摘要：为了掌握浙江地区猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)流行病学特点和遗传变异情况,应用PCR检测方法,对2018年浙江地区猪场采集的临床疑似病料进行PCV2检测,并对部分阳性病料进行全基因扩增、克隆、序列测定和ORF 2遗传进化树分析。结果显示:329份临床疑似样品中,PCV2阳性率27.4%(90/329),其中宁波地区阳性率最高,为52%;保育猪和肥育猪阳性率最高,分别为38.8%(64/165)和68.8%(11/16)。选取7份病料进行全基因组扩增,每个毒株随机挑选3个或4个阳性克隆进行序列测定,共得到22个毒株进行遗传变异分析。22株病株同源性为93.3%~99.8%,与16个参考毒株同源性为93.5%~99.8%。根据遗传进化树分析,22个毒株分别处于3个分支,其中6株PCV2a,6株PCV2b,10株PCV2d,说明目前浙江地区PCV2d是优势毒株。ORF 2遗传进化树分析显示,ORF 2核苷酸同源性较全基因组核苷酸同源性低,3个分支分别处于PCV2b、PCV2d和PCV2e,预示浙江地区流行毒株可能在向PCV2e转变。本研究掌握了PCV2在浙江地区的流行动态,为浙江省PCV2疫苗株的选择和疫苗研发提供了理论依据。

摘要：旨在建立一种能快速、高效且灵敏的检测出猪流行性腹泻病毒(PEDV)的通用型TaqMan qPCR检测方法,并进一步了解河北省PEDV的遗传变异情况。本研究参考PEDV变异株AJ1102的M基因的保守区域设计特异性引物及探针,对引物浓度、退火温度等条件进行优化,建立了一种应用于猪场筛查PEDV的qPCR方法,并对筛查出的阳性样品S基因扩增测序后进行遗传进化分析。结果显示:该方法的特异性强,与猪圆环病毒2型(PCV2)、猪瘟病毒(CSFV)及传染型胃肠炎病毒(TGEV)等猪病常见病原均无交叉反应;建立的检测方法对pMD19T-PEDV标准品的最低检测下限为1.09×101拷贝·μL^(-1),比普通PCR灵敏约100倍,敏感性高;组内和组间的变异系数均小于1%,重复性良好。基于S全基因成功克隆出的9条序列分布于GⅡ的两个亚群,克隆的9条序列的核苷酸相似性为96.6%~99.1%;氨基酸的相似性为94.6%~98.7%。结果表明:本研究得到的PEDV流行株与近年来国内分离株的关系较为密切,而与中国目前使用的疫苗株以及欧洲株亲缘关系较远,这表明河北部分地区PEDV当前流行毒株比较复杂且有变异的趋势,提示持续检测PEDV流行毒株变异动态的必要性。本研究不仅为PEDV的临床诊断提供了技术支持,更为进一步掌握PEDV遗传进化规律提供了参考依据。

摘要：从临床＂高热综合征＂病例分离到1株猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syn-drome,PRRSV）,经分离培养、血清学鉴定和分子病毒学鉴定,确定为美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒,并命名为DZ0908。设计了针对病毒Nsp2基因和GP5基因的引物,扩增出目的基因。通过序列比对进行遗传变异分析,该分离株Nsp2基因序列中第483位和第535~563位氨基酸存在缺失,GP5相对保守,该毒株属于PRRSV变异株,为该病毒的进一步研究奠定了基础。

摘要：【目的】对H9N2禽流感病毒HA基因全序列进行分析,了解H9N2禽流感分离毒株HA基因的遗传变异情况。【方法】根据GenBank已发表的H9N2毒株的基因序列,设计了2对H9N2禽流感病毒HA基因特异性引物,运用RT-PCR方法对XL、LF和WN分离株进行了扩增,然后将PCR产物送出进行测序,用DNAstar 5.0软件对测序结果进行了分析。【结果】XL、LF和WN 3株H9N2分离株间HA基因的核苷酸同源性为99.7%-99.9%,推导氨基酸的同源性为99.1%-99.6%;分离株与参考毒株HA基因核苷酸的同源性为96.2%-99.0%,推导氨基酸的同源性为96.2%-98.6%。通过对3个H9N2分离株间HA基因核苷酸序列的比较,发现共有5个位点的核苷酸发生突变,其中4个位点核苷酸的改变导致相应的氨基酸发生突变。HA蛋白的7个受体结合位点比较保守,但是其在551-553位缺失了潜在的糖基化位点。【结论】3株H9N2分离株裂解位点氨基酸序列完全符合低致病性禽流感的特征RSSR↓G,但是LF裂解位点附近333位脯氨酸（Pro）突变为组氨酸（His）,即非极性氨基酸向极性带正电氨基酸（碱性氨基酸）转变,裂解位点的变化可能是H9N2禽流感病毒生物学特性改变的分子基础。

摘要：目的从内蒙古自治区某猪场疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)病料中分离PRRSV,进行毒株的遗传变异情况及分子生物学特征分析。方法从PRRS疑似病料中用Marc145细胞分离PRRSV,设计引物,PCR扩增其全基因序列并利用MEGAFO进行遗传进化分析。结果成功分离到一株PRRSV,该毒株可在Marc145细胞上增殖并产生细胞病变,免疫荧光检测到特异性荧光,将其命名为NM-12株。全基因序列及Nsp2核苷酸序列分析表明,该毒株属于美洲型,与***及GX1003等毒株处于同一分支。Nsp2氨基酸序列分析显示,该分离株具有与高致病性PRRSV一致的30个氨基酸缺失。ORF5基因序列分析显示,NM12与JXA1亲缘关系较近,但处于不同的分支。结论成功分离到1株PRRSV,属于美洲型,可为分析内蒙古自治区PRRSV遗传进化趋势及防控提供理论参考。

摘要：为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)贵州株GZ-R的遗传变异情况及其NSP2基因的特征,本试验基于NSP2基因设计了2对特异性引物对目的基因进行巢式RT-PCR、克隆和序列分析。结果显示,第二轮巢式PCR除扩增出约3000 bp的预期条带外,还扩增出另一条约1200 bp的条带;将两DNA片段克隆至pMD19-T载体后经测序得到两条片段,大片段长2980 bp,命名为GZR-NSP2-L;小片段长1131 bp,命名为,GZR-NSP2-S;两片段同源性比对发现,GZR-NSP2-S具有GZR-NSP2-L N端第1-945位核苷酸与C端第2795-2980位核苷酸,缺失GZR-NSP2-L第946-2794位之间的核苷酸;GZR-NSP2-L与VR-2332株、Lelystad virus株的核苷酸同源性分别为81.2%、48.6%;编码氨基酸同源性比对结果与核苷酸同源性结果一致,揭示PRRSV GZ-R株属于美洲型毒株;氨基酸缺失位点比对发现,GZ-R NSP2在其第481位、第533-561位存在30个不连续氨基酸的缺失,缺失位点与PRRSV高致病性毒株一致。综上所述,可鉴定PRRSV GZ-R株为美洲型高致病性毒株。试验结果可为进一步探索PRRSV在贵州省的流行趋势以及NSP2在PRRSV复制过程中的作用机制提供一定的参考。

摘要：参考Genbank发表的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332的ORF5基因序列,设计 并合成了一对引物,对来自福建、浙江、山东等地的PRRSV分离毒株进行RT-PCR扩增,获得约748 bp的 DNA片断,将其分别克隆入pMD18-T载体中,并进行测序。应用DNAStar软件分析所测序列,并与ATCC VR-2332、CH-1a、MLV、LV等毒株的ORF5序列进行比较,结果表明:SHD1与FJ14、MLV、ATCCVR-2332 同源性高达98．5％,与CH-1a同源性为91．0％,与其它毒株同源性为86．6％-88．4%;FJ14与MLV、ATCC VR- 2332同源性为99．3％-99．7％,其余分离毒株在遗传关系上和CH-1a又分为明显的两个群,显示近年来各地 PRRSV分离毒株与CH-1a株的遗传差异越来越大。

摘要：为了快速、高效、准确地检出猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),并进一步了解河北部分地区的流行毒株遗传变异情况,本研究根据PRRSV经典、高致病性和NADC30代表毒株ORF5基因保守序列设计特异性引物和探针,建立了一种通用型TaqMan qPCR检测方法以实现对猪场的全面筛查,并对筛查出的阳性样品ORF5基因扩增测序后进行遗传进化分析。结果显示:该方法与PRV、PCV2、PEDV、CSFV、TGEV、RV均无交叉反应,特异性强;对重组质粒pMD19T-PRRSV标准品的最低检测下限为2.19×10^(1)拷贝/μL,敏感性高;组内和组间变异系数均小于1%,重复性好;在临床样品检测中较普通PCR有更高的检出率;扩增出的5株PRRSV流行毒株均为美洲型毒株,5株PRRSV流行毒株之间核苷酸序列同源性为82.9%~99.8%,氨基酸序列同源性为82.1%~99.0%;氨基酸序列与国内外已报道的代表株相比在GP5抗原表位及高变区分别存在着不同的差异。结果表明:河北部分地区当前流行毒株复杂多样,优势毒株正从高致病性毒株逐步向NADC30类毒株过渡,提示持续监测PRRSV流行毒株变异动态的必要性,为PRRSV的防控、临床诊断及掌握遗传变异规律提供依据。

摘要：本试验选用黑龙江省17个水稻品种,采用随机区组试验设计法,进行了变异系数、方差分析、主成分分析。结果表明:品种植株高、稻穗长,但产量较低;倒二叶、倒三叶长而宽有利于提高产量,但结实率偏低;对产量贡献率从大到小顺序为穗长、倒三叶长、剑叶长、穴穗数。

摘要：本试验根据已发表的新城疫病毒(NDV)的F基因序列设计特异性引物,对山东地区两株NDV流行株的F基因进行了克隆与序列分析,分别扩增到了A株和B株F蛋白编码区全基因,ORF全长均为1662bp。应用分子生物学软件对A株和B株的核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行了分析。两毒株核苷酸序列同源率为87%,都编码553个氨基酸,氨基酸同源率为91%。与部分已发表的毒株相比:A株与～株同源率最高,为98%,B株与JS鹅株同源率最高,为98%。抗原位点、糖基化位点的数量和位置高度保守,半胱氨酸残基数量不同,A株13个,B株12个。分离株都具有3个强疏水区。A株、B株裂解区氨基酸序列符合强毒株特点,二者均为强毒株。从基因分型情况看,A株属于基因Ⅸ,B株属于基因Ⅶ。A株与F48E9株遗传距离最近,B株与JS鹅株遗传距离最近。