摘要：[目的]开发雪胆属表达序列标签简单重复序列(ssr)分子标记。[方法]对雪胆属肉花雪胆和母猪雪胆2个种进行转录组测序,检测ssr位点并设计引物,通过PCR扩增和毛细管电泳检验引物的有效性和多态性,并分析种间和种内遗传多样性。[结果]从200对引物中筛选出6对具有高多态性的引物,每对引物检测到的等位基因数5~8个,平均值6.3333个。有效等位基因(Ne)为2.4807~4.9828个,平均值3.7608个。多态信息含量(PIC)为0.5495~0.7583,平均值0.6729。遗传多样性分析显示,种间和种内居群均存在明显的遗传分化。[结论]该研究开发的est-ssr引物具有丰富的多态性,为雪胆属植物的遗传多样性研究提供参考依据。

摘要：为了开发菊苣(Cichorium intybus)简单重复序列(Simple sequence repeat,ssr)分子标记,采用菊苣表达序列标签(Expressed sequence tags,est)序列设计est-ssr引物,并验证引物的有效性和通用性。结果表明:菊苣est序列中共搜索到648个ssr位点,146种重复基序,ssr出现频率为1.61%;三核苷酸重复类型最多(46.45%),TC/GA基序出现频率最高(14.35%);152对est-ssr引物在菊苣中的有效扩增率和多态率分别为78.29%和57.24%。其中37对引物在31份莴苣亚族(Lactucinae Less.)材料中的扩增转移率为86.05%,遗传多样性分析显示不同种间存在明显的遗传分化,聚类结果与材料的地理来源有较高相关性。综上所述,基于菊苣est序列开发的ssr引物可用于菊苣及其近缘属种遗传多样性分析及种间鉴定,为菊苣族(Lactuceae Cass.)种质资源评价、系统进化研究及分子标记辅助育种奠定了重要基础。

摘要：用单因素法研究马尾松est-ssr PCR体系中各成分及退火温度对扩增结果的影响。结果显示优化后的反应体系为:2μL 10×Buffer(Mg2+Free),30 ng模板DNA,0.187 5 mmol/L-1 dNTPs,3.75 mmol·L-1 Mg2+,8 pmol引物,1.0 U Taq DNA聚合酶,加水至20μL。退火温度为56℃。并用21个马尾松DNA检验这一优化体系。检测试验表明,优化后的est-ssr PCR反应体系稳定、可靠、可重复性强。