摘要：利用微卫星标记对2012年3月和6月分别构建的两批共17个合浦珠母贝（Pinctada fucata）选育基础群体进行了遗传多样性分析.6对微卫星引物在17个群体共680个个体中检测到29个等位基因,每个位点的等位基因数在2～7之间,平均有效等位基因数在2.06 ～ 3.07之间,平均观测杂合度在0.31 ～0.58之间,平均期望杂合度在0.46～0.65之间,平均多态信息含量在0.39～0.58之间,高度多态（PIC≥0.50）群体有11个（占64.7％）.Hardy-Weinberg平衡检验（卡方检验）的结果显示,在检测得到的102个数据结果中,有53个（占52.0％）极显著地偏离了Hardy-Weinberg遗传平衡（P＜0.01）.从遗传偏离指数（D）的结果可以看出,17个群体在不同的微卫星位点存在不同程度的杂合子缺失现象.本研究表明,两批群体的遗传多样性参数非常接近,每个群体的遗传多样性都较高,对群体之间的遗传距离和遗传分化格局有了初步的把握,为下一步交配设计构建下一代核心群体奠定了理论基础.

摘要：枸杞是茄科枸杞属的重要经济植物,广泛分布于我国西北地区,环境适应性强。本研究分析了枸杞基因组中SSR的分布特征,并基于宁杞1号全长转录组开发SSR分子标记,对28个枸杞种质进行遗传多样性分析和亲缘关系分析。用MISA软件搜索全长转录组中SSR位点,设计并筛选多态性好的SSR引物,对206对引物经过毛细管电泳筛选后最终选出23对引物对28个不同分布区的枸杞种质进行遗传多样性分析,遗传相似系数用非加权组平均法(UPGMA)聚类。23对引物共扩增得到240个等位基因,每个位点的等位基因数范围为4~17,Shannon信息指数范围为1.177~2.487,期望杂合度和观测杂合度的范围分别为0.635~0.909和0.250~0.964,PIC的范围是0.580~0.902。遗传距离聚类分析显示28份枸杞种质在遗传相似系数为0.71时被分为4类,宁夏枸杞为Ⅰ类,中国枸杞为Ⅱ类,黑果枸杞为Ⅲ类,Ⅳ类中只有中国枸杞种的枸杞岛种质。利用全长转录组序列可以高质量实现枸杞SSR标记开发,新开发的23对引物后续可用于枸杞种质遗传多样性分析和分子标记辅助育种工作。

摘要：【目的】白皮松作为我国濒危的乡土树种,具有重要的经济和园林观赏价值,为进一步开发和利用白皮松种质资源,本研究基于EST-SSR标记对北京地区3个不同种源地的白皮松群体遗传多样性开展评价。【方法】以白皮松转录组数据为依据,对其微卫星位点进行筛选并设计合成了96对引物,并对北京温泉苗圃栽培收集的3个不同种源地(北京、山东、山西)的白皮松群体,共60个植株开展遗传多样性分析,对其群体内与群体间的遗传结构进行评价。【结果】96对引物中共筛选获得了5对多态性引物,其观察杂合度、期望杂合度、多态性信息含量和等位基因位点个数变化范围分别为0.203~0.433、0.211~0.530、0.187~0.484和2~5。3个白皮松样本群体中等位基因数量、有效等位基因数量、香农信息指数、观察杂合度和固定指数变化范围为2.400~3.000、1.516~1.761、0.484~0.606、0.295~0.362和−0.075~0.081,平均值分别为2.677、1.632、0.560、0.333和−0.007。遗传分化系数和基因流变化范围分别为0.0216~0.1153和1.3996~11.3400,平均值分别为0.0902和2.5212。AMOVA分析显示遗传变异主要来自于群体内,群体间差异较小,仅占据11%。【结论】本研究共获得了5对多态性的白皮松EST-SSR引物,可用于后续白皮松群体遗传多样性分析和分子标记辅助育种工作;北京温泉苗圃栽培收集的3个不同种源地的白皮松群体分析结果表明,当地现有收集的白皮松种源群体遗传相似度较高,在未来种质资源保存和苗木繁育工作中应考虑增加其他种源地的白皮松群体。