摘要：探讨扎那米韦类衍生物对禽流感病毒神经氨酸酶(NA)的抑制作用,为新的NA抑制剂的研发和设计提供有用的结构信息,进而对流感病毒的新药研发产生一定的积极意义.首先,选取22个扎那米韦类的合成化合物为配体,与PdB(protein data bank)数据库中下载的3BEQ受体蛋白进行对接.然后,采用CoMFA和CoMSIA方法建立3d-qsar预测模型,其中,CoMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数q^(2)分别为0.599和0.592,非交互验证相关系数R^(2)分别为0.999和0.775,这一结果表明2种模型都具有良好的预测能力.最后,根据对接结果和3d-qsar模型的预测分析,设计得到2种对禽流感病毒抑制活性更高的分子.

摘要：As a group of diversified frameworks, quinazolin derivatives displayed a broad field of biological functions, especially as anticancer. To investigate the quantitative structure-activity relationship, 3d-qsar models were generated with 24 quinazolin scaffold molecules. The experimental and predicted pIC50 values for both training and test set compounds showed good correlation, which proved the robustness and reliability of the generated qsar models. The most effective CoMFA and CoMSIA were obtained with correlation coefficient2ncv r of 1.00 （both） and leave-one-out coefficient q2 of 0.61 and 0.59, respectively. The predictive abilities of CoMFA and CoMSIA were quite good with the predictive correlation coefficients （2pred r ） of 0.97 and 0.91. In addition, the statis-tic results of CoMFA and CoMSIA were used to design new quinazolin molecules.

摘要：The Aurora proteins are critical regulators of major mitotic events and attractive targets for anticancer therapy. 3d-qsar studies based on molecular docking were performed on a dataset of 40 4-aminoquinazolines compounds. The CoMSIA model produced significantly better results than CoMFA model, with q2=0.652 and r2=0.991. The contours analysis provides useful information about the structural requirements for 4-aminoquinazolines for inhib- iting Aurora B. Scaffold hopping method was used to generate new structures based on the maximum common sub- structure of the training and test set compounds. The AdMET property, binding affinity and inhibitory activity of the new designed compounds were predicted, respectively. Finally 16 compounds were identified as the novel in- hibitors for Aurora B kinase.

摘要：吲哚喹唑啉衍生物是近年来发现的一类具有良好抗癌活性的化合物．作者在最近报道的二维定量构效关系(2d-qsar)的基础上,采用比较分子力场方法(CoMFA)进一步对该系列化合物进行三维定量构效关系(3d- qsar)研究,建立了3d-qsar的CoMFA模型,其非交叉验证相关系数r2=0．986,标准偏差Sd=0．084,统计方差比F=114．6,交叉验证相关系数q2=0．695,表明该模型合理、可信,并具有良好的预测能力．研究结果表明:(1)取代基R1的部位上静电效应起主要作用,并且确保取代基R1的第一个原子具有较大的净正电荷,对提高化合物的抗癌活性十分重要．这与2d-qsar研究结果相一致．(2)取代基R2的部位上立体效应起主要作用,R2的体积大小要适中．应用这些规律进行了分子设计,在理论上获得了一些具有较高抗癌活性的新的吲哚喹唑啉衍生物,并期待实验证实．该qsar的研究结果可为实验工作者合成新药提供理论参考．

摘要：利用VolSurf参数和比较分子场分析(CoMFA)方法对N,N-二取代三氟-3-氨基-2-丙醇衍生物类胆固醇酯转运蛋白抑制剂进行了三维定量构效关系(3d-qsar)模型研究,均得到较好的结果,训练集模型具有良好的预测能力.VolSurf参数分析表明抑制活性高的分子必须具有合适的亲水性、多的氢键给体和少的氢键受体;在一定范围内,分子量大、表面光滑且非球性高的分子抑制活性高;高疏水性以及质量中心与疏水区中心的高不平衡性对活性是不利因素.CoMFA结果表明,立体作用对活性的影响较静电作用稍强,N-苯基取代基苯氧基的间位体积大且正电性强的基团对活性有利,N-苄基取代基的间位体积大且合适的电负性对活性有利,而苄基的对位立体位阻的增加则对活性不利.VolSurf参数提供了分子整体性质信息,CoMFA提供了取代基信息,两者互为补充,对该类抑制剂新化合物的设计具有指导意义.

摘要：对一组抑制肥大细胞脱颗粒的异喹啉类化合物的活性及毒性进行了3d-qsar研究,采用距离比较法(dISCO)得到了它们的药效团模型,通过选择不同的叠合方式,建立了相关性很好的比较分子力场分析(CoMFA)模型,其交叉验证参数Rcv2分别为0.654和0.662,非交叉验证的相关系数分别为0.990与0.983,通过查阅统计量F表,表明活性及毒性模型的置信度都大于99%,显示模型具有较强的预测能力.并在此基础上进行了新活性先导化合物的设计,得到了预测活性高以及预测毒性低的新结构,合成实验正在进行之中.

摘要：结合α1 受体拮抗剂的构效关系和我们应用计算机辅助药物设计方法所构建的药效团模型 ,设计合成了一系列N 取代 3 吲哚乙酰胺类化合物 ,并评价其α1 受体拮抗作用 .初步生物活性测试表明 ,所合成的目标化合物多数具有较好的α1 受体拮抗活性 .并应用SOMFA方法进行分子结构特征和α1 受体生物活性之间的关系研究 .

摘要：结合α1 受体拮抗剂的构效关系和我们应用计算机辅助药物设计方法所构建的药效团模型 ,设计合成了 17个 1 ( 5 甲基 2 苯并唑甲基 ) 4 ( 2 取代芳氧乙基 )哌嗪类化合物 ,其结构均经1HNMR ,IR及MS (HRMS)确证 .初步生物活性测试表明 ,所合成的目标化合物多数具有较好的α1 受体拮抗活性 .3d qsar研究为该类化合物的结构改造提供了理论依据 .

摘要：PI3K/Akt/mTOR信号通路在癌细胞的生长和增殖中异常激活,对PI3K和mTOR位点的抑制可有效阻断信号通路的传导,是药物设计的理想靶点.本文选择38个嘧啶类小分子抑制剂进行3d-qsar和分子对接研究.采用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法,建立了三维定量构效关系模型,结果表明,该模型具有良好的稳定性和预测能力,可运用分子对接研究小分子抑制剂与PI3K和mTOR蛋白受体的作用模式.通过对qsar模型的三维等势图以及受体与配体的相互作用模式分析后,优化出10个小分子化合物并预测其活性,发现一些小分子化合物活性提高,这为PI3K/mTOR双重抑制剂的设计筛选提供了借鉴.

摘要：细胞周期蛋白依赖性激酶1的异常表达会导致G2期的停滞及多种肿瘤的发生,故CdK1近年来已成为一个理想的治疗靶点.本文以细胞分裂调控蛋白2的同源体为模板,同源模建了CdK1的结构,并与靛玉红类小分子抑制剂进行分子对接.分别运用三种叠合方法进行分子叠合,并在此基础上采用Sybyl 7.1中的比较分子场分析(CoMFA)模块及discovery Studio 3.0中的三维定量构效关系(3d-qsar)模块(以下简称为dS)分别建立了3d-qsar模型.其中,将分子对接叠合与公共骨架叠合联合运用的叠合方法所得3d-qsar模型的评价参数是最佳的(CoMFA:q2=0.681,r2=0.909,r2pred.=0.836;dS:q2=0.579,r2=0.971,r2pred.=0.795,其中q2为交叉验证系数,r2为非交叉验证系数).本文的研究结果在对靛玉红类小分子进行结构修饰设计出新的CdK1抑制剂方面,可提供重要的理论基础.