摘要：近年来昆明市禄劝县的甜樱桃(***(Lindl.)***)癌肿病普遍发生,并日趋严重,极大地影响其产量和质量。该文对昆明市禄劝县的甜樱桃进行普查和专题调查,并从樱桃癌肿病发病树体取样,通过对发病部位镜检、病原菌分离纯化、革兰氏染色反应及16s rdna分子鉴定,结果表明:对樱桃枝条上的幼嫩瘿瘤分离纯化出的6株细菌16s rdna序列在NCBI上进行BLAsT比对,与致瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)的同源性达到99%,由此确定昆明市禄劝县樱桃癌肿病的病原种类,为昆明市禄劝县樱桃的合理种植与病害的治理提供了科学合理的依据。

摘要：从鸡腹泻病例中分离到一株M1菌,为探明其生物学特性,利用传统细菌鉴定与16s rdna、atpD基因序列分析进行鉴定与遗传进化分析。将M1菌纯化培养后进行菌落形态观察、生理生化试验;设计16s rdna和atpD基因引物,反转录收集PCR产物并测序,利用DNAstar和MEGA6进行同源性比对分析,并构建系统进化树。结果得出:M1菌在镜下为革兰氏阴性短杆菌或球菌;生理生化试验显示其可发酵多种糖类,产酸产气,运动性试验呈阳性;吲哚(I)、甲基红(M)和触酶试验呈阳性;VP(V)试验、枸橼酸盐(C)利用试验、产硫化氢(H2s)试验和尿素酶试验呈阴性。16s rdna与atpD基因同源性分析表明M1菌与大肠杆菌的同源率在99%以上。综合细菌鉴定、生理生化结果、16s rdna和atpD基因序列分析,判定M1菌株为大肠杆菌种。

摘要：[目的]探讨脾虚型溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)患者的肠道菌群特征。[方法]收集2019年1月1日至2019年3月31日于浙江中医药大学附属第二医院、浙江省中医院、浙江省人民医院以及浙江大学附属第二医院门诊及住院的14例脾虚型UC患者、16例其他证型UC患者的粪便样本,同时收集同时间段至浙江中医药大学附属第二医院体检的8例健康者的粪便样本,提取三组粪便样本中菌群DNA,根据16s V3~V4区设计引物进行扩增,通过Illumina Miseq平台进行测序,以生物信息分析软件对测序结果进行分析,比较三组样本菌群组成和结构,分析脾虚型UC患者的肠道菌群特征。[结果]门分类水平上其他证型UC组中变形杆菌门的相对丰度显著高于健康人群组(P<0.01)。属分类水平上,脾虚型UC组和其他证型UC组中分枝杆菌属、包西氏菌属、丁酸单胞菌属的相对丰度显著低于健康人群组(P<0.05),而埃希氏菌属/志贺氏菌属、假单胞菌属的相对丰度明显高于健康人群组(P<0.05)。此外,代尔夫特菌属的相对丰度在脾虚型UC组中明显低于其他证型UC组和健康人群组(P<0.05)。[结论]脾虚型UC患者的肠道菌群特征与其他证型UC患者及健康人群相比存在一定的差异,代尔夫特菌属明显减少可能是脾虚型UC患者肠道菌群的特征性变化。

摘要：目的筛选出能够快速准确鉴定金黄色葡萄球菌的方法。方法利用国家标准法、VITEK 2 Compact生化鉴定、16s rdna序列分析和PCR鉴定等4种方法对酱卤肉制品中分离出的典型菌落进行鉴定。结果国家标准法检测结果显示菌株为革兰氏阳性菌,血平板上有明显的透明溶血圈且血浆凝固酶试验结果为阳性,符合金黄色葡萄球菌判定标准。VITEK 2 Compact生化鉴定结果中不吻合的典型生化谱仅有1项(dMAL),判定菌株为金黄色葡萄球菌(98%概率),为极好的鉴定。16srdna序列比对分析及以邻接法构建的进化树均显示典型菌落为金黄色葡萄球菌。以耐热核酸酶基因(nuc)设计的引物能扩增出单一的清晰条带,能快速准确的识别出金黄色葡萄球菌。结论 4种方法均能准确鉴定出金黄色葡萄球菌,但耗时都比较长,通过改进实验方法,缩短DNA提取时间, PCR鉴定将表现出较大优势。

摘要：通过对大庆油田某采油场地的含油污泥进行富集、筛选,分离出1株高效石油降解菌,命名为sY-3,并对其进行16s rdna分子鉴定。以中石化金陵公司浮选含油污泥为处理对象,探究pH值、NaCl含量、接菌量等对浮选油泥中的石油烃降解效果的影响,构建了sY-3菌生长动力学与浮选油泥中的石油烃降解动力学本构模型。结果表明:菌株属于副球菌属(Paracoccus sP.),在25~30℃接菌量为3%的基础上,相较于NaCl含量,pH值对sY-3降解石油烃影响更大,当调节pH值为7、NaCl含量为1%时,sY-3在以石油烃提取液为唯一碳源的无机盐培养基中的生长模式符合Logistic生长模型,其中菌株生长环境承载量K为1.206,菌株生长平均速率r为0.12,无量纲参数a为4.78。sY-3可在30 d内将石油烃含量为5 g·kg-1降解至0.9 g·kg-1,降解了4.1 g·kg-1,降解率达82%。sY-3对短链烷烃(C10~C28)的降解率为88%、半衰期为9.9 d,对长链烷烃(C30~C40)的降解率为72%、半衰期为17.3 d,且对短链烷烃(C10~C28)降解速率是长链烷烃(C30~C40)的1.75倍。相较于长链烷烃,短链烷烃更易被sY-3菌生物降解。当石油烃初始含量小于34.47 g·kg-1时,其降解动力学符合生物处理经典方程Monod方程的线性简化形式,半饱和常数Ks=1.24 g·kg-1,最大反应速率Vmax=3.24 g·(kg·d)-1。