性研究中的应用进行了综述,并对目前存在问题、对策及应用前景进行了探讨和展望。