摘要：膜蛋白g蛋白偶联受体(gPR)109b因无晶体结构而难以了解其活性位点及其与化合物药物的作用机制,我们利用同源模建方法构建gPR 109b的三维结构,用分子动力学等方法进行优化,采用Profile-3D和拉氏图评估后得到最优蛋白质模型。在此结构上利用寻找蛋白中可能的结合位点,利用分子对接方法将3-硝基-4-氨基苯甲酸类药物分子进行对接至gPR 109b蛋白的各个活性位点,根据对接数据和结构图分析可知,蛋白的部分活性位点是潜在药物靶点位置,3-硝基-4-氨基苯甲酸类药物与蛋白的半胱氨酸,缬氨酸,苯丙氨酸,异亮氨酸,脯氨酸等氨基酸有直接作用,能够形成分子间氢键。根据3-硝基-4-氨基苯甲酸类基本结构和蛋白作用活性靶点氨基酸,进一步修饰药物分子,设计新的此类药物衍生物。本实验对治疗心脑血疾病和由烟酸降脂引起的持续低压药物的设计有一定的理论指导作用和应用价值。

摘要：5-N,N-二取代5-氨基吡唑-3-羧酸、3-硝基-4-氨基苯甲酸和6-氨基烟酸类化合物是g蛋白偶联受体109b(gPR109b)潜在生物活性药物。本实验采用比较分子力场分析法(Co MFA)和比较分子相似性指数分析法(Co MSIA)分别建立46个gPR109b激动剂分子的3D-QSAR模型,确定此类g蛋白偶联受体激动剂的分子结构与生物活性之间的定量关系。Co MFA模型的训练集抽一法交叉验证系数q^2=0.472,非交叉验证系数r^2=0.92,标准偏差SE=0.212;CoMSIA模型的训练集抽一法交叉验证系数q^2=0.498,非交叉验证系数r^2=0.803,标准偏差SE=0.332。两个3D-QSAR模型预测数值与实验数据基本一致,显示模型具有较好的预测能力。本实验根据CoMFA和CoMSIA模型所提供的立体场、静电场、氢键给体场等信息进一步提出改善此类激动剂生物活性的药物设计思路。